Heatmap: Cluster_71 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.63 -1.15 0.47 -0.3 -0.32 0.14 0.97 0.2 0.2 0.21 -0.34 -0.77
-0.33 -0.27 0.24 -0.29 0.18 0.27 0.19 -0.16 0.18 0.01 0.04 -0.28
-0.35 -0.46 0.09 -0.17 0.27 0.4 0.22 0.06 0.13 -0.17 0.03 -0.32
-0.27 -0.01 0.08 0.23 0.05 0.09 0.07 -0.01 -0.04 -0.04 0.01 -0.24
-0.28 -0.18 -0.01 -0.03 -0.08 0.13 0.06 0.14 0.26 0.03 -0.02 -0.1
-0.44 -0.35 0.14 -0.03 0.2 0.24 0.35 -0.16 0.01 0.15 -0.08 -0.25
-0.56 -0.55 -0.03 -0.26 -0.17 0.26 0.56 0.25 0.34 0.19 -0.1 -0.44
-0.06 -0.43 0.4 -0.07 -0.28 0.38 0.69 -0.26 0.44 -0.6 -0.22 -0.81
-0.74 -0.96 -0.34 -0.23 -0.13 0.29 1.22 -0.5 0.79 0.19 -0.38 -1.24
-0.07 -0.61 -0.07 0.01 0.26 0.17 0.42 0.16 -0.18 0.01 -0.17 -0.19
-0.61 -0.43 0.07 0.02 0.38 0.26 0.2 0.26 0.02 -0.01 -0.16 -0.34
-0.36 0.21 1.09 -0.69 -1.11 0.22 0.05 -0.89 -1.05 0.27 0.79 -0.53
-0.14 -0.17 -0.09 -0.0 0.26 0.16 0.08 0.07 -0.08 0.11 -0.08 -0.19
-0.13 -0.12 0.21 -0.05 -0.06 0.3 0.09 -0.24 0.11 0.03 0.02 -0.27
-0.16 -0.23 0.07 -0.03 -0.0 0.14 0.29 -0.15 0.08 0.04 0.06 -0.19
-0.31 0.05 0.26 0.23 0.16 0.05 0.1 -0.0 -0.09 -0.08 -0.2 -0.29
-0.05 -0.04 0.03 0.06 0.03 0.1 0.05 -0.01 0.04 0.04 -0.08 -0.18
-0.05 -0.15 0.15 -0.06 0.05 0.15 0.2 -0.16 0.03 -0.02 -0.07 -0.12
-0.29 -0.41 0.26 -0.33 -0.13 0.23 0.53 -0.35 0.54 -0.09 0.01 -0.46
0.03 -0.26 0.13 -0.15 0.12 0.19 -0.02 -0.11 -0.03 0.09 -0.07 0.02
-0.18 -0.14 0.07 -0.1 -0.09 0.12 0.22 -0.15 0.13 0.16 0.01 -0.13
-0.26 -0.02 0.1 0.29 0.33 0.14 0.05 -0.14 -0.24 0.05 -0.04 -0.43
-0.12 -0.14 0.11 -0.12 0.06 0.18 0.12 -0.04 0.13 0.09 -0.12 -0.22
-0.5 -0.32 -0.07 0.01 0.04 0.12 0.14 0.06 0.16 0.23 0.11 -0.15
-0.21 -0.48 0.03 -0.29 -0.13 0.19 0.43 0.17 0.26 0.0 -0.15 -0.07
-0.61 -0.57 0.08 -0.15 -0.19 0.15 0.6 0.11 0.34 0.21 -0.15 -0.32
-0.3 -0.4 0.3 -0.31 -0.15 0.12 0.84 -0.39 0.25 0.3 -0.28 -0.69
-0.46 -0.67 -0.17 -0.42 -0.02 0.2 0.68 -0.19 0.74 0.05 -0.11 -0.4
0.02 -0.05 0.09 -0.05 0.01 0.04 0.12 -0.19 0.05 0.03 0.02 -0.13
-0.0 -0.56 0.46 -0.26 0.15 0.21 0.19 -0.27 0.16 0.0 -0.13 -0.23
-0.02 -0.52 -0.01 -0.17 -0.16 0.03 0.09 0.18 0.17 0.32 0.14 -0.23
0.04 -0.07 0.08 0.0 0.06 0.09 0.19 -0.12 0.08 -0.07 -0.17 -0.17
-0.5 -0.31 -0.01 0.09 0.22 0.21 0.25 0.02 0.04 0.15 -0.05 -0.3
-0.2 -0.44 0.14 -0.11 -0.03 0.31 0.2 -0.08 0.2 -0.04 0.04 -0.15
-0.15 -0.28 -0.04 -0.19 -0.03 0.14 0.13 0.05 0.07 0.15 0.12 -0.03
-0.38 -0.27 0.28 -0.14 -0.18 -0.08 0.37 -0.44 0.35 0.15 0.29 -0.27
-0.04 - -2.43 -0.81 - -0.14 1.2 1.23 0.69 0.8 -0.14 -1.11
-0.35 -0.15 -0.14 -0.19 0.19 0.01 -0.15 0.14 0.18 -0.02 0.2 0.15
-0.29 -0.17 -0.11 0.11 0.25 0.1 0.35 -0.02 0.2 0.08 -0.41 -0.29
-1.86 -0.68 0.07 0.48 0.42 0.32 0.78 -0.23 0.14 0.28 -0.68 -0.84
-0.21 -0.32 -0.23 -0.25 -0.46 0.42 0.1 -0.12 0.54 0.24 -0.32 0.19
- - 2.36 - -0.05 - - - - 1.6 1.52 -
-0.72 -0.4 0.02 -0.04 -0.09 0.01 0.24 0.37 -0.05 0.14 0.23 0.0
0.32 -0.13 0.8 0.05 0.05 -0.31 -0.27 0.13 -1.23 -0.11 -0.26 0.14
-0.5 -0.34 -0.06 -0.14 0.16 -0.07 0.29 0.18 0.11 0.24 -0.03 -0.07
-0.58 -1.43 -0.34 -0.76 -0.62 0.07 0.76 0.55 0.55 0.2 -0.64 0.54
-0.81 -0.37 -0.18 -0.12 0.24 0.26 0.24 0.07 -0.08 0.27 0.05 0.08
-0.31 -0.21 0.01 -0.1 0.14 0.15 0.25 -0.06 0.14 0.06 0.09 -0.27
-0.09 0.11 0.16 -0.02 -0.19 0.03 0.25 -0.11 0.17 0.06 -0.18 -0.29
-0.48 -0.35 0.2 -0.05 -0.42 0.28 0.1 0.0 0.3 0.2 0.03 -0.07
-0.85 -0.95 0.16 -0.26 -0.35 0.21 0.26 0.62 0.18 -0.19 0.01 0.35
-1.71 -0.74 0.2 -0.38 -1.17 0.11 1.37 0.21 1.14 -0.7 -0.35 -1.7
-1.15 -0.84 -0.08 -0.61 -0.62 0.21 1.18 -0.12 0.45 0.65 -0.32 -0.61
-1.04 -0.92 -0.83 -0.39 -0.14 -0.2 0.98 0.37 0.5 0.44 0.13 -0.42
-0.18 -0.39 -0.01 -0.12 0.17 0.49 0.36 0.02 0.02 0.15 -0.37 -0.48
0.4 -0.88 0.98 -4.26 -0.57 -0.78 0.45 -0.3 0.24 0.21 0.51 -0.12
-0.51 -0.26 -0.18 -0.2 0.21 0.38 0.3 0.06 -0.05 0.17 0.04 -0.22
-0.62 -0.04 -0.46 0.51 0.76 0.4 0.92 -0.55 -0.06 0.16 -1.62 -2.08
-0.14 -1.65 1.25 -0.75 -0.61 0.22 0.67 -1.01 -0.8 -0.16 0.49 0.03
0.23 -0.66 0.51 -0.22 0.14 -0.3 0.65 -0.41 0.08 0.23 -0.42 -0.53
0.07 -0.23 0.11 -0.15 -0.09 0.07 0.34 0.09 0.04 0.03 -0.11 -0.29
-0.49 -0.53 -0.04 -0.19 0.43 -0.01 0.7 -0.36 0.05 0.22 0.02 -0.34
-0.45 -0.43 0.13 -0.23 -0.19 0.21 0.78 -0.09 0.38 0.02 -0.24 -0.46
-0.19 -0.31 0.3 -0.13 0.1 0.29 0.26 -0.26 0.11 -0.02 -0.12 -0.22
-0.12 -0.54 -0.33 -0.23 0.13 0.06 0.14 0.26 0.27 0.01 0.04 0.09
-0.35 -0.31 0.17 0.02 0.19 -0.03 0.23 0.08 0.06 0.1 -0.08 -0.23
-0.45 -0.34 -0.02 -0.07 0.04 0.03 0.03 0.07 0.36 0.18 0.02 -0.01
-0.29 -0.29 0.12 -0.13 0.12 0.17 0.27 -0.05 0.07 0.01 -0.05 -0.06
-0.05 -0.29 -0.22 -0.16 0.04 0.1 0.14 0.13 0.09 0.22 0.09 -0.18
-0.43 -1.43 -0.16 -0.73 -0.35 -0.14 0.93 -0.09 0.53 0.48 0.25 -0.28
-0.17 -0.45 0.18 -0.21 -0.08 0.03 0.38 -0.32 0.27 0.25 0.13 -0.28
-0.2 -0.3 -0.04 -0.07 -0.09 0.07 0.18 0.11 0.13 0.14 0.03 -0.04
-0.04 -0.39 0.01 -0.18 0.13 0.1 0.13 0.05 -0.04 0.19 -0.04 -0.01
-0.05 -0.13 0.34 -0.39 -0.09 -0.01 0.27 -0.04 0.15 0.1 -0.19 -0.1
-0.4 -0.44 0.27 0.04 -0.21 0.22 0.25 -0.13 0.34 0.2 -0.16 -0.28
0.0 -0.23 -0.19 -0.36 -0.01 0.1 0.12 0.06 0.24 0.09 0.02 0.03
-0.16 -0.28 0.01 -0.27 0.2 0.06 -0.02 -0.09 0.14 0.08 0.22 0.0
-0.44 -2.1 - -0.54 -3.1 0.47 1.31 1.01 0.64 0.99 - -0.32
-0.26 -0.27 0.08 -0.13 -0.04 0.05 0.35 0.01 0.13 0.21 -0.06 -0.21
-0.16 -0.6 -0.43 -0.12 0.1 0.14 0.69 -0.23 0.37 0.45 -0.34 -0.53
-0.05 -0.7 0.25 -0.88 -0.56 0.1 0.49 0.31 -0.11 -0.03 0.1 0.39
-0.38 -0.7 0.52 -0.57 0.18 0.25 0.38 -0.04 0.54 -0.16 -0.13 -0.62
-0.19 -0.12 -0.06 -0.01 0.21 0.12 0.18 -0.06 0.07 -0.0 -0.05 -0.16
-0.32 -0.17 -0.09 -0.18 -0.24 0.07 0.54 -0.16 0.33 0.33 -0.05 -0.38
-0.21 -0.23 -0.06 0.01 0.1 0.14 0.28 -0.09 -0.01 0.12 0.02 -0.16
-0.52 -0.45 0.32 -0.26 0.21 0.35 0.64 -0.11 0.27 -0.02 -0.45 -0.63
-0.24 -0.36 0.06 -0.01 0.11 0.21 0.1 -0.04 0.11 0.09 -0.03 -0.09
-0.17 0.18 0.81 -0.04 -1.18 -0.18 0.94 -0.57 -1.2 -0.58 0.12 0.22
-0.5 -0.13 -0.35 0.08 0.35 0.34 0.07 0.1 0.01 0.05 -0.07 -0.18
-0.29 -0.5 0.26 -0.14 -0.26 -0.08 0.38 -0.16 0.36 0.1 0.05 -0.01
-0.32 -0.18 -0.03 0.19 0.17 0.25 0.05 -0.14 0.08 0.06 0.01 -0.28
-0.63 -0.83 0.07 -0.23 0.06 0.29 0.86 -0.03 0.42 0.22 -0.43 -0.79
0.07 -0.57 0.18 -0.56 -0.43 0.42 0.08 -0.03 0.34 0.34 -0.17 -0.12
0.11 -0.42 0.37 -0.25 -0.08 0.28 0.29 -0.19 0.02 0.12 -0.06 -0.48
-0.3 -0.65 0.64 -0.04 0.1 -0.02 0.56 -0.47 0.25 0.12 -0.33 -0.54
-0.1 -0.29 0.08 -0.28 0.27 0.41 0.22 -0.14 -0.04 -0.02 -0.1 -0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.