Heatmap: Cluster_41 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.18 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.43 0.39 0.11 0.21 0.69
0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.1 0.02 0.06 0.04 0.11
43.72 34.01 29.05 31.67 25.13 35.18 30.22 35.97 37.41 30.45 35.71 37.47
0.36 0.32 0.05 0.11 0.0 0.24 0.62 0.76 0.71 0.44 0.44 1.44
0.15 0.21 0.04 0.48 0.08 0.52 0.04 0.12 0.12 0.27 0.17 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.04
0.04 0.0 0.02 0.13 0.03 0.1 0.11 0.33 0.19 0.18 0.1 0.08
0.39 0.0 0.0 0.02 0.02 0.17 0.06 0.04 0.14 0.06 0.0 0.13
0.0 0.07 0.08 0.05 0.0 0.0 0.07 0.02 0.09 0.04 0.05 0.09
0.29 0.08 0.0 0.07 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.28
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11
0.32 0.0 0.71 0.24 0.17 0.45 0.3 0.58 0.4 0.14 0.41 1.06
59.69 33.37 23.6 30.18 31.61 36.95 34.14 28.28 28.97 34.39 36.8 27.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.67 0.07 0.07 0.06 0.07 0.0 0.26 0.65 0.0 0.31 0.0 1.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.15 0.08 0.05 0.27 0.25 0.08 0.0 0.07 0.04 0.1
4.14 4.4 4.15 4.79 5.12 4.7 5.18 6.31 5.91 4.23 4.37 4.14
0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06
0.28 0.25 0.23 0.16 0.2 0.53 0.17 0.3 0.23 0.41 0.2 0.45
1.28 1.05 0.5 0.85 0.87 1.62 0.81 0.79 1.31 1.05 0.77 1.41
0.07 0.11 0.0 0.08 0.02 0.17 0.1 0.18 0.05 0.15 0.11 0.09
0.04 0.12 0.0 0.06 0.06 0.17 0.18 0.35 0.02 0.25 0.14 0.17
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.07 0.02 0.0 0.04 0.0 0.12 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.08 0.0 0.04 0.02 0.1 0.0 0.1 0.11 0.07 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.14 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.1
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0
0.0 0.02 0.03 0.14 0.05 0.17 0.04 0.02 0.04 0.08 0.07 0.04
0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.08
0.0 0.0 0.03 0.1 0.0 0.12 0.04 0.0 0.02 0.0 0.16 0.09
0.11 0.07 0.05 0.07 0.07 0.24 0.04 0.02 0.0 0.07 0.02 0.15
0.0 0.04 0.03 0.06 0.0 0.13 0.04 0.13 0.07 0.07 0.02 0.06
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.32 0.35 0.22 0.32 0.21 0.76 0.44 0.41 0.33 0.3 0.22 0.51
2.06 1.23 1.35 1.22 1.09 2.74 1.45 2.25 2.27 1.59 1.47 2.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.07
0.07 0.36 0.03 0.08 0.14 0.34 0.27 0.04 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.43 0.22 0.45 0.56 0.34 0.66 0.49 0.55 0.39 0.69 0.92 0.66
0.07 0.18 0.0 0.2 0.13 0.1 0.16 0.31 0.09 0.08 0.17 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.07 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.04 0.05 0.32
0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.2 0.0 0.0 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.04 0.05 0.26
0.0 0.25 0.09 0.32 0.25 0.37 0.21 0.11 0.09 0.15 0.33 0.06
0.49 0.12 0.0 0.04 0.0 0.35 0.0 0.0 0.04 0.0 0.15 0.28
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.04 0.04 0.0 0.02 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.64 0.1 0.02 0.1 0.17 0.02 0.18 0.0 0.31 0.16 0.07 0.46
0.04 0.04 0.17 0.09 0.07 0.52 0.08 0.15 0.16 0.36 0.4 0.17
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.11 0.08 0.05 0.0 0.04 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.0 0.18 0.05 0.0 0.0 0.45 0.0 0.06 0.21 0.06 0.44 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.32 0.05 0.07 0.08 0.27 0.36 0.28 0.35 0.08 0.09 0.07
0.21 0.0 0.0 0.09 0.0 0.12 0.07 0.06 0.05 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.04 0.07 0.02
0.46 0.5 0.26 0.58 0.57 1.11 0.84 1.49 0.98 1.18 0.63 0.96
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.11 0.14 0.0 0.07 0.02 0.07 0.1 0.04 0.18 0.08 0.13 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.18 0.2 0.3 0.32 0.15 0.09 0.54 0.52 0.33 0.4 0.43 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
42.32 38.48 38.16 34.6 37.44 39.23 40.17 43.43 43.94 40.51 39.76 42.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.13 0.0 0.32 0.11 0.3 0.12 0.02 0.02 0.07 0.05 0.02
0.04 0.05 0.0 0.07 0.02 0.27 0.12 0.06 0.0 0.06 0.16 0.06
0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.16 0.0 0.04 0.11
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.04
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04
0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.19
0.32 0.31 0.16 0.4 0.14 0.61 0.07 0.79 0.28 0.55 0.16 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.78 0.15 0.32 0.19 0.06 0.42 0.13 0.16 0.23 0.2 0.45 0.37
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02
0.4 0.19 0.04 0.34 0.16 0.81 0.26 0.53 0.37 0.41 0.31 0.3
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.04 0.07
0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.06 0.02 0.1 0.0 0.09
0.0 0.06 0.02 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
0.04 0.04 0.0 0.06 0.02 0.02 0.08 0.02 0.0 0.0 0.04 0.19
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.27 0.14 0.22 0.31 0.29 0.46 0.53 0.65 0.32 0.24 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.04 0.13 0.04 0.13 0.14 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.18 0.05 0.02 0.05 0.08
0.22 0.34 0.32 0.3 0.35 0.63 0.41 0.19 0.6 0.4 0.67 0.64
0.18 0.04 0.11 0.04 0.16 0.25 0.02 0.41 0.05 0.0 0.11 0.08
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04
0.57 0.32 0.53 0.34 0.32 0.49 0.27 1.12 0.55 0.58 0.56 0.41
0.39 0.8 0.52 0.22 0.22 0.85 0.44 1.84 0.28 0.98 0.66 0.23
0.04 0.02 0.02 0.02 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
51.17 27.84 23.19 25.78 24.15 27.67 24.71 21.25 27.3 23.83 30.17 23.18
0.0 0.16 0.0 0.13 0.07 0.0 0.19 0.27 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.12 0.0 0.18 0.0 0.0 0.24
0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04
0.92 0.16 0.05 0.23 0.0 0.25 0.2 0.21 0.0 0.12 0.05 0.06
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.12 0.49 0.96 0.92 0.77 1.1 0.59 0.43 0.44 0.79 1.16 0.89
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.22
0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.06
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.22 0.05 0.0 0.29 0.0 0.3 0.0 0.08 0.19 0.02 0.22 0.04
1.27 0.57 0.51 0.18 0.25 0.04 0.15 0.2 0.33 0.21 0.66 1.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)