Heatmap: Cluster_48 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
28.18 26.66 31.97 30.04 30.36 27.08 30.71 31.58 37.33 32.24 31.4 31.55
0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.26 0.04 0.02 0.04
0.36 0.38 0.29 0.45 0.3 0.31 0.49 0.48 0.81 0.78 0.55 0.55
24.43 23.11 25.54 24.82 27.45 23.43 25.37 27.55 29.88 29.36 27.13 24.24
0.07 0.03 0.04 0.05 0.0 0.05 0.04 0.06 0.38 0.02 0.11 0.19
1.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 1.76 0.0 0.1 0.0
2.12 3.92 3.22 3.75 2.74 3.37 3.33 2.76 4.2 3.66 3.66 3.47
6.53 5.58 4.39 4.81 3.78 5.99 5.65 6.42 8.24 6.8 6.9 5.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.94 0.32 0.84 0.07 0.0 0.06
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.13 0.38 0.1 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
2.09 2.12 0.93 2.37 1.17 2.03 2.1 1.71 4.68 3.05 4.57 3.12
0.54 0.4 0.39 0.29 0.21 0.37 0.21 0.36 1.18 0.4 0.3 0.22
5.27 5.56 5.18 6.51 6.12 5.7 6.71 6.9 7.84 7.1 5.5 4.13
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.3 0.0 0.04 0.0
0.07 0.04 0.09 0.04 0.05 0.0 0.15 0.08 0.7 0.28 0.14 0.11
0.11 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.04 0.12 0.0 0.04 0.0
0.43 0.4 0.26 0.6 0.54 0.06 0.39 0.25 1.4 0.25 0.62 0.57
9.51 8.38 6.66 9.43 9.03 11.56 11.19 10.2 10.59 10.0 10.04 8.47
0.93 0.17 0.0 0.47 0.34 0.52 0.25 0.76 1.94 0.37 0.35 0.61
7.0 8.38 5.95 10.06 8.95 8.96 9.35 11.59 17.34 9.97 16.74 15.14
33.58 34.26 42.79 31.95 34.97 38.41 40.94 41.37 57.36 42.7 44.36 43.05
0.04 0.03 0.0 0.04 0.02 0.0 0.05 0.1 0.37 0.02 0.04 0.02
0.07 0.12 0.03 0.02 0.0 0.0 0.19 0.09 0.33 0.06 0.09 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.86 0.93 0.91 1.5 1.59 0.83 1.07 2.66 2.66 1.66 1.3 0.97
0.64 0.88 0.68 0.98 0.68 0.8 0.92 1.09 2.12 1.27 1.37 0.77
0.43 0.62 1.39 0.79 0.52 0.4 1.84 1.84 4.48 2.29 1.82 1.45
6.15 4.69 4.25 5.09 3.98 3.85 4.84 6.57 11.05 5.74 9.26 7.56
0.07 0.04 0.02 0.08 0.03 0.0 0.14 0.02 0.26 0.04 0.07 0.06
0.18 0.21 0.27 0.55 0.34 0.35 0.32 0.27 1.05 0.23 0.22 0.19
0.25 0.11 0.03 0.03 0.09 0.09 0.0 0.14 0.79 0.08 0.42 0.21
0.36 0.44 0.68 0.49 0.78 0.29 0.64 0.99 1.81 1.02 0.56 0.15
0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0
0.75 0.39 0.36 0.61 0.29 0.14 1.13 0.64 1.68 0.31 0.6 0.64
1.36 1.44 1.33 1.66 2.27 2.03 2.06 2.07 3.05 2.21 2.37 1.94
0.0 0.08 0.14 0.12 0.25 0.0 0.09 0.14 0.73 0.08 0.07 0.0
0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.09 0.24 0.04 0.04 0.06
0.25 0.13 0.02 0.33 0.2 0.26 0.11 0.18 0.53 0.34 0.41 0.15
0.0 0.02 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
0.5 0.37 0.13 0.41 0.39 0.25 0.59 0.83 0.98 0.64 0.76 0.54
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.04 0.0 0.0
0.65 0.47 0.56 0.57 0.56 0.54 0.59 0.55 0.89 0.45 0.59 0.71
0.0 0.0 0.0 0.11 0.09 0.04 0.0 0.04 0.31 0.16 0.19 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.04 0.05 0.09 0.12 0.0 0.05 0.02 0.12 0.46 0.04 0.04 0.13
0.0 0.06 0.0 0.05 0.06 0.14 0.24 0.04 0.3 0.06 0.06 0.04
0.04 0.11 0.07 0.17 0.15 0.07 0.15 0.04 0.47 0.21 0.41 0.06
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.08 0.0 0.0
0.0 0.08 0.02 0.06 0.09 0.0 0.36 0.32 1.07 0.16 0.3 0.23
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0
22.93 22.94 22.69 24.41 24.88 22.45 25.74 22.71 29.26 25.98 26.08 22.05
0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.42 0.02 0.04 0.0
18.18 19.93 16.84 21.65 21.64 24.64 31.08 25.14 25.1 21.75 27.28 20.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.11 0.42 0.14 0.31 0.38 0.17 0.5 0.39 1.05 0.91 0.73 0.17
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.03 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.29 0.24 0.0 0.26 0.13 0.14 0.35 0.14 0.93 0.22 0.46 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 0.0 0.02 0.02 0.11 0.02 0.0 0.49 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.04 0.06 0.04 0.19 0.04 0.04 0.0
0.22 0.04 0.05 0.22 0.02 0.09 0.02 0.16 0.49 0.08 0.09 0.0
0.04 0.03 0.09 0.04 0.0 0.02 0.1 0.04 0.26 0.09 0.0 0.0
0.0 0.04 0.07 0.07 0.02 0.02 0.22 0.13 0.51 0.23 0.27 0.21
0.07 0.31 0.14 0.31 0.45 0.32 0.55 0.04 0.7 0.12 0.04 0.38
1.5 1.16 1.13 1.88 1.36 1.03 1.61 1.26 2.37 1.6 1.76 1.9
1.39 0.5 0.56 0.38 1.2 0.99 2.91 1.92 5.0 3.41 2.29 1.56
0.46 0.36 0.41 0.82 1.07 0.35 0.58 0.78 0.96 0.49 0.55 0.39
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.04 0.05 0.0
0.71 0.35 0.28 0.53 0.77 0.29 0.47 0.2 0.77 0.33 0.49 0.32
2.36 2.34 2.13 2.86 2.96 2.16 3.0 2.42 3.0 2.62 2.73 2.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.23 0.02 0.0 0.0
0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.1 0.24 0.27 0.47 0.02 0.12 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.17 0.0 0.0 0.0
0.18 0.62 0.21 0.31 0.31 0.3 0.52 0.68 0.82 0.51 0.75 0.56
0.07 0.09 0.03 0.15 0.15 0.04 0.09 0.08 0.26 0.1 0.07 0.08
0.21 0.04 0.07 0.11 0.24 0.02 0.13 0.32 0.98 0.51 0.05 0.11
0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02 0.31 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.14 0.13 0.05 0.0 1.07 0.32 1.82 1.06 0.09 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.04
0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.06 0.05 0.28 0.04 0.04 0.06
0.21 0.11 0.0 0.06 0.14 0.46 0.52 0.27 0.58 0.29 0.35 0.07
0.04 0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.23 0.02 0.16 0.13
0.07 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.05 0.04 0.52 0.0 0.12 0.04
0.14 0.06 0.02 0.05 0.08 0.15 0.19 0.32 1.19 0.53 0.24 0.38
29.69 28.75 26.2 33.48 38.15 27.44 38.37 35.84 40.99 36.41 36.44 31.48
0.5 0.23 0.02 0.53 0.41 0.71 0.78 0.54 1.21 0.34 0.47 0.38
19.06 21.51 18.72 22.4 21.12 26.24 26.71 21.98 22.9 22.65 24.87 22.69
3.35 3.29 3.37 3.75 4.76 3.19 5.07 4.59 5.65 3.92 3.36 3.41
0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.38 0.02 0.02 0.0
0.89 2.33 1.41 2.82 0.99 2.02 1.88 2.4 7.28 1.52 1.06 1.29
0.14 0.06 0.0 0.15 0.0 0.0 0.14 0.06 0.4 0.04 0.11 0.23
0.0 0.43 0.04 0.47 0.15 0.0 0.28 0.77 1.64 0.21 0.04 0.21
0.15 0.12 0.05 0.12 0.0 0.0 0.2 0.4 0.49 0.08 0.0 0.0
0.32 0.7 0.0 0.36 0.21 0.41 0.43 0.53 2.29 0.34 0.55 0.39
3.46 2.7 1.71 2.73 1.56 2.79 2.23 3.04 8.4 3.28 2.11 2.73
0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.07 0.0 0.09 0.26 0.06 0.0 0.0
11.16 9.9 18.09 14.92 11.9 14.6 20.06 18.26 31.41 20.09 20.19 20.31
4.7 6.26 6.47 6.29 5.57 5.71 6.15 6.35 9.02 7.25 6.82 8.21

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)