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Heatmap: Cluster_120 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.16 -0.45 -0.11 -0.13 -0.28 0.23 0.02 0.27 0.19 -0.14 0.26 -0.24
- - - - - - - - 2.49 2.67 - -
0.05 0.08 0.18 -0.19 -0.48 -0.08 -0.55 -0.08 0.21 0.07 0.51 -0.03
-0.51 0.01 0.06 -0.06 -0.11 -0.16 0.32 0.16 0.04 -0.13 0.23 -0.02
-0.6 -0.08 -0.15 0.37 0.22 0.27 0.28 0.04 -0.18 -0.38 0.34 -0.56
-0.02 -0.27 -0.01 -0.15 -0.02 -0.06 0.0 0.16 0.13 0.1 0.09 -0.01
-1.38 0.71 -0.46 0.1 -0.43 0.12 0.32 0.38 -0.28 -0.07 0.21 -0.2
0.09 0.08 0.14 -0.04 -0.04 -0.07 0.1 -0.03 -0.07 -0.07 -0.07 -0.03
0.45 -0.97 1.24 -0.93 -0.59 -0.77 -0.63 -0.79 0.78 -0.6 0.14 0.36
0.25 -0.83 0.39 -0.43 -0.29 -0.29 -0.59 0.31 0.09 0.24 0.49 -0.0
-0.28 -0.22 -0.27 0.28 -0.3 -0.04 0.56 -0.17 -0.12 0.25 0.25 -0.28
-0.54 -0.41 0.39 0.66 -0.18 -0.39 0.29 -0.26 0.02 -0.13 0.22 -0.2
-0.03 -0.12 0.41 0.03 0.16 -0.52 -0.22 0.16 0.01 -0.61 0.31 0.08
-0.4 -0.09 0.04 0.13 0.13 0.2 0.16 -0.16 0.05 -0.31 0.2 -0.11
0.75 -2.67 -0.34 0.42 -0.77 - 0.26 0.97 0.53 -0.52 -0.37 0.47
0.19 0.0 0.36 1.1 -2.75 -0.34 0.43 -0.24 -1.09 0.52 -1.41 0.02
0.14 -0.44 -0.18 -0.04 -0.1 -0.05 0.28 0.07 0.05 -0.37 -0.06 0.46
-0.4 -1.27 - - 0.57 -0.56 0.17 1.62 -0.88 -2.13 1.5 -0.2
0.15 -2.0 -0.46 -0.21 -0.67 -0.42 0.69 0.57 0.49 0.22 0.78 -1.8
0.67 -0.42 - - - - 0.12 1.75 - - 2.38 -
-0.3 0.12 0.46 0.43 -0.4 -0.18 0.29 -0.46 -0.33 -0.46 0.42 -0.11
-0.04 -0.31 -0.49 0.0 -0.44 0.27 0.18 0.39 0.17 0.08 -0.06 -0.03
0.59 -1.3 0.49 -0.08 -1.23 0.26 -0.05 0.61 -0.82 -0.43 0.38 0.04
-0.43 -1.7 0.34 -0.68 -0.01 -0.07 -0.27 0.7 0.23 0.12 0.3 0.22
0.01 -0.79 -0.88 -0.4 -0.21 0.12 -0.27 -0.03 0.28 0.72 0.46 0.17
-0.24 -0.2 - -1.92 -1.59 0.79 -0.82 -2.09 1.18 1.29 1.13 -1.94
0.4 -0.23 -0.63 -0.1 -0.22 -0.55 -0.06 0.31 0.3 0.28 0.09 -0.0
-1.14 0.48 0.23 0.88 -0.52 0.44 0.07 -0.01 -0.86 -0.04 -0.24 -0.57
- - - - - - - - 2.49 2.67 - -
-0.22 0.1 0.38 0.42 -0.04 -0.15 0.12 0.1 -0.62 -0.67 0.48 -0.49
- 0.48 0.8 0.93 - 1.33 - 0.59 -0.77 -0.12 - 0.51
0.13 -1.1 -0.22 -0.87 -1.07 0.28 0.21 0.78 0.51 -0.33 0.4 -0.12
0.01 0.0 -0.15 0.19 -0.11 0.09 0.07 -0.05 0.09 -0.06 0.03 -0.16
0.03 0.08 0.52 0.62 -0.99 0.17 0.28 -0.6 -0.75 0.11 0.14 -0.57
0.54 -0.34 -0.98 -0.0 -0.08 -0.86 0.33 0.6 0.18 -0.37 -0.37 0.37
-0.74 0.12 0.76 0.5 - 0.12 -0.27 -1.53 -1.28 0.31 0.67 0.78
-1.19 0.2 -2.9 0.08 -0.64 -1.22 -0.06 0.82 -0.35 0.38 1.43 -0.66
-0.8 -2.49 - -2.22 -1.73 -0.23 0.21 0.64 1.15 1.14 0.9 -0.19
0.59 1.27 0.09 - - 0.09 - -0.23 - 0.83 0.6 0.85
-0.1 0.81 1.05 -0.2 - -0.63 -1.94 -0.75 -0.12 0.03 0.34 0.73
-0.47 -1.56 -0.39 -1.34 - 0.58 -0.24 1.07 -0.16 0.13 1.19 0.1
0.05 0.35 - -0.43 - - 0.37 0.25 -0.2 -0.51 1.73 0.65
-0.2 -0.09 -0.02 -0.02 -0.04 -0.17 -0.2 0.31 0.06 0.23 0.14 -0.08
0.19 0.19 0.36 -0.56 -2.05 0.66 -0.14 0.01 -0.57 -0.26 0.57 0.03
-1.41 -0.06 0.26 -0.44 -2.98 0.85 0.2 -0.36 -0.83 -0.4 0.67 0.97
-0.22 0.55 0.07 0.13 -0.7 -1.96 0.8 -0.54 -0.67 -0.24 0.8 0.02
- 0.83 - 1.64 -0.14 - - 1.16 - - 1.99 -
-2.57 -1.45 -1.6 -1.89 0.77 -3.25 0.22 1.69 -0.75 0.48 1.25 -1.7
-1.29 0.15 0.35 0.49 -0.06 -0.1 -0.35 0.3 0.25 -0.31 0.13 -0.31
-0.75 0.36 0.01 0.65 -0.57 0.28 -0.3 0.16 0.51 -0.75 -0.0 -0.49
-1.16 -0.5 0.45 0.43 -0.2 -0.13 0.02 0.74 -0.14 -0.39 0.78 -1.89
0.48 -0.31 -0.28 -0.5 -0.03 -0.66 0.17 0.21 0.17 -0.02 0.56 -0.34
-1.56 -0.82 0.15 0.33 -1.03 0.88 0.78 -0.38 0.22 -0.76 0.43 -0.32
-1.47 -1.0 0.53 -2.0 -1.64 0.79 -1.36 1.06 0.24 -0.44 1.27 -0.78
-0.47 -0.2 0.21 -0.12 -0.84 -0.44 -0.09 0.71 -0.05 -0.06 0.7 -0.15
0.25 0.02 0.12 -0.16 -0.32 0.16 0.04 0.24 -0.27 0.1 -0.31 -0.01
0.22 -0.29 0.08 -0.21 -0.14 0.01 -0.15 0.15 0.25 -0.03 0.1 -0.1
0.84 -0.5 0.18 -0.22 -0.14 -0.3 -0.71 0.08 -0.25 0.06 0.22 0.11
-1.48 0.09 -1.49 0.97 -0.02 0.02 0.66 0.33 -0.12 0.01 -0.03 -0.96
0.92 -0.02 0.44 -0.66 -1.85 0.46 -1.24 1.0 -3.25 -0.25 0.55 -0.67
-1.08 1.14 -2.16 1.16 -0.57 -0.63 -0.18 0.9 0.18 -1.82 -0.87 -0.26
-0.61 0.17 0.13 0.44 -0.0 -0.74 0.48 -0.55 0.21 -0.62 0.77 -0.77
-0.21 -0.07 -0.19 0.2 -0.11 0.05 0.06 0.13 0.18 0.06 0.06 -0.24
-0.32 0.06 -0.01 -0.01 -0.1 -0.05 -0.24 0.12 -0.05 0.07 0.15 0.27
-1.83 0.54 -0.57 -1.78 - -0.81 -2.38 1.31 -2.81 0.13 1.96 -0.11
-0.3 -0.38 0.03 0.14 -0.09 0.26 0.57 0.25 0.25 -0.47 -0.39 -0.31
-0.38 0.25 0.28 0.4 -4.11 -0.59 0.3 0.48 -1.22 0.04 0.27 0.58
0.01 -0.0 0.14 -0.09 0.27 0.03 0.08 0.23 -0.61 -0.11 0.16 -0.33
0.09 -0.17 -0.01 -0.17 -0.02 -0.65 -0.1 0.31 0.12 0.35 -0.09 0.1
0.06 0.11 0.15 0.12 -0.09 -0.0 -0.06 -0.05 -0.12 -0.01 -0.01 -0.14
-0.67 0.09 -0.34 0.28 -0.22 -0.09 0.43 0.04 0.53 -0.34 0.17 -0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.