Heatmap: Cluster_20 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.39 0.21 0.36 0.39 1.0 0.17 0.26 0.31 0.61 0.55 0.57 0.5
0.88 0.84 0.9 0.89 1.0 0.89 0.96 0.87 0.85 0.76 0.8 0.77
0.52 0.58 1.0 0.49 0.6 0.51 0.67 0.62 0.62 0.59 0.51 0.63
0.33 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.11 1.0 0.34 0.3 0.16 0.0 0.03 0.02 0.0
0.0 0.07 0.0 0.04 1.0 0.1 0.14 0.13 0.12 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.1 0.3 0.43 0.0 0.09 0.1
0.39 0.37 1.0 0.14 0.46 0.08 0.17 0.0 0.0 0.22 0.81 0.47
0.43 0.4 0.87 0.42 1.0 0.66 0.64 0.35 0.31 0.4 0.44 0.38
0.4 0.5 1.0 0.66 0.71 0.46 0.5 0.5 0.42 0.56 0.44 0.37
0.32 0.32 0.29 0.25 1.0 0.28 0.64 0.46 0.44 0.25 0.3 0.22
0.16 0.21 0.02 0.15 1.0 0.13 0.45 0.3 0.32 0.39 0.51 0.27
0.66 0.54 1.0 0.62 0.81 0.42 0.56 0.58 0.4 0.8 0.83 0.89
0.05 0.0 0.0 0.2 1.0 0.03 0.04 0.07 0.05 0.0 0.32 0.03
0.71 0.63 1.0 0.67 0.86 0.53 0.43 0.56 0.66 0.63 0.69 0.53
0.06 0.07 0.0 0.0 1.0 0.28 0.04 0.12 0.09 0.0 0.0 0.0
0.72 0.7 0.77 0.71 1.0 0.68 0.8 0.83 0.74 0.78 0.81 0.7
0.3 0.39 0.18 0.55 1.0 0.52 0.34 0.24 0.38 0.25 0.32 0.41
0.21 0.08 0.0 0.03 1.0 0.1 0.05 0.07 0.02 0.28 0.17 0.13
0.57 0.37 0.6 0.3 1.0 0.16 0.63 0.14 0.67 0.28 0.28 0.44
0.1 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.19 0.06 0.54 0.32 0.05 0.18
0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.04 0.12 0.12 0.14 0.04 0.03 0.04
0.14 0.14 0.34 0.23 1.0 0.14 0.15 0.14 0.1 0.12 0.07 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.06 0.03 0.09 0.13 1.0 0.0 0.0 0.04 0.18 0.0 0.35 0.0
0.49 0.16 0.79 0.31 1.0 0.12 0.34 0.0 0.29 0.28 0.66 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0
0.44 0.55 1.0 0.37 0.68 0.5 0.34 0.59 0.22 0.47 0.58 0.76
0.17 0.47 0.66 0.4 1.0 0.34 0.41 0.38 0.16 0.31 0.4 0.0
0.03 0.07 1.0 0.28 0.47 0.0 0.35 0.02 0.29 0.07 0.26 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.02 0.02 1.0 0.0 0.16 0.03 0.21 0.25 0.02 0.03
0.0 0.0 0.69 0.38 1.0 0.0 0.0 0.25 0.13 0.0 0.0 0.0
0.16 0.21 0.2 0.39 1.0 0.5 0.36 0.15 0.33 0.43 0.38 0.27
0.09 0.0 0.0 0.13 1.0 0.45 0.17 0.0 0.35 0.1 0.09 0.1
0.03 0.25 0.74 0.39 1.0 0.45 0.53 0.47 0.31 0.47 0.29 0.45
0.0 0.0 1.0 0.0 0.85 0.04 0.44 0.04 0.07 0.04 0.0 0.0
0.12 0.15 0.18 0.1 1.0 0.27 0.44 0.31 0.16 0.53 0.34 0.25
0.0 0.05 0.0 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.06 0.06
0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.26
0.19 0.1 0.0 0.07 1.0 0.1 0.51 0.14 0.42 0.14 0.17 0.11
0.0 0.06 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.12 0.0
0.0 0.35 0.0 0.0 1.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08
0.0 0.0 0.12 0.25 1.0 0.17 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.24 0.0 0.0 1.0 0.0 0.24 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.42 0.0 0.12 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.64 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.12 0.3 0.17 1.0 0.0 0.13 0.06 0.03 0.16 0.16 0.03
0.0 0.09 1.0 0.16 0.79 0.21 0.2 0.34 0.17 0.1 0.19 0.42
0.44 0.08 1.0 0.48 0.69 0.36 0.12 0.33 0.28 0.0 0.18 0.34
0.25 0.0 0.0 0.12 1.0 0.15 0.23 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06
0.07 0.0 0.1 0.03 1.0 0.09 0.0 0.08 0.11 0.04 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
0.39 0.27 1.0 0.32 0.75 0.3 0.58 0.28 0.45 0.54 0.13 0.49
0.23 0.3 1.0 0.33 0.98 0.02 0.15 0.21 0.46 0.58 0.23 0.43
0.0 0.0 0.0 0.18 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.14 0.0
0.22 0.02 0.22 0.01 1.0 0.19 0.36 0.28 0.17 0.08 0.14 0.02
0.12 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.4 0.71 0.5 1.0 0.61 0.57 0.52 0.57 0.66 0.51 0.51
0.23 0.29 0.15 0.27 1.0 0.05 0.26 0.23 0.23 0.18 0.11 0.37
0.46 0.44 0.78 0.81 0.68 0.3 1.0 0.52 0.4 0.32 0.57 0.55
0.57 0.31 1.0 0.72 0.95 0.81 0.98 0.57 0.55 0.26 0.28 0.44
0.0 0.0 0.0 0.12 1.0 0.0 0.18 0.29 0.04 0.1 0.0 0.14
0.1 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.17
0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.17 0.06 0.0 0.09 0.0 0.09 0.16
0.52 0.26 0.0 0.79 1.0 0.34 0.25 0.24 0.21 0.35 0.16 0.25
0.75 0.5 0.52 0.63 1.0 0.58 0.66 0.61 0.64 0.52 0.56 0.48
0.91 0.45 1.0 0.17 0.84 0.2 0.4 0.24 0.62 0.37 0.27 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.12 0.0 0.07
0.53 0.7 0.9 0.7 1.0 0.34 0.43 0.31 0.34 0.22 0.35 0.53
0.11 0.17 1.0 0.25 0.42 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.42 0.2
0.2 0.34 0.6 0.29 1.0 0.58 0.37 0.35 0.15 0.12 0.44 0.18
0.35 0.49 0.68 0.46 1.0 0.51 0.62 0.53 0.27 0.42 0.38 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.22 1.0 0.19 0.25 0.12 0.11 0.34 0.24 0.56 0.49 0.3
0.62 0.63 0.76 0.71 1.0 0.64 0.83 0.7 0.64 0.9 0.84 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.37 0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)