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Heatmap: Cluster_9 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.58 -1.37 -0.99 0.37 -1.74 1.16 -1.91 -0.6 0.61 -1.91 -0.33 -0.37
-0.22 -0.62 -0.88 -0.36 -0.34 0.42 0.3 0.27 0.69 -0.18 0.15 -0.01
0.25 -0.49 -0.74 -0.63 -0.82 0.04 -0.86 -0.31 0.6 0.55 0.59 0.5
-0.04 -0.03 -0.0 -0.06 -0.14 -0.07 0.01 0.02 0.22 0.02 -0.04 0.09
0.58 -0.19 -0.33 -0.1 -0.27 0.08 -0.63 -0.21 0.19 0.36 0.31 -0.24
0.55 -1.96 -1.23 -1.11 -2.24 -0.06 -0.21 1.04 1.26 -0.31 0.08 0.04
0.91 -0.09 -0.36 0.05 -1.19 0.18 -0.26 -0.58 0.59 -0.05 -0.21 -0.06
-1.18 -0.54 0.22 -0.31 -0.9 -0.58 -0.93 -0.67 1.16 0.77 0.62 0.08
1.56 -5.03 0.36 -3.99 -1.29 -1.16 -4.76 -0.36 1.48 -2.14 0.62 0.55
0.49 -0.5 -0.32 -1.23 -0.81 -0.6 -0.5 0.14 0.71 1.3 -0.3 -0.5
0.69 -1.1 0.38 -0.52 -1.55 -0.56 0.23 -0.46 1.43 -0.87 -0.63 0.15
-0.35 -0.01 0.27 0.12 -0.43 0.14 -0.2 0.02 0.7 -0.47 -0.1 -0.11
-0.42 -0.25 0.05 0.05 -0.17 -0.15 -0.17 0.2 0.4 0.38 0.06 -0.24
-0.93 -1.07 -1.96 -1.21 -0.45 0.28 0.52 0.68 1.0 0.13 0.45 -0.21
-0.62 -0.48 0.08 0.17 -0.4 -0.26 0.09 0.14 0.71 0.29 -0.06 -0.18
0.86 -0.04 -1.5 0.88 -1.04 -1.15 0.67 -0.57 1.11 - -0.01 -0.61
-1.01 -0.77 -2.12 -1.74 -3.12 -0.02 0.81 0.74 1.52 -0.01 0.6 -1.01
0.08 -0.79 -0.82 -0.79 -0.77 -0.03 -0.37 0.07 0.86 0.62 0.27 0.36
-0.47 -0.88 -0.93 -1.04 -2.14 -1.65 0.03 -0.52 1.07 0.52 1.25 0.64
-0.06 -0.19 -0.25 0.04 -0.53 -0.15 -0.14 0.01 0.35 0.43 0.18 0.04
0.46 -0.56 -0.56 -0.41 -0.33 -0.27 -0.18 0.21 0.78 -0.32 0.22 0.23
-0.03 - - - - 0.88 - -0.65 1.87 -0.13 1.31 0.58
-0.26 -0.01 -0.1 0.01 0.08 -0.16 -0.17 -0.25 0.23 0.32 0.06 0.12
-0.28 -0.62 -0.12 -0.67 -0.18 -0.24 -0.11 -0.42 0.78 0.38 0.71 -0.11
-0.24 -0.17 -0.08 0.09 -0.07 -0.03 -0.05 0.13 0.1 0.12 0.09 0.06
-1.28 -0.65 -1.19 -0.1 -0.32 -0.15 0.34 0.46 0.92 0.21 0.3 -0.08
-0.21 -0.24 -0.25 -0.04 0.01 0.06 0.1 0.24 0.21 0.03 0.12 -0.12
-1.54 -0.5 -0.39 -0.79 -0.39 0.33 0.46 0.9 0.84 -0.35 0.09 -0.48
-0.54 -0.87 -1.19 -0.77 -0.34 0.24 0.25 0.48 0.71 0.38 0.04 0.3
-1.47 -1.78 -2.94 -1.11 -0.67 -0.02 0.57 0.77 1.08 0.73 0.27 -0.02
-0.72 0.31 -1.78 -0.09 -1.42 -0.6 0.39 -0.61 0.82 0.65 0.71 -0.08
-0.3 0.15 0.29 -0.17 -0.26 -0.26 -0.38 -1.4 1.33 0.38 -1.72 0.05
-1.46 -1.21 0.24 -1.96 -1.62 -1.13 0.05 0.06 1.36 1.02 -0.08 0.44
- -2.31 -0.73 0.09 1.01 1.29 0.26 1.46 -0.73 -2.23 -0.53 -2.26
-0.52 0.21 0.15 0.38 0.24 -0.72 -1.16 -1.41 0.59 0.8 -1.09 0.48
-0.18 -0.06 -0.17 0.0 -0.31 -0.03 0.04 -0.09 0.19 0.2 0.18 0.13
1.01 -2.03 -1.11 - - -0.3 0.49 0.33 1.46 -0.13 -1.22 0.77
0.36 -0.46 -1.32 -0.03 -0.87 -0.19 -0.43 -0.26 0.57 0.19 0.75 0.37
0.48 -0.36 -0.2 -0.61 -0.3 -0.28 -0.36 0.41 0.6 -0.05 0.14 -0.04
0.16 -0.2 -0.04 -0.14 -0.14 -0.03 -0.29 -0.6 0.25 0.34 0.27 0.15
- -1.23 1.37 -1.06 - 0.5 -1.26 2.41 - -1.1 - -0.15
-2.46 -0.72 -0.63 -0.14 -4.5 -0.22 -1.23 -0.84 1.61 1.36 -0.85 0.67
- - -0.35 -0.38 0.1 1.32 -0.18 2.14 0.67 - - -
-0.98 -0.89 1.42 - - - - 0.24 2.21 0.67 -1.97 -0.69
-1.87 0.2 -3.32 -1.4 -2.87 0.14 1.22 1.03 0.54 -0.26 -0.48 0.57
-1.62 -2.39 1.05 -1.16 -0.61 -0.54 -1.32 -1.28 1.96 0.81 -2.55 0.02
-0.77 -0.87 -0.52 -0.39 -0.13 0.08 0.43 0.48 0.7 0.18 -0.02 -0.07
-1.11 -2.64 -1.86 -0.97 -1.09 0.12 0.57 0.99 1.05 0.83 0.1 -0.63
- -0.76 - 0.09 -1.42 1.69 -0.69 - 2.05 -1.54 - 0.72
0.37 -0.35 -0.66 -0.36 -0.39 -0.48 0.1 0.11 0.45 0.32 0.23 0.12
0.4 -0.43 -0.01 -0.23 -0.31 -0.3 -0.32 0.28 0.44 0.35 -0.14 -0.13
- -0.08 - - - 1.77 -0.98 1.95 - 0.1 - 1.13
- - - - - 2.1 - 2.54 - - -0.22 0.09
0.0 -0.51 -1.47 -0.43 -0.77 -0.14 -0.09 -0.14 0.68 0.67 0.64 0.15
-0.32 -0.6 -0.47 -0.02 0.15 -0.22 -0.15 0.48 0.26 0.07 0.27 0.16
- -0.83 2.32 -0.18 -0.8 -1.49 -1.37 -1.64 1.5 -1.07 -1.16 -2.49
- - - -1.21 - -1.06 0.18 - 2.35 1.39 0.04 0.27
-0.82 -0.81 -0.99 -0.38 -0.25 0.12 0.42 0.36 0.71 0.19 0.32 0.03
- - 1.95 - - - - -0.54 2.59 -0.56 - -0.44
-0.26 0.32 -0.89 -0.05 -1.33 -2.05 0.75 -0.6 0.62 1.43 -0.72 -0.78
-0.13 -0.18 -0.18 -0.15 -0.34 0.17 -0.18 -0.01 0.41 0.14 0.16 0.12
-1.36 -2.03 -3.6 -1.77 -1.45 -0.02 0.18 1.36 1.21 0.59 0.12 0.04
-0.04 -0.4 -0.19 -0.37 -0.35 0.23 0.33 0.23 0.16 -0.0 0.06 0.1
- - 1.79 - - - -0.85 - 2.15 -1.14 1.07 -0.01
2.24 - - -2.59 -1.04 0.43 -2.02 -1.22 1.52 -2.31 -1.21 0.15
0.89 - - - - - -0.01 - 1.42 2.47 -0.08 -
- 1.07 - -0.34 - 1.22 - - 2.76 - - -
-0.8 -0.26 -2.14 0.03 -0.32 -0.29 -0.58 0.48 0.59 0.74 0.49 0.1
0.97 0.16 - -0.78 -2.44 -0.02 0.07 -3.87 0.87 -1.32 -0.84 1.71
-1.77 -2.6 - - -1.35 -0.45 -0.16 0.77 1.75 0.79 0.39 0.51
0.26 -0.77 -0.78 -0.28 -1.46 0.79 -0.15 -1.44 1.19 -0.44 0.05 0.48
-0.65 -0.55 -3.3 -2.14 -0.87 - -0.73 -3.02 1.73 1.84 0.85 -1.39
0.34 -0.12 0.06 -0.14 -0.09 0.07 -0.28 -0.3 0.08 0.18 0.11 -0.06
- - - - - 2.03 - 2.21 - - 1.72 -
-0.3 -0.08 -0.89 -0.32 -1.32 -0.15 -2.27 0.2 0.63 0.59 1.02 0.21
0.95 -0.62 -1.31 -0.34 - -1.95 -0.2 0.28 1.06 -0.26 0.47 0.65
- - - -1.38 - 1.06 -0.82 - 2.9 -0.95 - -0.02
1.36 - - -3.1 -2.77 - -0.29 0.45 1.45 0.63 0.03 0.75
0.69 -0.02 -1.09 -0.47 0.08 -0.88 0.29 0.36 0.45 -0.16 -0.12 -0.12
-0.53 0.0 -0.12 -0.3 0.23 -0.33 -1.5 -0.19 -0.04 0.89 0.49 0.21
-0.0 -2.38 -4.21 -2.05 -2.76 -0.12 0.84 1.08 1.1 0.81 0.15 -0.9
0.11 -0.93 0.57 -0.75 -0.42 -0.53 -0.63 -0.39 1.12 0.22 0.34 -0.22
-1.04 -0.44 -0.43 -0.54 -0.68 -0.08 -0.29 -0.83 1.06 0.41 0.67 0.47
- - - - - 0.94 1.06 - 2.61 - - 0.93
-1.6 -0.96 -0.72 -0.16 -1.23 -0.26 -0.08 0.16 1.59 1.41 -1.11 -2.41
0.14 -0.4 -0.28 -0.4 -0.59 -0.46 -0.57 -0.87 0.71 0.68 0.57 0.31
- 0.38 0.49 - 0.81 - 0.09 0.16 2.17 -2.25 -2.4 -1.11
- -1.37 - 0.85 - -1.11 -0.16 - 1.56 1.26 0.58 0.69
-0.86 -0.51 -2.34 0.23 -2.47 -0.58 -0.21 0.5 0.27 0.91 0.88 0.39
- - -1.23 - - 1.94 0.19 2.48 0.03 - - -
- - - - - 0.69 -1.45 1.94 1.69 -1.32 -0.02 0.66
1.1 1.02 -0.73 -3.14 - - - -0.72 1.22 0.89 0.92 -1.15
2.05 -1.0 - -2.3 - -0.38 -3.32 -2.01 1.98 -3.61 -0.77 0.53
0.28 0.03 -0.1 -0.55 -0.36 -0.14 -0.12 -0.09 0.19 0.26 0.33 0.01
0.12 - - 1.8 - 1.43 -0.78 1.15 - -0.62 - 0.35
0.03 -1.56 -1.6 -0.48 -0.44 -0.95 0.1 -0.37 0.89 0.89 0.71 0.21
0.45 - 1.86 - 0.12 -0.23 - - 1.76 - - 0.76
-1.08 -0.96 0.62 -0.35 -0.57 -0.17 0.07 -1.11 0.36 1.52 -0.03 -1.06
-0.89 -0.31 -0.26 -0.43 -0.12 -0.23 -0.39 0.19 0.56 0.58 0.28 0.27
0.74 - 1.65 -2.02 - - -0.16 - 1.9 0.38 - 0.01
- -0.03 - - - 1.28 -1.03 -1.03 2.37 -1.05 0.97 -
-0.37 -0.48 -0.16 -0.13 0.07 -0.06 0.1 0.51 0.22 0.06 -0.03 0.02
0.45 0.09 -0.21 -0.36 -0.22 -0.1 -0.21 -0.45 0.21 0.27 0.31 -0.09
-0.15 - -0.43 - -1.93 -0.84 1.19 -0.24 1.03 1.51 -0.03 -0.92
0.3 -0.31 -0.01 -0.2 -0.15 -0.14 -0.36 0.19 0.33 0.14 0.09 -0.07
- 0.75 0.03 -1.99 - - -0.55 - 1.54 1.45 -0.23 0.91
-0.14 -0.14 -0.15 0.02 -0.83 -0.68 0.22 0.48 -0.42 0.14 0.43 0.41
1.36 -1.56 -1.21 -0.38 -4.18 0.14 -0.2 -0.07 0.66 -0.86 -0.26 0.97
-0.07 -0.64 -0.04 -0.31 -0.13 -0.01 -0.12 -0.44 0.4 0.6 0.42 -0.17
0.23 -0.42 -0.19 -0.33 -0.38 -0.44 -0.36 -0.03 0.64 0.29 0.55 -0.14
-0.7 -0.67 -0.26 -0.88 -0.51 -0.76 -1.02 -0.28 1.21 0.4 1.0 0.18
-0.6 -2.32 -1.93 -0.8 -0.69 0.12 0.18 0.85 1.06 0.47 0.39 -0.17
-1.21 -1.34 - -3.88 -1.47 0.43 1.21 1.09 1.33 0.18 -1.6 -0.03
-0.03 -1.03 -1.16 -0.89 -1.49 0.47 0.72 0.7 0.71 0.17 -0.09 -0.28
-0.02 -0.09 -0.1 -0.04 -0.05 -0.13 0.0 0.06 0.01 0.11 0.14 0.06
-0.86 - -0.31 - 0.4 0.78 -1.42 1.44 0.92 -0.12 0.46 -1.58
0.58 -0.37 -0.2 -0.47 -0.3 -0.78 0.13 -0.71 0.91 -0.18 0.1 0.26
-0.02 -0.14 -0.54 -0.23 -0.51 -0.16 0.11 0.06 0.31 0.29 0.17 0.33
0.85 -0.38 0.89 -1.86 -1.96 -1.03 -0.74 0.23 1.36 -0.22 -1.3 -0.07
-0.47 -0.39 -0.44 -0.19 -0.32 -0.16 0.34 0.32 0.45 0.24 0.24 -0.05
0.5 -2.82 -0.99 -3.36 -0.46 -0.3 -1.48 -0.32 1.48 0.61 0.83 0.1
1.22 -1.04 0.19 -0.61 -1.3 -0.58 -0.29 -1.48 1.63 -0.2 -0.08 -2.18
0.16 -0.22 -0.39 -0.1 -0.16 -0.0 -0.26 -0.02 0.29 0.06 0.35 0.09
0.02 -0.02 -0.54 0.06 -0.33 -0.13 -0.01 -0.0 0.32 0.22 0.35 -0.18
-0.29 -0.24 -0.28 -0.32 -0.3 -0.29 -0.42 -0.15 0.49 0.13 0.56 0.54
-0.77 -0.6 -0.88 -0.31 -0.79 -0.48 0.13 0.02 0.64 0.8 0.35 0.52
2.33 - 0.42 - - - - - 1.64 - 0.8 -0.35
-1.35 -0.44 - 0.33 -1.77 1.22 0.66 -0.49 1.74 0.02 - -1.52

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.