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Heatmap: Cluster_6 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.32 0.32 -0.07 0.27 0.11 0.41 -0.19 -0.5 -0.1 -0.19 -0.44 -0.31
0.53 0.36 0.22 0.24 -0.1 0.12 -0.55 -0.47 -0.23 -0.25 -0.15 -0.14
0.16 0.23 -0.05 0.16 0.04 0.25 -0.04 -0.05 0.1 -0.03 -0.55 -0.43
0.58 0.47 -0.05 0.29 -0.04 0.01 -0.34 -0.49 0.06 -0.16 -0.59 -0.24
0.5 0.61 0.15 0.36 -0.02 0.29 -0.37 -0.58 -0.08 -0.29 -0.76 -0.6
0.31 0.33 0.11 0.29 0.09 0.03 -0.19 -0.15 0.12 -0.07 -0.68 -0.59
0.55 0.54 0.09 0.47 0.12 0.26 -0.33 -0.97 -0.14 -0.26 -0.84 -0.43
0.2 0.27 -0.06 0.22 -0.03 0.19 -0.03 -0.04 0.16 -0.06 -0.61 -0.5
0.73 0.24 -0.35 0.22 0.2 0.52 -0.47 -1.32 -0.11 -0.09 -0.32 -0.28
0.22 0.19 -0.03 0.19 0.01 0.18 -0.01 -0.06 0.18 -0.08 -0.57 -0.47
0.12 0.23 -0.06 0.11 0.04 0.17 -0.08 -0.1 0.12 0.04 -0.36 -0.37
0.5 0.5 0.02 0.2 0.03 0.23 -0.13 -0.37 0.0 -0.27 -0.79 -0.47
0.27 0.18 -0.09 0.1 -0.03 0.08 -0.14 -0.27 0.06 0.06 -0.19 -0.13
0.21 0.32 -0.03 0.3 0.05 0.31 -0.01 -0.29 0.03 -0.07 -0.65 -0.54
0.28 0.28 -0.12 0.24 -0.06 0.14 -0.03 -0.09 0.22 -0.01 -0.64 -0.54
0.1 0.25 0.01 0.25 0.0 0.14 -0.13 -0.01 0.2 -0.06 -0.54 -0.42
0.04 0.25 0.08 0.23 0.05 0.08 -0.02 -0.23 0.04 -0.07 -0.38 -0.2
0.38 0.37 -0.07 0.28 0.29 0.51 -0.06 -0.49 -0.21 -0.32 -0.79 -0.57
0.23 0.27 0.29 0.36 0.19 0.16 -0.47 -0.64 0.01 -0.12 -0.38 -0.31
0.08 0.2 0.01 0.17 -0.08 0.22 -0.03 -0.05 0.12 -0.05 -0.33 -0.41
0.21 0.26 0.12 0.28 0.18 0.3 -0.27 -0.45 -0.18 -0.23 -0.3 -0.2
0.44 0.14 -0.05 0.38 0.05 0.3 -0.66 -0.78 0.01 -0.0 -0.15 -0.17
0.33 0.22 0.02 0.27 -0.03 0.2 -0.08 -0.19 0.03 -0.06 -0.54 -0.44
-0.13 0.24 0.08 0.35 0.07 0.21 0.0 -0.13 0.03 -0.16 -0.57 -0.22
0.28 0.29 0.14 0.39 0.09 0.26 -0.19 -0.58 -0.25 -0.24 -0.59 0.0
0.4 0.26 -0.06 0.22 0.18 0.35 -0.05 -0.28 -0.08 -0.29 -0.63 -0.42
-0.02 0.28 0.1 0.19 0.12 0.22 -0.17 -0.21 0.03 -0.11 -0.33 -0.26
0.37 0.23 0.04 0.13 0.04 0.24 -0.17 -0.26 -0.18 -0.11 -0.3 -0.23
-0.04 0.26 0.27 0.38 0.17 0.19 -0.35 -0.4 -0.01 -0.03 -0.35 -0.4
0.59 0.22 -0.12 0.33 0.27 0.65 -0.13 -0.72 -0.2 -0.35 -0.89 -0.61
0.46 0.18 -0.35 -0.03 0.1 0.29 -0.17 -0.3 0.14 0.06 -0.32 -0.33
-0.01 0.22 0.02 0.25 -0.14 0.09 -0.07 -0.08 0.17 -0.06 -0.44 -0.07
0.03 0.26 0.04 0.28 -0.08 0.09 -0.14 -0.22 0.18 0.04 -0.47 -0.2
0.41 0.33 0.01 0.25 0.07 0.25 -0.06 -0.2 -0.04 -0.16 -0.69 -0.59
0.26 0.18 0.08 0.18 0.04 0.02 -0.14 -0.22 -0.08 -0.09 -0.21 -0.12
0.47 0.21 -0.15 0.15 0.05 0.21 -0.28 -0.35 0.01 0.0 -0.24 -0.35
0.2 0.18 -0.1 0.15 0.02 0.24 0.03 -0.06 0.11 -0.08 -0.45 -0.44
0.24 0.21 0.02 0.23 0.18 0.27 0.0 -0.28 -0.18 -0.19 -0.5 -0.27
0.37 0.49 0.1 0.44 0.28 0.21 -0.23 -0.64 -0.13 -0.31 -0.99 -0.33
0.11 0.29 -0.09 0.08 -0.04 0.18 -0.02 -0.05 0.11 -0.02 -0.35 -0.34
0.18 0.23 -0.07 0.15 -0.03 0.1 -0.03 -0.08 0.22 0.03 -0.46 -0.46
0.54 0.3 -0.28 0.23 0.06 0.41 -0.36 -0.67 0.14 0.1 -0.37 -0.75
0.51 0.17 -0.24 0.17 0.11 0.4 -0.44 -0.87 0.08 0.07 -0.25 -0.22
0.28 0.31 -0.02 0.09 0.08 0.23 -0.01 -0.17 -0.03 -0.18 -0.32 -0.49
0.18 0.36 0.07 0.35 -0.05 0.09 -0.05 -0.35 0.1 -0.0 -0.54 -0.46
0.32 0.38 0.05 0.19 0.07 0.31 -0.05 -0.33 -0.06 -0.15 -0.6 -0.52
0.27 0.32 0.03 0.21 -0.07 0.04 -0.09 -0.11 0.19 0.02 -0.58 -0.51
0.22 0.32 0.0 0.16 -0.08 0.11 -0.02 -0.08 0.13 -0.08 -0.53 -0.38
0.42 0.36 -0.04 0.2 0.03 0.12 -0.33 -0.35 0.25 -0.01 -0.5 -0.57
0.51 0.36 0.24 0.46 0.15 0.12 -0.36 -0.49 -0.22 -0.24 -0.74 -0.43
0.71 0.54 0.18 0.24 0.03 0.16 -0.24 -0.64 -0.17 -0.24 -0.76 -0.64
0.45 0.22 0.1 0.18 0.03 0.32 -0.28 -0.29 -0.09 -0.14 -0.39 -0.4
0.16 0.38 0.09 0.28 0.1 0.3 -0.17 -0.6 -0.04 0.02 -0.5 -0.4
0.3 0.41 0.16 0.35 0.08 0.21 -0.44 -0.62 0.04 -0.09 -0.59 -0.29
0.54 0.16 -0.23 0.15 0.12 0.41 -0.26 -0.53 -0.0 0.02 -0.33 -0.46
0.08 0.19 0.02 0.18 0.02 0.15 -0.01 -0.13 -0.0 -0.1 -0.37 -0.12
0.35 0.37 0.16 0.43 0.09 0.1 -0.11 -0.2 -0.05 -0.33 -0.76 -0.55
0.16 0.28 -0.07 0.08 -0.04 0.25 -0.18 -0.39 0.13 0.1 -0.31 -0.19
0.25 0.09 -0.12 0.19 -0.02 0.21 -0.27 -0.37 0.08 0.08 -0.22 -0.05
0.18 0.33 -0.06 0.15 0.02 0.15 0.03 -0.24 0.07 0.01 -0.56 -0.3
0.53 0.36 -0.06 0.35 0.07 0.25 -0.16 -0.73 -0.14 -0.19 -0.66 -0.17
0.12 0.32 -0.06 0.26 0.01 0.25 -0.17 -0.45 0.1 0.01 -0.39 -0.25
0.49 0.58 0.11 0.48 0.02 0.11 -0.35 -0.47 -0.24 -0.16 -0.98 -0.37
0.38 0.35 0.01 0.27 -0.05 0.12 -0.29 -0.41 -0.01 -0.01 -0.44 -0.22
0.27 0.35 0.14 0.2 0.15 0.33 -0.39 -0.51 -0.04 0.04 -0.4 -0.57
0.12 0.33 0.05 0.23 0.06 0.32 -0.03 -0.54 -0.25 -0.09 -0.41 -0.06
0.58 0.51 0.1 0.31 0.08 0.19 -0.19 -0.39 -0.09 -0.28 -0.85 -0.7
0.33 0.38 -0.13 0.33 0.18 0.46 -0.23 -0.59 -0.06 -0.05 -0.72 -0.49
0.28 0.11 -0.22 0.25 0.09 0.21 -0.24 -0.45 0.17 0.07 -0.29 -0.21
0.28 0.32 0.23 0.49 0.24 0.26 -0.46 -0.68 -0.19 -0.18 -0.54 -0.35
0.45 0.35 0.06 0.24 -0.04 0.23 -0.46 -0.52 -0.25 -0.21 -0.13 -0.08
0.03 0.3 0.11 0.33 0.13 0.24 -0.2 -0.22 0.09 -0.09 -0.64 -0.4
0.23 0.23 -0.09 0.26 0.16 0.3 -0.22 -0.29 0.16 -0.02 -0.59 -0.45
0.47 0.25 -0.19 0.05 -0.01 0.24 -0.18 -0.4 -0.01 0.07 -0.32 -0.24
0.4 0.48 0.18 0.37 -0.04 0.24 -0.12 -0.46 -0.19 -0.23 -0.72 -0.47
0.44 0.42 0.32 0.66 0.25 0.4 -0.34 -0.73 -0.41 -0.39 -1.17 -0.69
0.39 0.06 -0.27 0.32 0.22 0.35 -0.09 -0.5 0.24 0.03 -0.56 -0.71
0.75 0.51 0.12 0.43 0.1 0.2 -0.49 -0.92 -0.22 -0.2 -0.75 -0.56
0.79 0.34 0.15 0.41 0.05 0.18 -0.55 -0.67 -0.11 -0.28 -0.69 -0.48
-0.04 0.32 0.15 0.2 0.18 0.35 -0.17 -0.41 -0.01 -0.05 -0.53 -0.28
0.52 0.39 0.06 0.2 -0.05 0.07 -0.34 -0.39 -0.11 -0.03 -0.36 -0.3
0.26 0.34 0.25 0.32 0.07 0.12 -0.27 -0.35 -0.06 -0.14 -0.46 -0.41
0.11 0.23 -0.01 0.28 -0.04 0.11 -0.12 -0.13 0.19 0.1 -0.51 -0.41
0.33 0.3 -0.02 0.37 -0.0 0.15 -0.16 -0.38 -0.03 -0.17 -0.4 -0.26
0.67 0.28 -0.21 0.1 0.13 0.39 -0.81 -1.4 -0.33 0.24 -0.03 -0.08
0.08 0.28 0.07 0.29 0.09 0.27 -0.23 -0.37 0.09 0.11 -0.51 -0.5
0.13 0.23 -0.05 0.23 0.09 0.24 -0.06 -0.18 0.09 0.02 -0.57 -0.39
-0.05 0.35 0.19 0.31 0.08 0.26 -0.22 -0.43 0.0 -0.06 -0.49 -0.25
0.47 0.35 -0.01 0.19 0.05 0.31 -0.09 -0.42 -0.32 -0.29 -0.46 -0.15
0.51 0.31 -0.05 0.36 0.12 0.26 -0.67 -0.99 -0.15 0.01 -0.27 -0.1
0.46 0.63 0.2 0.41 0.09 0.25 -0.08 -0.44 -0.21 -0.33 -1.1 -0.89
0.58 0.43 0.25 0.42 0.12 0.14 -0.49 -0.88 -0.29 -0.23 -0.51 -0.3
0.39 0.06 -0.23 0.23 0.14 0.31 -0.25 -0.52 0.03 0.06 -0.28 -0.24
0.37 0.14 -0.2 0.04 0.05 0.23 -0.15 -0.3 -0.02 0.01 -0.24 -0.07
0.46 0.26 0.03 0.13 -0.13 0.13 -0.11 -0.17 -0.03 -0.05 -0.37 -0.37
0.16 0.17 -0.06 0.24 0.01 0.13 0.02 -0.11 0.05 -0.05 -0.43 -0.25
0.48 0.36 0.01 0.32 0.08 0.26 -0.19 -0.4 -0.06 -0.21 -0.67 -0.48
-0.09 0.33 0.21 0.44 0.22 0.04 -0.08 -0.13 -0.02 -0.15 -0.66 -0.48
0.1 0.5 0.11 0.26 0.07 0.2 -0.09 -0.39 -0.0 -0.16 -0.62 -0.33
0.36 0.28 -0.05 0.33 -0.01 0.14 0.04 -0.07 0.09 -0.17 -0.91 -0.48
0.55 0.6 0.09 0.08 -0.05 0.37 0.15 -0.49 -0.32 -0.38 -0.93 -0.47
0.27 0.29 0.17 0.3 0.14 0.18 -0.04 -0.19 -0.09 -0.31 -0.63 -0.44
0.82 0.66 -0.3 -0.04 -0.01 0.3 -0.38 -0.7 0.02 -0.13 -0.63 -0.53
-0.13 0.31 0.2 0.42 0.02 0.23 -0.11 -0.14 0.12 -0.13 -0.66 -0.49
0.11 0.24 0.04 0.11 -0.04 0.14 -0.1 -0.15 0.04 -0.0 -0.22 -0.26
0.42 0.38 -0.04 -0.05 -0.05 0.22 -0.29 -0.34 -0.06 0.06 -0.27 -0.24
0.46 0.23 0.04 0.35 0.07 0.26 -0.35 -0.74 -0.08 -0.16 -0.47 -0.05
0.27 0.39 0.16 0.38 0.23 0.29 -0.28 -0.61 -0.27 -0.31 -0.58 -0.2
0.44 0.41 0.08 0.3 0.1 0.15 -0.11 -0.37 -0.04 -0.23 -0.68 -0.5
0.23 0.21 0.15 0.29 0.06 0.06 -0.14 -0.23 -0.07 -0.04 -0.39 -0.33
0.66 0.09 -0.2 0.11 0.16 0.23 -0.29 -0.23 -0.0 -0.08 -0.41 -0.42
0.63 0.36 0.01 0.32 -0.16 0.3 -0.39 -0.44 -0.07 -0.14 -0.53 -0.44
0.24 0.46 0.19 0.38 0.12 0.24 -0.05 -0.41 -0.15 -0.26 -0.79 -0.52
-0.09 0.21 -0.02 0.33 -0.02 0.1 0.04 -0.06 0.22 -0.01 -0.53 -0.4
0.08 0.31 -0.02 0.3 -0.14 0.15 -0.12 -0.25 0.23 0.07 -0.57 -0.3
0.24 0.24 -0.06 0.26 -0.01 0.04 -0.24 -0.16 0.18 -0.02 -0.52 -0.16
0.29 0.42 0.03 0.29 -0.03 0.07 -0.15 -0.41 0.07 -0.07 -0.58 -0.27
0.25 0.46 -0.02 0.29 -0.14 0.23 -0.22 -0.17 -0.07 -0.07 -0.53 -0.33
0.25 0.11 -0.06 0.24 -0.02 0.22 -0.13 -0.17 0.19 -0.11 -0.43 -0.27
0.11 0.28 0.13 0.28 -0.09 0.17 -0.08 -0.09 0.08 -0.06 -0.56 -0.41
0.4 0.31 0.26 0.36 0.04 -0.08 -0.19 -0.34 -0.02 -0.17 -0.51 -0.43
0.18 0.16 0.08 0.35 0.25 0.36 -0.22 -0.49 -0.12 -0.1 -0.46 -0.34
0.24 0.31 0.2 0.31 0.05 0.18 -0.28 -0.34 -0.01 -0.22 -0.39 -0.33
0.48 0.37 0.09 0.14 0.05 0.23 -0.22 -0.36 -0.03 -0.13 -0.51 -0.49
0.23 0.2 -0.11 0.17 -0.07 0.13 -0.03 -0.11 0.14 -0.04 -0.35 -0.3
0.33 0.36 0.06 0.32 -0.11 0.02 0.0 -0.27 0.05 -0.15 -0.68 -0.25
0.62 0.47 0.04 0.23 0.04 0.12 -0.24 -0.31 -0.07 -0.27 -0.65 -0.54
0.26 0.34 0.24 0.48 0.33 0.38 -0.32 -0.58 -0.18 -0.22 -0.71 -0.81

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.