1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_20 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.5 0.27 0.46 0.5 1.29 0.22 0.34 0.4 0.79 0.71 0.74 0.64
60.31 57.35 61.77 60.77 68.67 61.37 66.16 59.58 58.43 52.26 55.01 52.84
0.78 0.89 1.52 0.75 0.92 0.78 1.01 0.94 0.95 0.9 0.78 0.96
0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.08 0.76 0.26 0.23 0.12 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.15 0.0 0.09 1.99 0.2 0.28 0.27 0.23 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.02 0.02 0.06 0.09 0.0 0.02 0.02
0.11 0.1 0.28 0.04 0.13 0.02 0.05 0.0 0.0 0.06 0.22 0.13
0.46 0.44 0.94 0.46 1.08 0.71 0.69 0.38 0.33 0.43 0.48 0.41
3.36 4.17 8.41 5.53 5.97 3.85 4.21 4.21 3.57 4.67 3.67 3.12
3.34 3.35 3.01 2.63 10.55 2.91 6.7 4.82 4.65 2.63 3.21 2.28
0.89 1.19 0.14 0.88 5.71 0.77 2.57 1.72 1.85 2.21 2.91 1.57
1.29 1.05 1.95 1.21 1.57 0.83 1.08 1.12 0.78 1.55 1.62 1.73
0.04 0.0 0.0 0.13 0.67 0.02 0.02 0.05 0.03 0.0 0.21 0.02
6.22 5.52 8.71 5.79 7.47 4.65 3.77 4.83 5.73 5.49 5.99 4.58
0.04 0.04 0.0 0.0 0.57 0.16 0.02 0.07 0.05 0.0 0.0 0.0
21.19 20.69 22.75 20.87 29.39 20.09 23.53 24.39 21.8 22.99 23.91 20.46
0.57 0.75 0.35 1.06 1.92 1.01 0.66 0.47 0.73 0.48 0.62 0.79
0.25 0.09 0.0 0.03 1.15 0.11 0.06 0.08 0.02 0.32 0.19 0.15
0.25 0.16 0.27 0.13 0.44 0.07 0.28 0.06 0.3 0.12 0.13 0.19
0.04 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.07 0.02 0.19 0.12 0.02 0.06
0.0 0.0 0.0 0.04 0.51 0.02 0.06 0.06 0.07 0.02 0.02 0.02
0.07 0.07 0.17 0.12 0.51 0.07 0.08 0.07 0.05 0.06 0.04 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.04 0.02 0.05 0.08 0.57 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.2 0.0
0.18 0.06 0.29 0.11 0.37 0.04 0.13 0.0 0.11 0.1 0.24 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.79 1.0 1.8 0.66 1.21 0.89 0.62 1.05 0.39 0.84 1.04 1.37
0.04 0.1 0.14 0.09 0.21 0.07 0.09 0.08 0.03 0.07 0.09 0.0
0.04 0.08 1.15 0.32 0.54 0.0 0.4 0.02 0.33 0.08 0.3 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.02 0.02 0.76 0.0 0.12 0.02 0.16 0.19 0.02 0.02
0.0 0.0 0.29 0.16 0.42 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0
0.64 0.88 0.83 1.6 4.1 2.03 1.48 0.63 1.37 1.75 1.58 1.12
0.04 0.0 0.0 0.05 0.41 0.19 0.07 0.0 0.14 0.04 0.04 0.04
0.04 0.29 0.84 0.44 1.13 0.51 0.6 0.53 0.35 0.53 0.33 0.51
0.0 0.0 0.5 0.0 0.43 0.02 0.22 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0
0.18 0.24 0.28 0.15 1.54 0.42 0.68 0.48 0.25 0.81 0.53 0.38
0.0 0.02 0.0 0.04 0.32 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.02 0.0 0.25 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06
0.14 0.07 0.0 0.05 0.75 0.07 0.38 0.1 0.32 0.1 0.13 0.08
0.0 0.11 0.05 0.0 1.79 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.22 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.52 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04
0.0 0.0 0.02 0.04 0.14 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.25 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.57 0.0 0.24 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.12 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.08 0.2 0.12 0.67 0.0 0.09 0.04 0.02 0.1 0.11 0.02
0.0 0.04 0.41 0.06 0.32 0.09 0.08 0.14 0.07 0.04 0.08 0.17
0.21 0.04 0.49 0.24 0.34 0.18 0.06 0.16 0.14 0.0 0.09 0.17
0.18 0.0 0.0 0.08 0.72 0.11 0.17 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04
0.04 0.0 0.05 0.02 0.5 0.04 0.0 0.04 0.05 0.02 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.43 0.3 1.1 0.35 0.82 0.33 0.63 0.31 0.49 0.59 0.14 0.54
0.28 0.37 1.23 0.4 1.19 0.02 0.19 0.26 0.57 0.71 0.29 0.53
0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.53 0.04 0.55 0.03 2.45 0.47 0.89 0.69 0.42 0.21 0.34 0.04
0.04 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.15 2.37 4.19 2.95 5.9 3.6 3.37 3.04 3.39 3.92 2.99 3.01
0.32 0.4 0.21 0.37 1.37 0.07 0.36 0.32 0.32 0.25 0.15 0.51
0.47 0.44 0.79 0.82 0.68 0.3 1.01 0.52 0.41 0.33 0.57 0.56
1.07 0.6 1.9 1.36 1.81 1.54 1.86 1.09 1.05 0.49 0.54 0.84
0.0 0.0 0.0 0.05 0.45 0.0 0.08 0.13 0.02 0.04 0.0 0.06
0.04 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06
0.0 0.0 0.02 0.0 0.39 0.07 0.02 0.0 0.03 0.0 0.04 0.06
0.18 0.09 0.0 0.27 0.34 0.11 0.09 0.08 0.07 0.12 0.05 0.09
1.85 1.23 1.28 1.55 2.46 1.43 1.63 1.5 1.58 1.29 1.37 1.18
1.79 0.89 1.96 0.33 1.64 0.38 0.79 0.48 1.21 0.72 0.53 1.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.05 0.0 0.03 0.08 0.0 0.04
2.68 3.57 4.59 3.55 5.08 1.71 2.2 1.59 1.7 1.13 1.8 2.71
0.04 0.06 0.34 0.08 0.14 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.14 0.07
0.07 0.12 0.21 0.1 0.35 0.2 0.13 0.12 0.05 0.04 0.15 0.06
2.93 4.16 5.79 3.91 8.46 4.34 5.24 4.45 2.26 3.56 3.18 4.22
0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.08 0.36 0.07 0.09 0.04 0.04 0.12 0.09 0.2 0.17 0.11
7.35 7.49 9.06 8.48 11.93 7.61 9.9 8.35 7.61 10.75 9.97 7.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)