Heatmap: Cluster_41 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.26 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.62 0.56 0.16 0.3 1.0
0.33 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.18 0.91 0.16 0.58 0.32 1.0
1.0 0.78 0.66 0.72 0.57 0.8 0.69 0.82 0.86 0.7 0.82 0.86
0.25 0.22 0.04 0.08 0.0 0.17 0.43 0.53 0.5 0.3 0.3 1.0
0.28 0.41 0.07 0.92 0.16 1.0 0.08 0.24 0.24 0.52 0.32 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.81 1.0
0.11 0.0 0.05 0.38 0.08 0.3 0.32 1.0 0.57 0.53 0.31 0.25
1.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.44 0.16 0.1 0.36 0.15 0.0 0.34
0.0 0.8 0.88 0.56 0.0 0.0 0.82 0.23 0.99 0.47 0.61 1.0
1.0 0.29 0.0 0.25 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.99
0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 1.0
0.3 0.0 0.67 0.23 0.16 0.42 0.29 0.54 0.38 0.13 0.38 1.0
1.0 0.56 0.4 0.51 0.53 0.62 0.57 0.47 0.49 0.58 0.62 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.54 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0
0.47 0.05 0.05 0.05 0.05 0.0 0.18 0.46 0.0 0.21 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88
0.0 0.0 0.53 0.3 0.19 1.0 0.92 0.29 0.0 0.24 0.13 0.38
0.66 0.7 0.66 0.76 0.81 0.75 0.82 1.0 0.94 0.67 0.69 0.66
0.54 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 1.0
0.54 0.47 0.43 0.3 0.38 1.0 0.32 0.56 0.44 0.78 0.37 0.85
0.79 0.65 0.31 0.53 0.53 1.0 0.5 0.49 0.81 0.65 0.48 0.87
0.39 0.58 0.0 0.44 0.13 0.94 0.56 1.0 0.28 0.83 0.58 0.47
0.1 0.33 0.0 0.18 0.16 0.5 0.51 1.0 0.05 0.72 0.41 0.49
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31
0.57 0.16 0.0 0.28 0.0 1.0 0.48 0.0 0.28 0.0 0.0 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.78 0.0 0.38 0.17 0.94 0.0 0.9 1.0 0.62 0.17 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
1.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.7 0.0 0.0 0.87 0.14 0.0 0.74
0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.75 0.0
0.0 0.12 0.2 0.8 0.3 1.0 0.25 0.11 0.21 0.45 0.41 0.25
0.0 0.27 0.0 0.6 0.0 1.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.49 0.57
0.0 0.0 0.22 0.64 0.0 0.79 0.25 0.0 0.11 0.0 1.0 0.54
0.44 0.28 0.22 0.29 0.3 1.0 0.18 0.09 0.0 0.27 0.1 0.61
0.0 0.31 0.26 0.47 0.0 0.99 0.31 1.0 0.55 0.57 0.14 0.5
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.45 0.0 0.17 0.0 0.23 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.42 0.46 0.28 0.42 0.27 1.0 0.58 0.54 0.44 0.4 0.29 0.67
0.75 0.45 0.49 0.45 0.4 1.0 0.53 0.82 0.83 0.58 0.54 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.84 0.71 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.25 0.93
0.2 1.0 0.1 0.22 0.39 0.95 0.75 0.11 0.0 0.35 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 1.0
0.46 0.24 0.48 0.6 0.37 0.71 0.52 0.59 0.42 0.75 1.0 0.72
0.23 0.59 0.0 0.67 0.42 0.32 0.53 1.0 0.29 0.27 0.57 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.36 0.43
0.22 0.23 0.0 0.05 0.0 0.0 0.07 0.06 0.16 0.13 0.16 1.0
0.29 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.15 0.8 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 1.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.15 0.0 0.17 0.19 1.0
0.0 0.67 0.23 0.88 0.68 1.0 0.57 0.3 0.24 0.4 0.91 0.17
1.0 0.25 0.0 0.09 0.0 0.71 0.0 0.0 0.07 0.0 0.3 0.58
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.49 0.49 0.0 0.22 0.0 1.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.15 0.03 0.15 0.26 0.04 0.28 0.0 0.49 0.25 0.11 0.72
0.07 0.08 0.33 0.17 0.14 1.0 0.15 0.3 0.3 0.68 0.77 0.33
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.87 0.62 0.42 0.0 0.27 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 1.0
0.0 0.4 0.12 0.0 0.0 1.0 0.0 0.13 0.48 0.13 0.98 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.88 0.14 0.19 0.23 0.75 1.0 0.76 0.96 0.22 0.24 0.18
1.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.59 0.34 0.29 0.25 0.0 0.35 0.0
0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.27 0.59 1.0 0.32
0.31 0.34 0.17 0.39 0.38 0.74 0.56 1.0 0.66 0.79 0.42 0.65
0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.6 0.81 0.0 0.38 0.13 0.37 0.56 0.22 1.0 0.48 0.71 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.33 0.38 0.56 0.59 0.28 0.16 0.99 0.96 0.62 0.75 0.79 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.38 0.15 0.0 0.14 0.0 0.14 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.96 0.88 0.87 0.79 0.85 0.89 0.91 0.99 1.0 0.92 0.9 0.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 1.0
0.0 0.42 0.0 1.0 0.35 0.93 0.39 0.06 0.05 0.23 0.15 0.07
0.13 0.18 0.0 0.25 0.09 1.0 0.45 0.23 0.0 0.22 0.59 0.23
0.46 0.33 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 1.0 0.0 0.22 0.67
0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.44 0.55
0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 1.0
0.19 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.11 0.09 1.0
0.33 0.31 0.16 0.41 0.14 0.63 0.07 0.8 0.29 0.56 0.16 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
1.0 0.19 0.42 0.25 0.07 0.54 0.16 0.21 0.29 0.26 0.58 0.47
0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.7 0.88 0.0 0.88
0.49 0.23 0.04 0.41 0.2 1.0 0.32 0.65 0.46 0.51 0.39 0.37
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.23 0.41 0.76
0.36 0.21 0.0 0.17 0.0 0.0 0.6 0.62 0.18 1.0 0.0 0.88
0.0 0.32 0.09 0.36 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.19 0.2 0.0 0.34 0.09 0.12 0.41 0.11 0.0 0.0 0.19 1.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.41 0.21 0.34 0.49 0.45 0.72 0.82 1.0 0.5 0.37 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.53 0.15 0.53 0.57 0.0
0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.13 1.0 0.28 0.12 0.29 0.46
0.32 0.51 0.47 0.45 0.52 0.93 0.61 0.28 0.89 0.6 1.0 0.95
0.44 0.09 0.28 0.09 0.39 0.61 0.05 1.0 0.13 0.0 0.26 0.21
0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 1.0
0.51 0.28 0.47 0.3 0.29 0.43 0.24 1.0 0.49 0.51 0.5 0.36
0.21 0.43 0.28 0.12 0.12 0.46 0.24 1.0 0.15 0.53 0.36 0.13
0.21 0.11 0.1 0.13 0.0 0.37 0.0 0.11 0.0 0.0 0.32 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62
1.0 0.54 0.45 0.5 0.47 0.54 0.48 0.42 0.53 0.47 0.59 0.45
0.0 0.6 0.0 0.49 0.26 0.0 0.71 1.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.0 0.34 0.0 0.34 0.0 0.0 0.5 0.0 0.73 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.74 0.74 0.0 1.0 0.0 0.0 0.82 0.74 0.92
1.0 0.18 0.06 0.25 0.0 0.27 0.22 0.23 0.0 0.14 0.06 0.07
0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.23 0.45 0.43 0.36 0.52 0.28 0.2 0.21 0.37 0.55 0.42
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.33 0.64 0.0 0.0 0.0 1.0
0.24 0.0 0.0 0.11 0.0 1.0 0.0 0.0 0.7 0.59 0.0 0.42
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.56 0.0 0.47 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0
0.72 0.18 0.0 0.99 0.0 1.0 0.0 0.27 0.65 0.07 0.74 0.15
1.0 0.45 0.4 0.14 0.2 0.03 0.12 0.15 0.26 0.17 0.52 0.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.98 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)