Heatmap: Cluster_48 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
100366	0.75	0.71	0.86	0.8	0.81	0.73	0.82	0.85	1.0	0.86	0.84	0.85
107394	0.27	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.15	0.09	0.17
109559	0.45	0.47	0.37	0.55	0.37	0.38	0.61	0.59	1.0	0.97	0.69	0.69
110655	0.82	0.77	0.85	0.83	0.92	0.78	0.85	0.92	1.0	0.98	0.91	0.81
112999	0.18	0.09	0.09	0.14	0.0	0.13	0.1	0.16	1.0	0.05	0.3	0.5
115332	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	1.0	0.0	0.06	0.0
115826	0.5	0.93	0.77	0.89	0.65	0.8	0.79	0.66	1.0	0.87	0.87	0.83
117107	0.79	0.68	0.53	0.58	0.46	0.73	0.69	0.78	1.0	0.83	0.84	0.66
122243	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	1.0	0.34	0.89	0.07	0.0	0.07
128002	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
128595	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.33	1.0	0.27	0.14	0.0
134708	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
138786	0.45	0.45	0.2	0.51	0.25	0.43	0.45	0.36	1.0	0.65	0.98	0.67
15491	0.46	0.34	0.33	0.25	0.18	0.32	0.18	0.31	1.0	0.34	0.26	0.18
17482	0.67	0.71	0.66	0.83	0.78	0.73	0.86	0.88	1.0	0.91	0.7	0.53
18456	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.34	0.0	1.0	0.0	0.12	0.0
18539	0.1	0.06	0.12	0.06	0.07	0.0	0.21	0.12	1.0	0.4	0.2	0.16
234633	0.86	0.0	0.0	0.46	0.0	0.2	0.16	0.34	1.0	0.0	0.3	0.0
24064	0.31	0.28	0.18	0.43	0.39	0.05	0.28	0.18	1.0	0.18	0.45	0.41
26993	0.82	0.72	0.58	0.82	0.78	1.0	0.97	0.88	0.92	0.87	0.87	0.73
27276	0.48	0.09	0.0	0.24	0.18	0.27	0.13	0.39	1.0	0.19	0.18	0.31
39139	0.4	0.48	0.34	0.58	0.52	0.52	0.54	0.67	1.0	0.58	0.97	0.87
39384	0.59	0.6	0.75	0.56	0.61	0.67	0.71	0.72	1.0	0.74	0.77	0.75
402201	0.1	0.09	0.0	0.1	0.06	0.0	0.13	0.28	1.0	0.06	0.1	0.06
402226	0.21	0.37	0.1	0.05	0.0	0.0	0.56	0.26	1.0	0.18	0.27	0.32
403068	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
404748	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
405681	0.32	0.35	0.34	0.56	0.6	0.31	0.4	1.0	1.0	0.62	0.49	0.36
405740	0.3	0.41	0.32	0.46	0.32	0.38	0.43	0.51	1.0	0.6	0.64	0.36
405826	0.09	0.14	0.31	0.18	0.12	0.09	0.41	0.41	1.0	0.51	0.41	0.32
406431	0.56	0.42	0.38	0.46	0.36	0.35	0.44	0.59	1.0	0.52	0.84	0.68
406784	0.27	0.14	0.07	0.29	0.11	0.0	0.55	0.09	1.0	0.16	0.27	0.24
406939	0.17	0.2	0.26	0.52	0.33	0.34	0.31	0.25	1.0	0.22	0.21	0.18
406980	0.31	0.15	0.04	0.04	0.12	0.11	0.0	0.18	1.0	0.1	0.54	0.27
407390	0.2	0.24	0.38	0.27	0.43	0.16	0.36	0.55	1.0	0.57	0.31	0.08
407461	0.0	0.58	0.0	0.32	0.0	0.0	0.28	0.0	1.0	0.0	0.51	0.0
407466	0.44	0.23	0.21	0.36	0.17	0.08	0.67	0.38	1.0	0.19	0.36	0.38
407928	0.45	0.47	0.44	0.54	0.74	0.67	0.67	0.68	1.0	0.72	0.78	0.64
408047	0.0	0.11	0.19	0.17	0.34	0.0	0.12	0.19	1.0	0.11	0.1	0.0
409313	0.0	0.2	0.0	0.18	0.0	0.0	0.26	0.36	1.0	0.18	0.15	0.26
409370	0.47	0.24	0.03	0.62	0.38	0.5	0.2	0.35	1.0	0.65	0.78	0.29
409625	0.0	0.07	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
409729	0.51	0.37	0.13	0.41	0.39	0.25	0.6	0.85	1.0	0.65	0.78	0.55
409744	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0
410022	0.72	0.53	0.63	0.64	0.63	0.61	0.66	0.61	1.0	0.5	0.66	0.79
410701	0.0	0.0	0.0	0.36	0.3	0.14	0.0	0.13	1.0	0.51	0.62	0.14
410924	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
410945	0.08	0.12	0.19	0.25	0.0	0.11	0.05	0.26	1.0	0.09	0.08	0.28
412775	0.0	0.21	0.0	0.17	0.19	0.46	0.8	0.14	1.0	0.2	0.2	0.15
413461	0.08	0.23	0.15	0.35	0.31	0.14	0.32	0.09	1.0	0.44	0.88	0.14
413632	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39	0.0	0.0
414481	0.0	0.08	0.02	0.05	0.09	0.0	0.34	0.3	1.0	0.15	0.28	0.22
414720	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
415075	0.78	0.78	0.78	0.83	0.85	0.77	0.88	0.78	1.0	0.89	0.89	0.75
415345	0.17	0.0	0.0	0.2	0.0	0.05	0.0	0.0	1.0	0.05	0.1	0.0
415798	0.59	0.64	0.54	0.7	0.7	0.79	1.0	0.81	0.81	0.7	0.88	0.66
416213	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
416549	0.1	0.4	0.13	0.29	0.36	0.16	0.47	0.37	1.0	0.87	0.69	0.16
418200	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	1.0	0.14	0.0	0.56
418208	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
418491	0.31	0.26	0.0	0.28	0.14	0.15	0.37	0.15	1.0	0.23	0.5	0.25
418650	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
418988	0.44	0.0	0.0	0.05	0.05	0.22	0.04	0.0	1.0	0.0	0.0	0.13
420091	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
420736	0.0	0.09	0.0	0.08	0.12	0.23	0.3	0.21	1.0	0.2	0.18	0.0
421742	0.44	0.07	0.11	0.44	0.05	0.18	0.04	0.33	1.0	0.17	0.19	0.0
423009	0.14	0.13	0.33	0.17	0.0	0.08	0.39	0.15	1.0	0.34	0.0	0.0
423222	0.0	0.07	0.14	0.15	0.05	0.05	0.43	0.25	1.0	0.44	0.53	0.42
423880	0.1	0.44	0.2	0.44	0.64	0.45	0.78	0.06	1.0	0.17	0.05	0.54
423947	0.63	0.49	0.48	0.79	0.57	0.44	0.68	0.53	1.0	0.68	0.74	0.8
424098	0.28	0.1	0.11	0.08	0.24	0.2	0.58	0.38	1.0	0.68	0.46	0.31
424293	0.43	0.34	0.39	0.77	1.0	0.33	0.54	0.73	0.9	0.46	0.51	0.36
424397	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.06	0.07	0.0
424638	0.93	0.46	0.37	0.69	1.0	0.37	0.61	0.26	1.0	0.43	0.64	0.42
424893	0.78	0.78	0.71	0.95	0.98	0.72	1.0	0.81	1.0	0.87	0.91	0.77
424896	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	1.0	0.09	0.0	0.0
424964	0.07	0.03	0.0	0.03	0.0	0.2	0.51	0.57	1.0	0.04	0.26	0.23
425299	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.23	1.0	0.0	0.0	0.0
425558	0.22	0.76	0.25	0.38	0.38	0.36	0.63	0.83	1.0	0.62	0.91	0.68
428231	0.28	0.33	0.13	0.59	0.58	0.17	0.34	0.31	1.0	0.37	0.27	0.32
428270	0.22	0.04	0.08	0.11	0.24	0.02	0.13	0.33	1.0	0.52	0.05	0.11
428950	0.0	0.18	0.0	0.07	0.0	0.0	0.14	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0
429503	0.04	0.0	0.08	0.07	0.03	0.0	0.59	0.18	1.0	0.58	0.05	0.08
430704	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
430862	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
431033	0.0	0.17	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.11
431513	0.0	0.18	0.06	0.08	0.0	0.0	0.21	0.18	1.0	0.16	0.13	0.23
431632	0.37	0.19	0.0	0.11	0.24	0.8	0.89	0.46	1.0	0.51	0.6	0.11
432176	0.16	0.15	0.15	0.1	0.0	0.0	0.28	0.09	1.0	0.09	0.69	0.56
432570	0.14	0.0	0.0	0.09	0.0	0.09	0.09	0.08	1.0	0.0	0.23	0.08
441604	0.12	0.05	0.01	0.04	0.07	0.13	0.16	0.27	1.0	0.44	0.2	0.32
4729	0.72	0.7	0.64	0.82	0.93	0.67	0.94	0.87	1.0	0.89	0.89	0.77
54030	0.42	0.19	0.01	0.44	0.34	0.59	0.65	0.45	1.0	0.28	0.39	0.32
54250	0.71	0.81	0.7	0.84	0.79	0.98	1.0	0.82	0.86	0.85	0.93	0.85
54681	0.59	0.58	0.6	0.67	0.84	0.57	0.9	0.81	1.0	0.69	0.59	0.6
5836	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.05	0.0	1.0	0.05	0.05	0.0
73134	0.12	0.32	0.19	0.39	0.14	0.28	0.26	0.33	1.0	0.21	0.15	0.18
75451	0.36	0.14	0.0	0.37	0.0	0.0	0.34	0.15	1.0	0.1	0.28	0.58
76616	0.0	0.26	0.02	0.29	0.09	0.0	0.17	0.47	1.0	0.13	0.02	0.13
81220	0.3	0.24	0.11	0.25	0.0	0.0	0.4	0.81	1.0	0.16	0.0	0.0
8199	0.14	0.31	0.0	0.16	0.09	0.18	0.19	0.23	1.0	0.15	0.24	0.17
84746	0.41	0.32	0.2	0.33	0.19	0.33	0.27	0.36	1.0	0.39	0.25	0.33
85878	0.0	0.0	0.26	0.17	0.0	0.25	0.0	0.35	1.0	0.22	0.0	0.0
8977	0.36	0.32	0.58	0.47	0.38	0.46	0.64	0.58	1.0	0.64	0.64	0.65
94010	0.52	0.69	0.72	0.7	0.62	0.63	0.68	0.7	1.0	0.8	0.76	0.91

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)