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Heatmap: Cluster_34 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.16 -0.51 -0.51 -0.47 -0.04 -0.03 0.08 0.08 0.02 0.57 0.14 0.14
- - - - - - - 1.34 1.25 - 2.3 1.11
- -1.39 - 0.63 - 0.99 - 1.12 - -0.07 1.82 0.52
-0.03 -0.25 -0.18 -0.23 -0.1 -0.15 0.05 0.01 -0.0 0.42 0.29 0.02
0.13 -0.13 -0.08 -0.23 0.02 0.12 -0.2 0.16 0.21 0.16 -0.05 -0.2
-0.18 -0.16 0.24 -0.09 -0.01 -0.07 -0.01 -0.18 0.01 0.22 0.12 0.02
0.0 -0.04 -0.01 -0.03 -0.15 -0.03 -0.08 0.09 0.03 0.12 0.0 0.08
0.02 0.06 -0.04 -0.15 -0.09 0.01 -0.18 0.08 0.15 0.1 0.02 -0.02
0.31 0.24 -0.17 -0.04 -0.73 -0.2 -0.28 0.03 -0.09 0.51 -0.12 0.16
-1.05 -0.21 -2.8 -0.75 -0.53 -0.18 0.5 0.53 -0.07 1.2 0.59 -0.45
0.09 -0.06 -0.23 -0.2 -0.2 -0.06 -0.01 0.07 0.12 0.15 0.13 0.13
0.53 -1.29 1.61 -0.12 - - -0.02 -1.22 - 1.91 0.0 -
-0.44 -0.28 0.21 -0.04 -0.04 0.07 0.08 -0.04 0.15 0.18 0.08 -0.05
0.17 -0.1 -0.22 -0.22 -0.06 -0.07 -0.25 0.07 0.17 0.25 -0.03 0.18
0.24 0.31 -1.51 0.48 -0.99 -0.83 -0.56 -0.13 -1.54 0.91 1.08 -0.27
-0.54 - 1.13 - 0.47 - -1.09 1.54 -0.56 1.67 -1.07 -
- - 1.49 - 0.07 - - - -0.62 2.02 1.78 -
- - - -1.53 - - -1.43 2.32 - 2.45 -0.29 -
- - 1.38 - - -1.21 1.23 0.54 -0.69 1.3 -0.7 0.57
0.05 -0.01 -0.05 -0.04 -0.11 -0.38 -0.11 0.03 -0.07 0.4 0.26 -0.12
- 1.35 - - - - - 2.61 - 1.74 - -
-0.1 -0.55 -0.64 -0.72 -0.21 0.02 0.12 0.26 0.22 0.6 0.28 0.1
0.25 0.07 0.11 -0.22 -0.97 0.36 -0.46 0.12 -0.39 0.2 -0.03 0.41
0.65 -0.05 1.04 -0.29 - 0.91 -0.88 0.04 - 0.72 -1.28 0.11
0.34 -0.3 0.35 -1.7 -0.96 -0.57 -0.53 0.43 -0.24 1.08 0.29 -0.12
-0.34 -0.64 -0.86 -0.01 -2.94 -0.07 0.26 0.5 0.39 0.23 0.93 -0.07
-1.37 -2.5 - -0.41 -0.99 -1.1 -0.19 1.76 0.41 1.25 0.12 -0.59
-0.15 -0.28 -0.33 -0.26 0.08 -0.4 0.36 0.52 -0.37 0.43 0.24 -0.3
0.08 0.03 - -0.29 0.38 - 0.38 1.47 -1.52 -0.78 1.12 -0.64
-0.26 -0.6 -0.51 -0.34 -0.2 -0.55 0.26 -0.23 0.22 0.68 0.53 0.26
-0.53 -0.72 -3.18 0.07 0.2 0.06 0.33 0.73 -0.82 1.48 - 0.11
0.84 -0.83 -0.89 -0.28 -1.3 -0.69 -0.62 0.25 -0.26 0.53 0.75 0.54
0.03 -0.26 -0.01 -0.23 -0.15 -0.06 -0.01 0.02 -0.04 0.3 0.16 0.15
-0.62 -1.2 -0.14 -0.2 -0.41 -0.09 -0.57 0.86 0.67 0.88 0.3 -1.72
0.18 -0.32 0.33 -0.28 -1.33 -1.04 -0.09 -0.21 -0.31 1.12 0.41 -0.02
-0.06 -1.13 0.16 -0.52 -0.85 0.04 -0.6 0.46 -0.52 1.17 0.22 0.05
0.08 -0.24 0.06 -0.36 0.04 0.12 0.18 0.12 0.09 -0.1 -0.02 -0.08
- 0.5 - -1.57 0.43 -0.17 -1.13 0.92 -0.6 2.0 0.01 -
- -1.7 - -0.81 -1.51 - -0.17 1.41 - 1.98 1.71 -
- -0.63 - - - -0.54 0.87 - - 2.57 1.53 -
-0.54 -1.27 -1.72 0.4 -1.38 -1.42 -0.19 1.29 0.19 0.89 0.1 0.15
- -1.58 1.66 -1.61 - -1.22 - -1.31 - 2.09 -0.48 1.25
-0.01 0.53 - - 0.22 - 0.71 1.89 - -1.86 0.64 0.29
-0.56 0.29 1.05 -0.63 -2.82 -0.21 -0.68 0.56 -0.21 1.34 -1.05 -1.29
-0.26 0.45 -0.0 -0.09 -1.97 -0.79 -0.82 0.58 -0.9 1.09 0.73 -0.63
- 0.37 0.06 -0.45 -0.22 - -1.71 1.18 0.16 1.43 0.18 -0.85
-0.65 -1.27 -1.58 -0.93 -0.16 -1.3 -0.26 0.15 -0.03 1.12 1.07 0.66
0.5 -0.67 0.32 -0.45 0.3 0.33 0.38 -0.04 0.12 0.02 -0.56 -1.21
-0.69 -0.37 0.57 -0.01 -0.55 0.05 -0.28 -0.97 0.53 0.85 0.28 -0.69
-0.44 -0.38 -0.08 -0.08 -0.55 -0.28 -0.16 0.57 0.07 0.36 0.44 0.03
0.01 -0.13 0.06 -0.05 -0.2 -0.29 0.17 0.25 -0.03 0.1 0.13 -0.14
-0.18 -0.12 0.2 -0.14 0.08 -0.03 0.04 0.02 -0.18 0.25 0.05 -0.08
0.97 -0.12 - - - 1.24 - 1.47 - 1.6 -0.03 -
-0.03 - - 0.56 -0.41 0.24 0.36 -0.58 - 0.07 1.55 0.74
-0.27 -0.39 -0.45 -0.23 -0.26 -0.03 -0.16 0.54 0.2 0.39 0.16 0.12
-0.24 -1.87 -0.22 -0.21 -1.32 -0.72 -0.03 0.4 0.13 1.38 0.05 0.17
-0.17 -0.81 -1.15 -0.69 -0.57 -0.43 0.27 0.55 -0.05 0.68 0.62 0.35
- - - - - - - 2.53 - 2.31 - 0.34
0.1 -0.22 -0.07 -0.14 -0.13 -0.07 -0.02 -0.14 0.13 0.26 0.17 0.05
-0.11 -0.08 -0.22 -0.0 -0.09 -0.42 -0.04 0.03 0.06 0.41 0.18 0.13
-0.09 0.22 0.38 -0.0 -0.1 -0.64 -0.8 -0.25 -1.03 0.88 0.32 0.04
0.25 -0.23 -0.58 -0.16 -0.77 0.2 -0.39 0.15 0.32 0.26 0.46 -0.06
0.19 -0.4 -0.41 -0.41 -0.4 -0.04 0.13 -0.5 0.26 0.81 0.29 -0.15
- - -3.4 -0.27 -1.7 -3.05 -1.53 1.83 1.15 0.98 0.47 0.22
0.3 -0.01 -0.38 -0.02 -0.24 -0.21 -0.31 0.02 0.2 0.16 0.3 -0.03
0.2 -0.34 -0.22 -0.38 -0.05 -0.12 -0.19 -0.4 0.22 0.52 0.42 -0.03
- - - - - - - - - 2.84 2.28 -
-0.39 -0.3 -0.13 0.08 -0.03 -0.13 0.04 -0.03 0.13 0.41 0.09 0.1
-0.07 -0.27 -0.03 -0.21 -0.09 -0.09 0.08 0.14 0.03 0.26 0.12 0.05
0.1 -0.03 -0.03 -0.48 -0.66 -0.12 -0.16 0.17 0.07 0.22 0.42 0.16
0.47 -0.02 0.16 0.12 -0.47 -0.45 -0.21 -0.31 -0.29 0.27 0.15 0.23
-0.09 -0.18 -0.11 -0.05 -0.19 0.02 -0.02 0.29 0.07 0.17 0.16 -0.15
-0.55 -0.31 -0.48 -0.36 -0.0 -0.4 0.11 0.37 0.23 0.44 0.48 -0.06
-0.38 -2.88 -0.44 -0.51 -2.43 -0.03 -1.94 -0.81 0.6 1.64 0.72 0.44
0.08 -0.16 -0.19 -0.28 -0.21 -0.04 0.03 -0.03 0.18 0.2 0.16 0.15
0.67 -0.54 -0.04 -3.06 -2.26 - -1.62 1.29 -0.6 1.69 -0.61 0.14
-1.25 -2.06 -1.71 -0.36 -0.93 -1.41 -0.24 1.02 0.77 1.5 0.47 -0.81
-0.05 -0.28 0.2 -0.35 -0.21 0.25 -0.02 0.23 0.12 0.12 0.09 -0.28
-0.15 -0.31 -0.54 -0.35 0.01 0.08 0.1 0.11 0.07 0.28 0.33 0.12
-1.04 0.57 0.72 0.16 -0.65 -0.87 -0.56 -0.23 -0.49 0.74 0.21 0.01
0.12 -0.13 -0.07 -0.19 -0.11 -0.05 0.02 -0.15 0.11 0.22 0.12 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.