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Heatmap: Cluster_12 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
-0.32 -0.0 0.3 0.24 -0.15 -0.18
-0.81 0.23 0.61 0.62 -0.52 -1.03
-0.78 0.09 0.48 0.12 0.07 -0.27
0.16 0.06 -0.28 -0.04 -0.1 0.16
0.2 -0.06 -1.02 -0.04 -0.37 0.73
0.93 0.04 0.2 -0.22 - 0.09
0.22 -0.6 -0.59 -0.45 0.36 0.59
0.53 -1.9 0.28 0.98 - 0.14
-0.07 -0.55 -0.52 -0.25 0.39 0.59
0.46 0.31 -0.0 0.39 -0.78 -1.02
-0.02 0.19 -0.09 0.33 -0.14 -0.4
- 1.52 - 1.64 - -
1.29 - 0.23 - - 1.26
-0.03 -0.79 -0.44 0.09 0.36 0.44
-0.06 -0.2 0.19 0.16 0.0 -0.14
-0.09 0.11 -0.05 0.08 -0.01 -0.06
0.4 0.22 0.23 -0.21 -1.0 -0.04
0.06 -0.22 -0.02 0.14 0.03 -0.02
-2.22 0.63 0.94 0.3 -0.52 -1.36
0.37 -0.36 -0.3 -0.05 0.15 0.06
-0.56 -0.13 0.37 0.24 -0.01 -0.07
-0.25 0.23 0.09 0.26 -0.04 -0.39
-1.53 -0.15 1.04 -0.02 -1.0 0.28
-0.3 0.4 -0.05 -0.0 -0.04 -0.09
-0.14 0.01 0.09 0.01 0.41 -0.54
-0.26 0.19 0.34 -0.57 0.26 -0.17
-0.21 -0.09 -0.25 0.41 0.0 0.03
-0.66 1.19 0.21 -2.55 0.03 -0.46
0.89 0.78 -0.52 0.07 - -0.56
0.96 -0.57 0.25 -0.24 - 0.42
-0.41 0.99 -0.0 0.51 -1.3 -1.23
-0.41 1.05 -0.52 0.79 -2.8 -0.71
0.34 0.52 -0.31 -0.02 -0.22 -0.61
-0.54 -0.54 -0.19 0.15 0.17 0.59
0.24 -0.67 -0.64 -0.46 0.4 0.6
0.3 0.43 -0.41 0.19 -0.42 -0.36
0.22 -0.49 -0.39 -0.23 0.43 0.21
-0.13 -0.79 -0.55 -0.21 0.51 0.62
-0.06 -1.46 -0.7 -0.11 0.6 0.69
-0.03 -0.28 0.61 -0.09 -0.23 -0.19
-1.4 0.94 0.62 0.19 -1.24 -0.74
- 2.02 - 0.95 -10.39 -
1.12 0.7 - 0.76 -0.97 -
-0.85 -1.59 -0.37 0.31 0.54 0.72
-0.12 0.65 -0.68 0.67 -1.25 -0.18
0.17 -0.12 -0.18 -0.18 0.22 0.03
-0.11 -0.03 -0.18 0.31 0.2 -0.28
-0.03 0.16 -0.06 0.0 -0.08 -0.01
0.1 - -0.77 0.77 0.31 0.49
-0.59 0.46 0.79 0.05 -0.71 -0.77
-1.2 0.72 1.03 -0.22 -0.67 -1.37
- - 1.66 - - 1.5
0.35 -0.62 -0.77 -0.65 0.27 0.71
-0.16 -1.14 -0.11 0.13 0.26 0.52
-0.05 -0.09 -0.15 -0.06 0.13 0.19
0.04 -0.3 0.01 0.09 0.06 0.06
0.12 -0.07 -0.17 0.07 0.09 -0.06
0.28 -0.22 -0.29 0.2 0.01 -0.07
-0.89 -1.72 -0.12 0.54 0.46 0.49
0.1 -0.19 -0.2 0.3 0.03 -0.1
- - 1.99 1.03 - -
-0.19 0.34 0.06 0.15 -0.05 -0.43
0.39 -0.15 -0.22 0.42 -0.55 -0.14
0.69 -0.26 -0.68 0.13 -0.05 -0.2
- - 1.78 1.36 - -
0.71 -0.53 -0.93 -0.54 0.05 0.5
1.42 - - 1.73 - -
0.09 -0.39 -0.28 0.01 0.22 0.24
- 1.12 0.36 1.16 -1.67 -
1.54 - -3.06 - - 1.58
-0.32 0.32 0.33 0.01 -0.15 -0.33
0.27 -0.05 -0.05 -0.07 -0.15 0.01
-0.79 0.12 0.08 0.59 0.06 -0.46
-0.56 -1.14 0.58 0.27 -0.49 0.54
0.97 - -1.01 0.4 -0.75 0.71
0.57 0.44 - - 0.63 0.68
-0.88 0.33 0.36 0.15 -0.34 0.02
0.86 0.51 -0.89 -0.55 -0.33 -0.43
0.21 -0.45 -0.6 -0.48 0.39 0.51
-0.03 0.73 -0.85 0.29 -0.39 -0.28
-0.54 0.24 0.65 0.38 -0.62 -0.7
0.06 -0.05 0.3 0.07 -0.18 -0.27
0.16 -0.43 -0.24 0.05 0.28 0.06
-0.63 -0.12 0.43 0.12 -0.25 0.22
-0.41 1.82 -1.15 0.33 - -
0.04 0.02 0.06 0.09 -0.27 0.04
-0.03 0.03 0.13 0.1 -0.05 -0.21
1.75 - - 1.4 - -
-0.25 -0.14 0.24 0.24 0.23 -0.49
0.53 -0.63 0.07 0.72 -1.18 -0.38
1.23 0.56 -2.13 -0.8 -0.48 -0.61
-0.07 -0.7 -0.49 0.37 0.42 0.12
0.42 -0.6 -0.23 - -0.12 1.15
-0.14 0.39 0.25 -0.03 -0.33 -0.29
0.34 -0.87 0.06 0.44 -0.62 0.18
0.55 - 1.16 1.2 - -
0.02 0.13 0.3 -0.13 -0.03 -0.39
-0.06 -0.22 -0.12 -0.06 0.12 0.28
0.25 0.25 -0.17 -0.09 -0.22 -0.1
0.06 0.01 0.04 0.05 -0.03 -0.14
-0.16 -0.14 -0.03 0.04 0.22 0.04
-0.01 -0.06 -0.02 -0.12 0.07 0.13
-0.21 0.16 -0.11 0.08 0.15 -0.12
-0.08 -1.02 -0.66 -0.21 0.67 0.56
-1.18 -0.26 0.19 0.47 0.75 -0.95
-0.39 -0.22 0.36 0.36 0.05 -0.37
0.79 - 0.54 1.49 - -
-0.55 -1.36 0.84 0.82 -0.63 -0.47
-0.01 -0.54 -0.32 0.5 -0.44 0.46
0.05 -0.51 -0.39 0.55 -0.32 0.31
-0.1 -0.27 0.22 0.07 0.11 -0.09
-0.13 0.01 0.01 -0.27 0.21 0.13
-0.2 -0.18 -0.09 0.36 -0.17 0.17
0.32 -0.1 -0.91 0.08 0.41 -0.16
0.07 -0.14 -0.08 -0.09 0.13 0.08
- 0.73 0.52 0.46 - 0.61
0.74 1.49 - - - 0.6
-0.57 0.53 -0.02 0.14 -0.36 0.03
0.15 -0.72 -0.21 -0.3 0.12 0.61
-0.08 1.23 -2.07 0.98 -1.02 -
-0.11 -0.55 -0.17 0.2 0.26 0.2
-2.08 0.07 1.19 -0.41 -0.49 -0.05
-0.27 0.26 0.24 0.08 -0.14 -0.27
-0.33 0.71 0.34 0.44 -0.55 -1.88
-0.55 -0.88 -0.24 0.11 0.35 0.66
-0.05 -0.09 -0.02 0.32 0.03 -0.25
-0.36 -0.31 0.06 0.16 0.37 -0.04
0.09 -0.22 0.1 -0.21 0.17 0.03
-1.54 -1.71 -0.04 0.57 1.03 -0.22
1.76 - - 1.38 - -
- 1.49 - - - 1.67
-0.21 -0.06 0.13 0.23 -0.08 -0.06
-0.37 -0.22 -0.34 0.91 -0.04 -0.48
-1.0 1.41 0.39 -0.32 -0.98 -2.12
0.09 0.12 -0.05 -0.11 -0.08 0.01
-2.1 0.94 1.01 0.62 - -1.71
-0.27 0.45 0.04 -0.02 -0.35 -0.0
-0.37 0.49 0.49 -0.04 -0.12 -0.96
0.19 0.05 -0.08 -0.03 -0.11 -0.04
0.16 -0.14 0.1 0.13 -0.24 -0.06
0.0 -0.39 0.03 -0.07 0.36 -0.03
-0.44 -0.43 -1.06 0.27 0.27 0.71
-0.07 -0.32 -0.39 0.61 -0.46 0.3
-0.93 -0.34 0.31 0.03 0.31 0.24
-1.41 -0.07 0.67 1.0 - 0.11
-0.17 -0.4 -0.02 0.3 -0.05 0.23
0.85 0.14 -0.2 -0.04 -0.95 -0.45
0.11 -0.22 -0.15 -0.19 0.23 0.14
-0.84 -0.66 0.02 -0.9 0.71 0.69
0.29 -0.03 -0.17 -0.15 0.0 0.01
-0.14 -0.4 -0.04 0.12 0.21 0.15
-1.58 -0.22 0.63 0.52 -0.03 -0.23
-0.19 0.24 0.29 -0.05 -0.11 -0.28
0.1 -0.06 0.17 0.13 -0.04 -0.38
-0.12 -0.14 -0.16 0.07 0.11 0.2
-0.4 -1.16 -0.21 0.54 0.65 -0.13
-0.33 0.46 0.35 0.01 -0.37 -0.38
0.65 -0.24 -1.19 -0.34 0.37 0.1
-0.12 -0.08 0.22 0.24 -0.24 -0.09
-0.77 0.93 -1.79 1.69 - -
-0.57 0.03 0.35 0.55 -0.21 -0.51
-0.29 -0.61 0.15 -0.42 0.47 0.37
-0.95 0.73 0.74 0.44 -1.22 -1.41
0.09 -0.64 -0.41 -0.07 0.4 0.34
0.07 -0.17 -0.14 -0.27 -0.08 0.47
-0.57 -0.37 0.25 0.63 -0.02 -0.27
-0.34 -1.52 -0.18 0.91 -0.17 0.27
-0.57 -0.38 0.46 0.27 -0.23 0.17
-0.35 0.25 -0.4 0.12 0.2 0.05
1.75 - - 1.4 - -
-0.21 -0.02 -0.08 -0.07 0.09 0.25
- 0.01 1.5 -0.2 - 0.38
-0.3 0.12 0.35 0.11 -0.19 -0.2
-0.38 0.32 -0.1 0.51 -0.52 -0.11
0.45 -0.55 -0.54 -0.35 0.23 0.38
-0.59 -0.82 -0.37 0.23 0.61 0.38
-0.09 0.13 -0.27 0.02 0.18 -0.01
1.02 0.93 - 1.04 - -
-2.65 0.9 1.11 0.25 -2.46 -1.14
-0.02 - 0.11 0.04 -0.03 0.95
-0.16 -0.07 -0.09 0.07 0.11 0.12
0.57 -2.36 -0.05 -0.51 0.39 0.43
-0.39 -0.06 0.13 -0.07 0.35 -0.06
1.1 -0.86 - -0.22 - 1.29
- 1.64 - 1.53 - -
-0.4 -0.78 0.16 -0.34 0.53 0.39
0.57 1.48 - - 0.79 -
-0.59 -0.33 0.11 0.18 0.14 0.29
-0.72 0.0 -0.02 0.17 0.29 0.08
0.82 1.06 - 1.11 - -
0.1 1.15 -0.09 0.5 -2.71 -2.33
0.38 0.79 -0.33 -0.61 0.23 -1.54
-2.6 0.9 -0.07 0.63 0.06 -1.22
-0.07 0.39 -0.3 0.46 -0.78 -0.04
-0.26 0.32 -0.28 -0.36 0.05 0.36
0.59 0.52 -0.24 0.32 -0.92 -1.23
-0.41 0.26 0.21 0.27 -0.61 0.05
-0.57 -0.12 -0.24 0.13 0.29 0.31
-0.38 -0.38 -0.23 0.25 0.24 0.31
-1.36 -0.11 -0.39 0.5 -0.26 0.74
-0.39 -0.57 -0.12 0.24 0.38 0.2
-0.69 -0.08 0.4 0.34 -0.27 0.04
-0.16 0.01 0.23 0.16 -0.07 -0.24
-0.37 0.13 -0.02 -0.07 0.13 0.13
0.2 1.27 -0.56 -0.09 -0.68 -2.34
-0.21 -0.24 -0.01 -0.08 0.26 0.2
-0.08 - - 1.06 0.96 0.03
- 1.62 - 0.37 0.7 -
-0.15 0.06 0.1 0.03 -0.02 -0.03
1.0 -0.08 -0.37 -0.61 0.42 -1.84
0.47 -0.28 -0.63 -1.31 0.49 0.42
0.17 -0.26 -0.34 0.41 -0.39 0.21
-0.42 0.0 0.21 0.4 -0.22 -0.12
-0.58 -0.01 0.25 0.22 0.16 -0.2
-1.51 1.55 -0.61 1.05 - -
-0.2 0.15 0.5 0.24 -0.32 -0.67
-0.25 0.44 0.07 0.06 -0.31 -0.14
-0.03 0.03 0.06 0.05 -0.01 -0.1
-0.17 0.09 0.1 0.03 -0.05 -0.03
-0.48 0.03 0.35 0.15 -0.08 -0.1
-0.13 -0.49 -0.02 0.21 0.15 0.16
0.39 0.23 -0.2 0.03 -0.25 -0.35
-0.4 0.32 0.58 0.49 -0.47 -1.43
-0.28 -0.58 0.1 -0.38 0.33 0.5
1.63 1.54 - - - -
-1.23 0.38 0.68 0.36 -0.24 -0.88
0.2 0.34 -0.18 0.22 -1.03 0.07
0.59 -0.58 0.29 0.19 -2.58 0.37
0.2 -0.04 -0.3 0.3 -0.15 -0.09
-1.31 0.12 0.27 0.82 -0.05 -0.82
- 1.16 0.99 -13.75 - 0.83
-0.9 0.56 0.72 0.46 -0.75 -1.43
-0.09 0.1 0.14 0.12 -0.07 -0.24
-0.48 0.36 -0.0 0.73 -0.9 -0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.