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Heatmap: Cluster_19 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.41 0.13 -0.14 0.33 0.57 0.85 -0.21 -0.88 -0.25 -0.31 -0.85 -0.98
1.39 0.47 -0.0 -0.1 0.68 0.63 -0.52 -0.85 -0.75 -1.24 -1.28 -2.12
1.07 0.53 0.11 0.11 0.11 0.2 -0.37 -0.35 -0.33 -0.5 -0.78 -1.2
0.52 0.07 -0.08 0.32 0.55 0.71 -0.2 -0.61 -0.45 -0.56 -0.55 -0.72
0.32 0.06 0.01 0.1 0.27 0.4 -0.23 -0.27 -0.22 -0.2 -0.11 -0.37
0.75 0.07 -0.35 0.1 0.47 0.72 -0.08 -0.7 -0.21 -0.41 -0.65 -0.84
0.98 0.11 -0.88 -0.31 0.92 1.1 0.16 -1.2 -0.68 -1.19 -1.16 -1.01
1.11 0.5 0.02 0.17 0.48 0.74 -0.85 -1.52 -0.8 -0.67 -0.73 -0.97
1.06 0.42 -0.05 -0.13 0.13 0.46 -0.23 -0.39 -0.45 -0.47 -0.64 -0.93
0.49 0.28 -0.03 0.24 0.45 0.72 -0.06 -0.61 -0.33 -0.32 -0.87 -1.16
0.83 0.31 -0.11 0.29 0.34 0.72 -0.43 -1.2 -0.44 -0.32 -0.65 -0.84
0.81 0.45 -0.06 0.14 0.26 0.56 -0.24 -0.55 -0.29 -0.49 -0.79 -0.95
0.28 0.05 -0.19 0.13 0.2 0.47 -0.13 -0.27 0.0 -0.06 -0.29 -0.47
0.63 0.16 -0.32 -0.41 0.45 0.79 0.03 -0.45 -0.27 -0.37 -0.44 -0.78
0.72 0.11 -0.19 0.42 0.73 0.86 0.17 -0.46 -0.97 -1.24 -1.54 -1.14
0.34 0.24 -0.21 0.15 0.21 0.53 -0.07 -0.54 -0.12 -0.11 -0.4 -0.44
1.32 0.53 0.05 0.02 0.3 0.33 -0.31 -0.78 -0.58 -0.68 -1.19 -1.29
1.18 0.41 -0.21 0.05 0.17 0.42 -0.47 -0.88 -0.35 -0.32 -0.57 -0.93
1.4 0.59 -0.18 0.08 0.3 0.6 -0.56 -1.49 -0.71 -0.71 -1.03 -1.25
0.5 0.29 0.19 0.13 0.59 0.71 -0.39 -0.76 -0.6 -0.48 -0.42 -0.97
0.88 0.24 -0.0 0.27 0.42 0.39 -0.26 -0.55 -0.35 -0.72 -0.77 -0.67
1.07 0.37 -0.45 0.2 0.5 0.87 -0.13 -1.31 -0.55 -0.73 -1.11 -1.22
0.18 0.05 -0.18 0.24 0.23 0.42 -0.12 -0.27 0.06 0.01 -0.41 -0.51
0.67 0.3 0.02 0.19 0.06 0.26 -0.24 -0.31 -0.14 -0.24 -0.48 -0.61
0.62 0.21 -0.04 0.51 0.43 0.51 -0.23 -0.64 -0.16 -0.36 -0.87 -1.28
0.77 0.47 -0.07 0.16 0.67 0.94 -0.13 -0.67 -0.72 -1.01 -1.37 -1.76
0.82 0.23 -0.19 0.41 0.35 0.45 -0.4 -0.7 -0.23 -0.34 -0.73 -0.74
1.39 0.47 -0.33 -0.03 0.44 0.81 0.17 -0.69 -1.12 -1.41 -1.72 -2.21
0.6 0.25 -0.09 0.13 0.34 0.65 -0.18 -0.78 -0.46 -0.27 -0.49 -0.52
0.34 0.03 -0.24 0.34 0.67 0.96 -0.03 -1.21 -0.51 -0.46 -0.57 -0.87
1.12 0.51 -0.09 0.31 0.66 1.04 -0.28 -1.69 -1.19 -1.21 -1.72 -1.89
0.82 0.14 -0.35 0.38 0.52 0.67 -0.11 -0.58 -0.18 -0.48 -1.1 -1.47
0.65 0.13 0.15 0.29 0.6 0.58 -0.44 -0.52 -0.43 -0.64 -0.61 -0.95
0.84 0.24 0.17 0.11 0.47 0.58 -0.5 -0.77 -0.68 -0.63 -0.37 -0.7
0.52 -0.26 0.11 0.23 0.59 0.82 -0.25 -0.72 -0.5 -0.44 -0.28 -1.06
0.74 0.19 -0.18 0.11 0.6 0.85 0.07 -0.53 -0.51 -0.63 -1.01 -1.62
1.55 0.64 0.03 0.1 0.23 0.48 -0.38 -1.19 -0.9 -1.23 -1.51 -1.57
1.29 0.63 0.42 0.33 0.71 0.57 -0.88 -2.36 -1.4 -1.14 -1.19 -1.8
0.77 0.21 -0.11 0.08 0.48 0.77 -0.27 -0.69 -0.35 -0.54 -0.63 -1.05
0.31 -0.08 -0.11 0.06 0.32 0.54 -0.18 -0.26 -0.28 -0.21 -0.07 -0.35
0.82 -0.01 -0.74 -0.4 0.33 0.87 0.36 -0.29 -0.51 -0.55 -0.55 -0.66
1.08 0.52 0.03 0.39 0.38 0.6 -0.39 -1.29 -0.54 -0.68 -1.09 -1.49
1.16 0.3 -0.39 -0.35 0.52 0.66 -0.08 -0.34 -0.26 -0.72 -1.03 -1.74
0.59 0.16 -0.26 -0.11 0.27 0.62 -0.11 -0.46 -0.24 -0.06 -0.29 -0.74
1.67 0.84 0.11 0.42 0.48 1.0 -0.46 -3.31 -2.83 -3.05 -3.57 -4.36
0.59 0.15 0.11 0.19 0.31 0.41 -0.36 -0.53 -0.35 -0.35 -0.35 -0.37
1.37 0.59 -0.04 0.17 0.92 1.33 -0.27 -2.42 -2.44 -2.97 -3.81 -5.15
1.05 0.47 0.01 0.43 0.48 0.7 -0.55 -2.05 -0.84 -0.68 -0.9 -0.96
0.91 0.04 0.08 -0.08 0.8 0.94 -0.11 -0.56 -1.02 -1.34 -0.64 -1.78
0.8 0.27 -0.06 0.2 0.53 0.89 -0.11 -0.97 -0.64 -0.69 -1.05 -1.14
0.98 0.48 -0.13 -0.52 0.33 0.6 -0.38 -0.31 -0.29 -0.61 -0.58 -0.96
1.41 0.59 -0.05 0.25 0.38 0.79 -0.06 -0.89 -1.18 -1.74 -2.25 -2.3
0.59 0.44 0.13 0.2 0.35 0.45 0.03 -0.21 -0.34 -0.66 -0.75 -1.55
0.73 0.31 0.03 0.34 0.34 0.47 -0.23 -0.5 -0.34 -0.53 -0.78 -0.89
0.63 0.03 -0.39 0.34 0.75 1.15 -0.12 -1.32 -0.5 -0.48 -1.23 -1.56
0.7 0.25 0.03 0.31 0.42 0.67 -0.29 -0.73 -0.3 -0.39 -0.81 -1.21
1.97 0.84 -0.28 -0.76 -0.13 0.88 0.09 -1.48 -2.32 -2.53 -2.62 -2.82
1.36 0.72 0.15 0.09 0.42 0.64 -0.66 -1.45 -1.04 -1.03 -1.17 -1.8
0.57 -0.3 -0.65 -0.06 0.95 1.11 0.25 -0.43 -0.68 -1.1 -1.12 -0.88
0.76 0.23 -0.24 0.22 0.37 0.76 -0.14 -0.91 -0.34 -0.3 -0.8 -0.96
1.31 0.37 -0.31 1.02 0.88 1.06 -0.02 -3.2 -3.33 -2.99 -3.45 -3.98
1.03 0.42 0.37 0.22 0.84 1.02 -0.03 -1.1 -1.75 -2.18 -2.05 -2.74
0.21 0.09 -0.13 0.14 0.22 0.44 -0.06 -0.22 -0.08 -0.08 -0.29 -0.48
0.85 0.3 0.09 0.18 0.21 0.24 -0.64 -0.82 -0.28 -0.26 -0.33 -0.38
0.97 0.58 0.06 0.25 0.39 0.51 -0.25 -0.75 -0.5 -0.74 -1.11 -1.38
1.43 0.9 -0.12 0.31 0.56 0.9 -0.33 -1.9 -1.69 -1.86 -2.53 -3.14
0.43 -0.08 -0.1 0.31 0.47 0.66 -0.41 -0.76 -0.25 -0.22 -0.24 -0.54
1.26 0.62 0.31 0.4 0.66 0.67 -0.33 -1.11 -1.26 -1.91 -1.97 -2.79
0.88 0.38 0.2 0.18 0.24 0.51 0.06 -0.39 -0.47 -0.85 -1.15 -1.18
1.29 0.36 0.07 -0.06 0.03 0.66 -0.38 -0.98 -0.82 -0.73 -0.39 -1.13
0.47 -0.02 -0.53 -0.1 0.45 0.81 0.14 -0.04 -0.2 -0.58 -0.69 -0.62
0.22 0.17 -0.21 0.39 0.72 1.12 0.0 -1.28 -0.54 -0.46 -1.05 -1.31
0.63 0.13 -0.02 0.22 0.34 0.61 -0.15 -0.35 -0.29 -0.35 -0.6 -1.06
0.76 0.32 0.06 -0.06 0.76 0.98 0.2 -0.5 -1.09 -1.24 -1.2 -2.15
1.28 0.52 -0.04 0.31 0.5 0.68 -0.27 -0.7 -0.73 -1.21 -2.01 -2.44
0.83 0.35 -0.06 0.09 0.24 0.43 -0.04 -0.21 -0.18 -0.58 -0.87 -1.14
1.15 0.41 -0.29 0.46 0.66 1.05 -0.15 -1.64 -0.98 -1.23 -2.05 -2.21
0.85 0.38 -0.0 0.14 0.03 0.21 -0.25 -0.25 -0.25 -0.35 -0.62 -0.58
0.45 0.07 -0.04 0.11 0.28 0.44 -0.23 -0.39 -0.18 -0.2 -0.23 -0.44
0.97 0.42 0.1 0.16 0.21 0.23 -0.41 -0.65 -0.46 -0.43 -0.64 -0.53
1.1 0.7 0.04 0.23 0.36 0.47 -0.48 -0.89 -0.54 -0.66 -1.1 -1.65
0.76 0.47 -0.12 0.17 0.31 0.77 -0.15 -0.71 -0.47 -0.43 -0.94 -1.19
0.09 -0.0 -0.12 0.26 0.24 0.26 -0.06 -0.23 -0.0 -0.02 -0.27 -0.3
0.56 0.25 0.21 0.25 0.65 0.81 -0.31 -0.82 -0.74 -0.83 -0.53 -1.18
0.66 0.25 -0.01 0.4 0.37 0.6 -0.26 -0.75 -0.37 -0.35 -0.73 -0.95
0.35 -0.01 -0.11 0.21 0.41 0.51 -0.19 -0.05 -0.3 -0.45 -0.46 -0.36
1.21 0.15 -0.16 0.35 0.71 0.97 -0.54 -1.81 -0.99 -0.94 -1.09 -1.55
0.96 0.01 -0.48 -0.17 0.52 0.82 0.26 -0.38 -0.83 -1.31 -0.75 -0.48
1.06 0.32 0.1 0.36 1.02 1.22 -0.26 -2.01 -1.59 -1.9 -2.41 -3.58
0.42 0.14 -0.28 0.36 0.52 0.93 -0.22 -0.95 -0.29 -0.2 -0.75 -1.14
1.07 0.6 0.48 0.58 0.61 0.83 -0.31 -1.54 -1.46 -1.64 -2.37 -2.62
0.7 0.19 -0.06 0.32 0.43 0.63 -0.25 -0.62 -0.38 -0.44 -0.89 -0.76
1.06 0.53 0.12 0.12 0.24 0.53 -0.32 -0.67 -0.69 -0.72 -0.74 -1.28
1.44 0.39 -0.68 0.16 0.94 1.25 0.12 -1.48 -2.56 -3.06 -3.22 -3.57
0.73 -0.08 -0.13 0.37 0.94 1.2 -0.15 -1.51 -0.92 -0.9 -1.29 -1.94
0.7 0.22 0.1 0.41 0.67 0.73 -0.3 -0.95 -0.72 -0.75 -0.84 -1.1
1.19 0.18 -0.4 0.28 0.61 0.69 -0.32 -0.73 -0.47 -0.55 -1.41 -1.81
1.42 0.88 0.2 0.44 0.43 0.58 -0.53 -1.39 -1.2 -1.82 -2.35 -2.83
1.03 0.28 -0.03 0.16 0.06 0.28 -0.75 -0.79 -0.4 -0.27 -0.1 -0.5
0.36 0.21 -0.0 0.07 0.3 0.55 -0.16 -0.43 -0.29 -0.18 -0.32 -0.55
0.49 -0.07 -0.15 0.09 0.48 0.84 -0.63 -0.62 -0.28 -0.15 -0.25 -0.66
1.15 0.49 0.24 0.46 0.91 1.01 -0.17 -1.62 -1.98 -2.45 -2.61 -3.16
0.94 0.42 -0.07 0.3 0.25 0.42 -0.37 -0.72 -0.25 -0.44 -0.85 -0.95
0.81 -0.08 -0.34 0.14 0.6 0.68 -0.29 -0.86 -0.34 -0.23 -0.58 -0.72
1.43 0.58 -0.02 0.07 0.28 0.51 -0.2 -0.69 -0.86 -1.27 -1.33 -1.74
0.45 0.04 -0.12 -0.03 0.13 0.33 0.02 -0.03 -0.09 -0.18 -0.24 -0.52
1.04 0.34 0.05 0.45 0.81 0.94 -0.36 -1.64 -0.99 -1.29 -1.61 -1.93
0.78 0.27 -0.14 0.47 0.26 0.28 -0.27 -0.41 -0.18 -0.45 -0.81 -0.7
0.6 0.14 -0.11 0.52 0.57 0.5 -0.19 -0.5 -0.26 -0.56 -0.77 -1.22
0.97 0.48 0.35 0.38 0.57 0.63 -0.33 -0.73 -0.84 -1.22 -1.4 -1.86
0.73 0.1 -0.24 -0.01 0.75 1.03 -0.49 -1.67 -0.57 -0.21 -0.45 -1.3
0.78 0.29 -0.04 0.22 0.2 0.4 -0.1 -0.34 -0.23 -0.51 -0.76 -0.78
0.51 0.28 -0.03 0.21 0.35 0.54 -0.07 -0.39 -0.22 -0.36 -0.69 -0.94
0.85 0.01 -0.34 0.27 0.7 0.84 0.11 -0.58 -0.65 -0.98 -1.17 -1.18
0.57 0.15 -0.03 0.24 0.32 0.58 -0.61 -0.87 -0.23 -0.15 -0.31 -0.43
0.57 0.31 0.14 0.18 0.33 0.31 -0.16 -0.29 -0.28 -0.51 -0.52 -0.72
0.23 0.13 -0.11 0.22 0.36 0.62 -0.07 -0.39 -0.24 -0.22 -0.51 -0.53
0.83 0.16 -0.15 0.37 0.74 1.03 -0.39 -1.56 -0.7 -0.69 -0.96 -1.53
0.45 0.09 -0.32 0.32 0.31 0.59 -0.26 -0.48 -0.09 -0.09 -0.48 -0.66
1.01 0.51 0.22 0.4 0.38 0.38 -0.78 -1.12 -0.54 -0.49 -0.81 -1.12
0.69 0.3 -0.16 0.2 0.53 0.87 -0.23 -0.69 -0.29 -0.59 -0.9 -1.51
0.76 0.45 0.1 0.23 0.27 0.46 -0.09 -0.32 -0.34 -0.8 -0.86 -1.16
0.96 0.47 0.2 0.4 0.55 0.61 -0.1 -0.64 -0.87 -1.17 -1.44 -1.88
1.08 0.71 0.19 0.27 0.37 0.64 -0.08 -1.19 -0.92 -1.14 -1.28 -1.9
0.47 0.03 -0.28 0.1 0.32 0.63 -0.19 -0.64 -0.29 -0.16 -0.29 -0.22
1.06 0.07 -0.49 0.09 0.63 1.07 -0.27 -0.99 -0.61 -0.72 -0.97 -1.6
0.34 0.22 -0.21 0.27 0.56 0.9 -0.12 -0.81 -0.4 -0.38 -0.72 -0.91
0.77 0.13 -0.59 0.14 0.42 0.84 -0.32 -1.34 -0.29 -0.11 -0.46 -0.64
1.03 0.13 -0.07 0.28 0.64 0.89 -0.24 -0.88 -0.67 -0.82 -1.14 -1.99
0.47 0.13 -0.13 0.3 0.34 0.49 -0.1 -0.44 -0.27 -0.39 -0.48 -0.49
0.72 0.11 0.21 0.4 0.64 0.58 -0.31 -0.81 -0.53 -0.8 -0.79 -0.94
0.74 0.26 -0.15 0.19 0.17 0.44 0.01 -0.21 -0.14 -0.5 -0.8 -0.89
1.16 0.81 -0.1 -0.55 0.07 0.27 -0.21 -0.28 -0.35 -0.54 -0.85 -1.25
0.41 0.14 -0.36 0.44 0.4 0.6 -0.15 -0.75 -0.0 -0.16 -0.73 -0.71
1.48 0.51 -0.23 0.17 0.04 0.49 -0.5 -1.16 -0.59 -0.63 -0.98 -1.31
0.48 0.12 -0.16 0.04 0.38 0.61 -0.06 -0.16 -0.24 -0.37 -0.45 -0.84
0.75 0.45 0.09 0.21 0.17 0.23 -0.3 -0.3 -0.29 -0.33 -0.74 -0.73
0.51 0.27 -0.02 0.12 0.14 0.34 -0.06 -0.13 -0.04 -0.23 -0.59 -0.81
0.4 -0.11 -0.31 -0.2 0.26 0.45 0.12 -0.21 -0.08 -0.17 -0.19 -0.23
0.43 0.1 -0.17 0.2 0.52 0.93 -0.03 -1.23 -0.35 -0.22 -0.7 -0.87
0.82 0.24 -0.4 0.19 0.28 0.65 -0.18 -0.72 -0.31 -0.29 -0.73 -0.59
0.53 0.17 -0.2 0.2 0.23 0.5 -0.15 -0.46 -0.19 -0.34 -0.61 -0.19
0.57 0.13 -0.21 -0.08 0.33 0.6 0.06 -0.17 -0.23 -0.26 -0.52 -0.93
0.51 -0.11 -0.44 -0.16 0.42 0.78 0.28 -0.12 -0.31 -0.61 -0.57 -0.51
0.43 0.07 0.17 0.36 0.8 0.86 -0.25 -0.97 -0.6 -0.68 -0.75 -1.29
0.82 0.42 0.04 0.11 0.15 0.48 -0.34 -0.65 -0.51 -0.4 -0.44 -0.6
0.67 0.28 -0.11 -0.07 0.33 0.5 -0.03 -0.07 -0.25 -0.45 -0.68 -0.95
0.78 -0.04 -0.16 0.48 0.64 0.98 -0.22 -1.15 -0.72 -0.86 -0.55 -1.56
1.35 0.71 0.0 0.21 0.27 0.57 -0.18 -0.87 -0.81 -1.07 -1.68 -2.51
1.25 0.5 0.21 0.04 0.59 0.71 -0.93 -1.85 -1.14 -0.93 -0.73 -0.96
0.84 0.43 0.19 0.2 0.21 0.39 -0.09 -0.3 -0.44 -0.72 -0.95 -1.01
1.3 0.7 0.45 0.24 0.67 0.49 -1.03 -2.35 -1.34 -1.07 -1.03 -1.55
2.31 0.82 -1.48 -1.37 -0.98 1.03 0.02 -3.06 -2.78 -2.42 -2.2 -1.72
0.7 0.22 0.01 0.34 0.56 0.82 -0.34 -0.97 -0.57 -0.54 -0.72 -1.18
0.87 0.13 -0.2 0.07 0.49 0.69 0.14 -0.41 -0.47 -0.73 -0.81 -1.34
0.53 0.2 -0.42 0.15 0.48 0.91 -0.06 -0.94 -0.16 -0.22 -0.76 -1.14
1.02 0.35 -0.18 0.24 0.67 0.86 -0.34 -1.11 -0.64 -0.76 -1.25 -1.62
0.83 0.16 -0.18 0.33 0.48 0.74 -0.49 -1.24 -0.24 -0.22 -0.77 -1.1
1.05 0.49 0.23 0.12 0.37 0.56 -0.16 -0.45 -0.6 -0.96 -1.35 -1.73
0.27 0.18 -0.1 0.52 0.66 0.97 -0.01 -1.38 -0.54 -0.43 -1.01 -1.14
1.13 0.47 -0.07 0.31 0.07 0.34 -0.36 -0.71 -0.37 -0.52 -0.93 -0.9
0.67 0.21 0.01 0.43 0.37 0.64 -0.68 -1.23 -0.29 -0.21 -0.53 -0.68
1.14 0.5 0.12 0.26 0.23 0.39 -0.81 -1.03 -0.46 -0.47 -0.61 -1.1
0.49 0.16 -0.14 0.37 0.47 0.76 0.02 -0.58 -0.18 -0.41 -1.05 -1.32
0.57 0.17 -0.07 0.2 0.37 0.55 -0.55 -0.68 -0.17 -0.21 -0.32 -0.58
0.76 0.35 -0.22 0.25 0.38 0.65 -0.26 -0.68 -0.36 -0.37 -0.8 -0.88
0.39 0.14 -0.13 0.27 0.44 0.74 -0.18 -0.54 -0.07 -0.25 -0.74 -1.07
1.06 0.46 0.06 -0.19 0.72 0.96 0.16 -0.46 -1.11 -1.64 -1.76 -3.18
0.57 0.27 -0.07 -0.06 0.18 0.43 -0.22 -0.4 -0.32 -0.22 -0.22 -0.35
0.78 0.15 0.07 0.28 0.76 1.0 -0.32 -1.14 -0.93 -0.89 -0.93 -1.41
0.81 0.26 0.17 0.4 0.52 0.75 -0.58 -1.23 -0.55 -0.57 -0.75 -1.22
0.44 -0.21 -0.24 0.08 0.5 0.69 -0.18 -0.3 -0.27 -0.25 -0.27 -0.61
0.49 0.14 -0.16 -0.09 0.29 0.56 -0.13 -0.23 -0.24 -0.25 -0.23 -0.59
0.62 0.09 -0.26 0.24 0.28 0.59 -0.44 -0.86 -0.04 -0.02 -0.37 -0.63
0.93 0.41 0.19 0.16 0.27 0.38 -0.09 -0.24 -0.39 -0.69 -1.05 -1.45
0.73 0.23 0.05 0.31 0.29 0.43 -0.4 -0.82 -0.48 -0.4 -0.4 -0.38
0.45 0.03 -0.19 0.15 0.39 0.53 -0.05 -0.17 -0.2 -0.41 -0.68 -0.37
0.46 0.01 -0.06 -0.02 0.27 0.39 -0.1 -0.19 -0.07 -0.21 -0.19 -0.62
1.02 0.55 0.35 0.32 0.85 1.01 -0.47 -1.99 -1.49 -1.3 -1.67 -2.87
0.45 0.22 0.06 0.4 0.57 0.52 0.09 -0.22 -0.47 -0.78 -1.22 -0.93

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.