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Heatmap: Cluster_121 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.53 0.03 0.14 -0.07 0.68 -2.4 0.25 0.02 -0.8 -0.27 0.39 -0.36
0.04 0.18 0.03 0.12 -0.74 -0.26 0.95 0.51 -1.71 -0.1 -0.06 -0.43
-1.05 -1.41 -1.07 -0.65 -1.65 -1.66 -1.21 1.34 0.82 0.73 0.49 0.67
-0.23 0.9 -0.39 0.19 -1.17 -0.63 0.3 0.5 0.18 -1.19 0.11 -0.01
-0.44 0.11 0.19 -0.21 0.02 -0.51 0.54 0.15 -0.06 -0.04 -0.22 0.15
-0.93 -0.79 -0.83 -0.38 -0.86 -0.38 1.16 1.05 0.86 -1.75 0.32 -0.8
-1.59 0.87 -0.11 -0.3 -0.65 -1.09 1.21 0.65 -0.85 0.47 -1.84 -0.16
-2.42 -1.6 -2.45 -2.41 0.83 1.16 0.88 1.33 0.04 -0.04 -1.83 -1.15
-0.29 0.59 0.32 0.02 0.02 -0.33 0.46 -0.02 -0.22 -0.52 -0.11 -0.41
0.83 -0.32 -1.7 0.29 -0.99 -0.68 0.47 1.27 -0.83 -0.87 0.78 -2.71
-0.29 -0.47 -0.26 -0.47 -0.51 -0.21 0.01 0.26 0.36 0.17 0.56 0.32
-0.13 0.83 - 0.09 -0.25 0.94 -0.75 0.32 -0.47 0.27 0.06 -0.57
-1.46 -2.59 -0.87 -1.0 -1.83 - 0.3 1.1 0.66 0.31 1.3 0.56
0.2 0.06 -0.53 0.6 0.29 0.35 -1.21 -0.46 0.31 -0.67 -0.19 0.25
-0.91 0.91 -0.67 0.3 -0.39 0.4 1.02 0.65 -1.15 -1.16 -0.62 -1.0
0.93 0.61 -0.75 -1.02 0.04 -1.07 -0.1 0.83 -1.63 0.34 -0.04 -0.5
-0.35 0.19 -0.11 0.03 -0.01 0.17 0.37 -0.0 0.08 -0.16 0.04 -0.42
1.11 0.67 0.79 - -1.08 - 1.48 -0.26 -1.48 -0.35 - 0.35
0.52 0.24 -0.81 0.18 0.25 -0.18 0.12 -0.59 -0.13 -1.23 0.49 0.17
0.78 0.18 -0.59 0.17 0.04 -0.38 0.06 0.12 -0.63 -1.18 0.21 0.25
-1.09 -0.12 0.06 0.0 -0.06 0.56 0.01 0.31 0.52 -0.21 -0.18 -0.49
- -0.1 -2.27 1.28 -1.82 0.77 0.93 -0.44 -0.67 0.65 0.12 -0.94
0.24 0.61 -0.55 -0.64 -0.66 -0.28 0.17 0.24 -0.1 0.06 0.14 0.19
- 0.54 - -1.54 -0.75 1.76 0.35 1.4 - - -0.38 0.64
-0.17 -0.47 -0.08 -0.31 -0.01 -0.19 0.84 0.37 -0.12 0.02 -0.29 -0.11
- - - - - 2.46 1.84 1.1 - - -0.39 -
- -0.69 - - -0.01 1.09 1.5 0.64 -2.21 1.68 -1.18 -
-0.05 0.81 -0.11 0.2 0.64 -2.17 0.89 0.15 -1.69 - 0.64 -0.79
-0.9 -1.18 0.39 0.48 -0.8 0.35 0.24 0.56 0.44 -0.23 0.49 -2.29
0.34 -0.24 -3.51 0.85 0.22 0.69 0.17 -0.43 0.24 -1.18 -2.97 0.68
-0.01 0.58 - -1.0 0.37 1.85 1.65 - -0.03 - - -
0.65 -0.17 - - - 1.13 0.59 1.51 -0.93 0.56 -1.48 -0.67
0.01 -0.24 -0.38 0.13 -0.55 0.12 0.73 0.39 0.34 -0.75 -0.49 -0.05
-0.55 -1.09 -0.82 -0.06 -0.99 0.18 1.26 1.18 -0.38 0.04 -0.12 -1.68
- 0.79 - 1.41 - 0.57 0.89 0.62 -0.28 -0.97 -1.27 -0.02
-0.89 -0.39 0.14 0.27 -0.89 -0.89 1.02 0.4 -0.07 -0.03 -0.09 0.12
-1.33 0.44 1.75 -2.45 1.27 -0.42 0.49 -2.08 - - - 0.92
-2.05 -0.07 0.19 1.51 -3.09 0.63 1.86 -2.86 - -0.83 -3.09 -0.48
-0.61 -0.58 -0.52 -0.33 -0.39 0.77 0.23 0.25 0.58 -0.04 -0.09 -0.11
-1.83 -0.59 -0.17 -0.74 -1.25 0.2 0.89 1.01 0.03 0.42 -0.09 -0.28
-1.31 0.38 -0.61 -1.48 -1.12 1.38 0.71 0.97 -2.34 -0.07 -2.29 0.35
-1.28 0.47 -0.03 0.22 - 1.29 1.32 0.67 -0.74 -2.17 -2.32 -1.01
-0.93 -0.44 -0.82 -0.34 -0.95 0.56 0.63 0.76 -0.1 0.27 0.32 -0.38
-0.49 -0.55 -0.19 -0.34 -0.34 -0.23 0.28 0.23 0.37 0.44 0.27 0.07
0.1 -0.09 0.35 0.06 0.32 -0.08 0.02 0.17 0.04 -0.45 -0.34 -0.35
-0.62 0.26 0.17 0.63 -1.32 0.31 0.2 -0.1 -0.11 -0.49 0.1 0.07
- -2.92 0.77 1.32 -0.21 0.99 0.63 -0.56 -1.3 0.95 -3.09 -2.78
-0.26 -0.02 -0.21 -0.26 -0.21 0.29 0.22 0.18 0.42 0.05 0.05 -0.52
-2.19 -1.05 - -3.31 -2.52 1.19 1.47 1.17 0.38 -0.68 0.84 -
- - -3.3 -1.48 -0.84 0.21 1.42 1.39 0.2 0.4 0.76 -1.42
- -1.62 - - - 1.43 1.84 1.6 -0.85 0.26 -1.84 -1.61
-0.54 1.33 0.82 0.6 -0.16 - 0.91 - -1.61 -1.43 0.33 -0.33
-0.52 -1.46 -0.32 -1.63 0.24 -1.18 -2.12 0.89 0.12 -0.09 0.83 1.21
0.02 -0.13 - -0.21 -0.46 -3.0 0.84 1.21 -0.73 0.64 -0.66 0.54
- -2.27 - - - 1.13 2.23 2.08 -1.18 -2.02 - -
0.07 0.07 -0.01 0.02 -0.06 -0.31 -0.11 -0.09 -0.16 0.1 0.22 0.18
-2.36 -0.64 -1.17 0.19 -0.02 -0.53 1.09 0.65 -1.41 0.55 0.31 0.16
-0.27 0.79 -0.33 0.56 -1.23 -1.41 1.0 0.74 -0.33 -2.6 0.67 -2.62
0.65 0.41 -1.74 -1.58 -2.29 -0.81 0.1 1.72 0.47 0.38 -0.64 -
-2.51 -0.2 -0.35 0.49 -0.31 0.56 0.86 0.1 -3.3 0.89 -0.5 -0.09
-0.46 -0.87 0.06 0.38 -0.21 0.11 0.32 0.16 0.3 0.48 -0.54 -0.39
-0.18 0.07 0.0 0.02 0.04 -0.01 0.09 0.05 0.03 -0.04 0.01 -0.11
-0.1 -0.31 -0.14 -0.16 -0.06 -0.21 0.05 0.21 0.21 0.12 0.16 0.11
-0.06 -0.43 -0.12 -0.35 -0.2 -0.16 -0.09 0.35 0.13 0.08 0.33 0.26
-0.08 0.01 0.53 0.17 0.12 0.33 -0.11 0.15 -0.09 -0.98 -0.31 -0.25
-0.34 -0.09 0.27 0.15 -0.08 -0.01 0.15 0.12 0.18 -0.32 0.03 -0.21
-1.61 0.14 -1.08 0.4 -0.25 -1.32 1.2 1.25 -0.46 0.47 -0.81 -2.37
-1.68 -1.59 -0.77 -1.6 -1.71 1.14 1.09 0.76 0.55 0.28 -0.4 -0.58
0.16 -0.31 0.14 -0.26 0.25 0.09 -0.31 0.32 -0.2 0.06 0.09 -0.24
-0.39 -0.85 -0.47 -0.64 -0.67 -0.63 -0.09 0.56 0.44 0.35 0.59 0.59
-0.1 -0.26 -0.13 -0.24 -0.25 -0.27 -0.08 0.22 0.2 0.18 0.35 0.16
0.02 0.0 -0.04 0.05 0.2 -0.19 -0.2 -0.11 -0.13 -0.01 0.27 0.05
-0.25 -1.37 -0.39 -1.37 -1.41 0.93 0.68 0.66 0.55 0.42 -0.64 -0.47
-0.05 0.17 -0.04 -0.04 -0.1 -0.12 0.05 0.14 -0.07 0.07 -0.08 0.04
-0.04 0.05 -0.08 -0.05 -0.0 0.03 0.02 0.07 0.04 0.04 0.04 -0.15
0.25 -0.12 -0.1 0.11 -0.04 -0.12 0.0 -0.05 0.1 -0.09 0.29 -0.38
-0.17 0.05 0.3 -0.04 -0.11 0.3 0.16 0.04 -0.07 -0.3 -0.05 -0.25
-1.15 -0.54 0.11 -0.48 -0.82 -0.07 0.68 0.49 0.34 0.2 0.34 -0.22
0.0 0.63 -0.99 -0.17 -0.05 -0.75 0.51 0.09 -1.15 -0.35 0.44 0.5
-1.24 -0.16 0.09 1.14 -1.28 -1.79 1.54 -0.38 -0.71 -0.04 -2.28 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.