Heatmap: Cluster_197 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
102690	-0.21	-0.17	-0.3	0.09	-0.29	0.15	-0.13	0.12	0.23	0.24	0.09	0.04
105050	-0.29	-0.23	0.03	0.23	-0.28	-0.23	-0.26	-0.23	0.35	0.29	0.33	0.04
107776	-0.19	-0.22	0.11	-0.06	-0.02	-0.04	-0.04	0.07	0.13	0.12	0.02	0.08
110102	-0.03	-0.22	-0.13	-0.02	0.34	-0.45	0.07	0.17	-0.05	0.27	-0.01	-0.1
123924	-0.29	-0.46	0.13	-0.07	0.04	-0.08	0.06	0.15	0.19	0.18	0.13	-0.12
123930	-0.18	-0.19	0.05	-0.01	-0.01	0.02	-0.02	0.07	0.12	0.06	0.04	0.0
130246	-0.89	-0.09	0.73	-0.03	-0.55	0.15	-0.19	-0.6	0.48	0.29	0.16	-0.26
141647	-0.42	-0.7	-0.1	0.13	0.03	-0.12	-0.38	0.26	0.46	0.17	0.29	-0.04
16302	-0.07	-0.66	0.06	0.04	0.11	-0.34	0.02	-0.19	0.24	0.06	0.33	0.13
163550	-0.2	-0.26	-0.04	-0.08	-0.04	0.41	-0.02	0.23	0.11	0.0	0.09	-0.37
16626	0.06	-0.2	-0.1	0.01	-0.0	0.05	-0.06	-0.01	0.17	0.13	0.05	-0.14
168147	-0.13	-0.19	-0.16	-0.03	0.05	0.17	-0.02	0.04	-0.02	0.11	0.14	-0.01
171422	-0.25	-0.38	-0.03	-0.01	-0.02	0.06	-0.03	0.14	0.16	0.12	0.19	-0.05
174721	-0.07	-0.16	-0.08	-0.14	0.1	-0.0	0.16	-0.15	0.25	-0.02	0.03	0.01
181394	0.06	0.04	-0.04	-0.11	0.05	0.08	-0.01	-0.04	0.07	-0.02	0.01	-0.11
21200	-0.19	-0.82	-0.16	-0.32	0.01	0.05	-0.1	0.25	0.2	0.67	0.02	-0.09
227279	-0.08	-0.35	0.05	-0.05	-0.01	0.18	-0.04	0.02	0.15	0.2	-0.03	-0.12
230443	0.3	-0.29	0.02	-0.05	0.12	0.13	-0.09	-0.02	0.21	-0.19	-0.06	-0.18
266879	-0.15	-0.17	-0.04	0.02	-0.01	-0.02	-0.28	0.03	0.21	0.08	0.19	0.07
270695	0.2	-0.16	-0.16	-0.27	-0.0	0.03	0.04	0.08	0.25	0.04	-0.06	-0.07
28310	-0.23	-0.35	-0.22	0.12	0.25	0.14	-0.21	0.11	0.07	0.07	0.02	0.1
31681	0.11	-0.49	0.11	-0.27	-0.22	-0.22	0.02	0.3	0.35	0.3	-0.07	-0.17
32366	-0.25	-0.43	-0.06	-0.16	-0.03	0.03	0.01	0.11	0.23	0.33	0.07	-0.01
33215	-0.49	-0.4	0.01	-0.1	-0.0	-0.09	-0.11	0.14	0.29	0.32	0.15	0.05
34087	-0.34	-0.16	0.04	-0.0	-0.03	-0.13	-0.02	-0.05	0.27	0.11	0.12	0.09
402167	1.34	0.01	-	0.53	-	0.74	-0.52	-1.49	-1.69	1.47	-1.2	-0.37
403152	-1.57	-0.96	-0.32	0.15	0.02	0.83	-0.33	-	-0.56	0.91	1.05	0.03
403683	-0.34	-0.56	-0.13	0.15	0.08	0.0	-0.1	0.17	0.2	0.23	0.12	-0.04
404204	-1.97	-1.93	-0.96	-1.05	-1.76	-0.0	0.28	0.88	0.84	1.08	0.26	0.05
404646	0.22	-0.96	0.41	-0.72	-0.9	-0.13	0.06	0.41	0.29	0.44	0.2	-0.23
407718	-0.13	-0.42	-0.27	-0.17	-0.12	0.23	-0.19	0.18	0.32	0.32	0.12	-0.1
408760	-0.07	-0.12	-0.11	-0.04	0.06	0.12	-0.05	0.0	-0.04	0.17	0.03	0.02
408831	0.25	-0.26	-0.06	-0.19	-0.21	0.05	0.07	-0.13	0.21	0.18	0.14	-0.17
410487	-0.35	-1.24	-0.59	-1.56	-3.81	0.78	0.01	0.31	0.63	1.16	0.4	-0.62
412814	-0.71	-0.88	-0.07	0.13	0.09	0.07	0.16	0.15	0.3	0.25	0.18	-0.14
415024	-0.3	-0.24	0.07	-0.06	0.12	-0.21	0.09	0.05	0.15	0.17	-0.0	0.06
417558	-0.38	-0.32	0.0	0.12	-0.29	0.34	0.05	-0.17	0.19	0.24	-0.04	0.05
420794	-0.05	-0.42	-0.25	-0.17	0.23	-0.35	-0.25	0.38	0.16	0.41	-0.47	0.37
421301	-1.34	-0.1	-0.22	0.05	-0.18	0.39	0.04	-0.51	0.3	0.4	0.36	0.02
421349	-0.07	-0.54	-0.42	-0.48	0.08	0.23	0.3	-0.27	0.49	0.38	-0.12	-0.03
421987	-0.27	-0.38	-0.01	-0.29	0.09	-0.24	0.04	0.17	0.22	0.33	0.27	-0.16
423537	0.83	-2.29	-1.08	-2.61	-3.48	0.3	0.5	0.78	1.2	1.18	-1.48	-
425086	-0.32	-0.76	-0.78	-0.7	0.13	0.15	-0.06	0.25	0.59	0.5	-0.07	0.25
425439	-0.43	-0.4	0.14	-0.16	-0.03	-0.13	-0.13	0.15	0.31	0.26	0.12	0.09
426337	0.12	-0.5	0.42	-1.55	-0.34	-0.32	0.58	-1.39	0.53	1.02	0.48	-2.32
429445	0.25	-0.6	-0.59	-0.67	-0.3	-0.08	-0.27	0.17	0.35	0.98	-0.23	0.06
430172	0.2	-0.16	0.05	-0.01	-0.22	-0.44	-0.03	0.1	0.07	0.2	0.25	-0.16
431374	-0.03	-0.1	-0.06	0.02	0.09	-0.06	-0.02	0.09	0.02	0.06	0.01	-0.04
437438	-0.65	-0.79	-0.21	-0.11	0.17	-0.32	0.04	0.44	0.45	0.19	0.23	0.01
437992	-0.23	-0.11	-0.03	-0.01	0.04	0.02	0.04	0.09	-0.08	0.16	0.09	-0.02
438037	-0.06	-0.24	0.01	-0.06	0.02	0.03	0.06	0.04	0.07	0.08	0.03	0.0
439080	-0.13	-0.19	0.12	-0.07	-0.06	-0.03	-0.05	-0.01	0.17	0.09	0.12	-0.02
440615	-0.0	-0.15	-0.15	-0.1	-0.13	-0.04	0.11	0.07	0.1	0.18	0.07	-0.02
441822	-0.05	0.09	-0.17	-0.0	0.02	-0.0	-0.07	-0.08	0.09	0.26	-0.02	-0.12
442173	-0.09	-0.02	-0.05	0.01	0.01	-0.01	-0.14	-0.04	0.08	0.19	-0.03	0.05
444701	-0.12	-0.28	0.15	-0.01	0.02	-0.04	-0.12	0.0	0.19	0.11	0.08	-0.04
445321	0.12	-0.23	0.1	-0.15	0.17	0.18	-0.1	-0.02	0.13	-0.12	-0.09	-0.06
448992	-0.03	-0.21	0.03	0.05	0.16	-0.17	0.08	0.15	-0.06	-0.03	-0.03	0.03
59269	0.42	-0.09	0.08	-0.42	-1.27	0.2	-0.16	-0.61	0.36	0.61	-0.02	-0.0
67251	-0.16	0.0	0.0	-0.18	-0.18	-0.08	-0.06	0.12	0.09	0.31	0.02	0.04
68983	-0.54	-1.39	-2.03	-0.62	-0.16	0.74	-0.12	0.17	0.41	0.73	0.37	0.19
72200	0.04	-0.76	0.1	-0.27	0.08	-0.02	0.16	0.01	0.3	0.44	-0.18	-0.23
74498	0.1	-0.16	-0.05	-0.02	-0.01	0.15	-0.07	0.02	0.1	0.03	-0.01	-0.1
75660	-0.08	-0.11	-0.02	0.0	0.03	0.04	-0.0	-0.03	0.02	0.13	0.05	-0.05
76630	-0.24	-0.32	-0.71	-0.01	0.02	0.17	-0.23	0.08	0.58	0.37	0.13	-0.27
76771	-0.04	-0.35	-0.22	-0.25	-0.11	-0.2	-0.02	-0.11	0.5	0.08	0.62	-0.27
78532	-0.0	-0.31	0.2	-0.17	0.1	0.32	-0.13	-0.08	0.15	0.01	0.03	-0.24
79159	-0.31	-0.1	-0.06	0.02	0.07	0.02	-0.18	0.03	0.14	0.11	0.15	0.04
84199	-0.12	-0.15	-0.19	-0.07	-0.07	0.19	-0.05	-0.35	0.25	0.05	0.39	-0.03
90722	0.14	-0.19	0.08	-0.16	0.13	0.23	-0.1	-0.04	0.17	-0.07	-0.03	-0.24
98472	0.18	-0.24	0.05	-0.07	-0.12	-0.27	0.11	-0.05	0.24	0.26	-0.07	-0.13
99105	-0.08	-0.08	0.02	-0.13	-0.1	0.15	-0.05	0.09	0.18	0.13	-0.06	-0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.