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Heatmap: Cluster_10 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
3 h after light
7 h after light
11 h after light
2 h after dark
6 h after dark
10 h after dark
-0.43 0.1 0.12 -0.39 0.96 -1.37
0.29 0.04 -0.29 -0.03 0.2 -0.31
-0.49 -0.35 -0.37 -0.02 0.58 0.31
0.82 -0.55 -0.68 0.22 -0.13 -0.24
0.02 -0.14 -0.41 -0.14 0.38 0.15
-0.03 0.25 -0.17 -0.48 0.39 -0.14
0.28 0.31 -0.61 -0.55 0.4 -0.16
0.06 -0.33 -0.49 -0.14 0.52 0.14
0.02 -0.43 -0.06 0.1 0.29 -0.02
-0.02 -0.1 -0.32 -0.06 0.34 0.07
0.04 -0.09 -0.36 -0.13 0.36 0.08
-0.03 -0.15 -0.06 0.04 0.21 -0.04
0.1 -0.16 -0.91 0.16 0.73 -0.47
0.26 -0.16 -0.46 0.03 0.43 -0.3
0.44 -0.01 -0.69 0.17 0.13 -0.3
-0.29 0.07 0.1 -0.12 0.22 -0.04
-0.3 0.2 0.16 -0.09 0.17 -0.22
0.26 -0.13 -0.44 0.02 0.21 -0.04
0.03 0.1 -0.42 0.12 0.44 -0.5
0.08 -0.12 -1.04 0.04 0.78 -0.33
-0.65 0.39 0.14 -0.18 -0.02 0.11
0.69 - - 1.37 0.84 -
-0.12 -0.3 -0.04 0.17 0.39 -0.21
-0.55 -0.62 -0.35 0.52 0.64 -0.16
0.1 0.24 -0.51 -0.23 0.42 -0.22
-0.07 0.08 -0.18 -0.13 0.29 -0.05
0.25 -0.19 -0.12 -0.05 0.22 -0.19
0.66 -0.39 -0.96 -0.07 0.51 -0.39
-0.29 0.35 -0.02 -0.14 0.03 -0.0
-0.06 -0.18 -0.2 0.25 0.24 -0.13
0.16 0.06 -0.1 -0.13 0.21 -0.26
0.69 0.18 -0.81 -0.24 -0.05 -0.19
-0.7 0.13 -0.63 -0.05 1.07 -0.78
-0.22 -0.04 -1.2 0.11 1.03 -0.7
-0.18 0.09 -0.28 -0.1 0.42 -0.07
-0.09 0.24 -0.58 -0.04 0.79 -0.97
0.2 -0.04 -0.14 -0.21 0.14 0.01
-0.22 -0.7 -0.23 0.19 0.74 -0.21
-0.01 -0.49 -0.34 0.26 0.4 -0.01
-0.24 0.06 -0.26 -0.02 0.21 0.18
0.5 0.08 -0.78 -0.51 0.45 -0.19
0.18 -0.18 -0.89 0.02 0.74 -0.4
0.18 -0.3 -0.39 -0.0 0.42 -0.06
0.37 0.06 -1.53 -0.04 0.76 -0.62
-0.47 -0.18 -0.22 0.39 -0.43 0.57
0.44 0.06 -0.81 0.06 0.08 -0.1
0.28 -0.38 -0.93 0.4 0.54 -0.5
-0.09 -0.03 -0.09 -0.2 0.03 0.32
-0.12 -0.11 -0.16 0.07 0.32 -0.06
-0.14 0.18 -0.11 -0.0 -0.07 0.11
- 0.35 1.42 -0.48 -0.03 -1.48
0.16 - 0.98 1.37 -1.67 -
- 0.97 - -1.49 1.46 -0.11
0.07 -0.27 -0.22 0.17 0.29 -0.14
0.75 -1.02 -0.8 0.73 -1.5 0.31
0.5 0.08 -1.42 0.08 0.23 -0.1
0.55 0.6 -2.79 -0.45 0.37 -0.23
-0.55 0.22 -0.0 -0.05 0.4 -0.2
-0.07 0.02 -0.08 0.12 0.3 -0.37
0.24 0.2 -0.92 -0.09 0.36 -0.12
1.3 - -1.12 0.74 -0.45 -0.55
-0.17 0.57 -0.28 -0.22 0.38 -0.64
0.79 - -0.97 0.21 0.49 0.26
0.28 0.05 -0.39 -0.19 0.35 -0.27
-0.84 0.04 -1.37 0.28 1.08 -0.52
0.29 -0.09 -0.54 -0.27 0.41 -0.02
0.81 -0.03 -1.3 -0.06 0.66 -1.66
0.6 -0.74 -0.95 -0.01 0.88 -0.93
-0.05 0.18 -0.08 -0.1 0.32 -0.37
0.71 0.37 -2.42 -0.4 0.56 -0.59
-0.0 -0.45 -0.08 0.1 0.14 0.19
0.62 -0.02 -0.11 -0.3 -0.45 0.01
-0.0 0.18 -0.07 -0.14 0.01 -0.0
-0.14 0.11 0.04 0.08 -0.09 -0.02
0.63 -0.57 -0.89 0.08 0.29 -0.06
0.09 0.01 -0.04 -0.03 0.02 -0.05
0.14 0.08 -0.36 -0.35 0.35 -0.0
0.69 -0.5 -1.39 -0.85 1.29 -1.75
0.07 -0.3 -1.29 0.33 0.23 0.38
0.32 0.13 -0.65 -0.07 0.38 -0.38
0.74 0.93 -1.1 -0.16 0.08 -
0.13 0.02 -0.32 -0.16 0.42 -0.22
0.06 -0.07 -0.09 -0.11 0.42 -0.33
0.47 -0.02 -1.81 -0.42 0.88 -0.4
0.56 0.61 -1.17 -0.42 0.39 -0.98
0.13 0.13 -0.2 -0.07 0.03 -0.05
-0.09 0.05 -0.11 -0.08 0.32 -0.15
0.96 0.59 -1.07 -1.52 -0.32 -0.12
0.76 0.02 -2.67 0.04 0.68 -1.01
-0.06 0.18 -0.37 -0.07 0.54 -0.47
0.79 - -1.05 -1.57 0.42 1.08
-1.3 0.45 -0.14 -0.03 0.12 0.33
0.83 -0.43 - 0.56 0.38 -0.51
-0.21 -0.36 -0.01 0.4 0.27 -0.27
0.38 0.34 0.5 -0.0 0.03 -
0.35 -0.08 -1.06 0.06 0.75 -0.79
0.34 -0.11 -0.8 -0.06 0.76 -0.78
0.09 -0.21 -0.47 -0.24 0.49 0.13
0.16 -0.45 -1.99 0.03 0.73 0.29
-0.12 0.19 -0.34 -0.12 0.45 -0.21
-0.1 0.15 0.01 -0.02 0.12 -0.19
-0.05 -0.1 -0.33 0.06 0.55 -0.32
-0.27 0.37 -0.09 -0.15 0.38 -0.44
0.55 -0.82 -0.75 0.29 0.87 -1.63
0.04 0.04 -0.38 0.01 0.34 -0.16
-0.0 -0.38 -0.18 0.31 0.52 -0.56
-0.24 -0.08 0.04 0.02 0.45 -0.33
0.33 0.19 -0.45 -0.11 0.07 -0.16
-0.19 -0.2 -0.45 0.1 0.61 -0.11
-0.26 -0.1 -0.14 0.33 0.22 -0.14
0.13 -0.02 -0.4 -0.12 0.29 0.02
0.08 0.1 -0.48 -0.3 0.36 0.09
0.05 -0.05 -0.36 -0.29 0.6 -0.17
-0.15 0.15 0.28 0.11 -0.42 -0.08
-0.1 0.07 -0.2 -0.19 0.53 -0.27
-0.18 -0.16 -0.2 0.13 0.39 -0.08
0.49 -0.4 -0.26 -0.61 0.42 0.01
0.05 0.06 -0.13 -0.02 0.35 -0.42
1.24 - -0.99 0.98 0.23 -
-0.06 -0.27 -0.07 0.17 0.17 0.01
-1.62 -1.16 0.45 0.25 0.82 -0.15
-0.02 -0.01 -0.19 -0.12 0.52 -0.32
-0.05 0.06 -0.04 -0.12 0.22 -0.09
-0.42 0.05 0.22 0.02 0.15 -0.11
0.04 0.1 -0.13 -0.15 0.26 -0.18
0.05 -0.09 0.04 -0.13 0.01 0.11
0.32 0.08 -0.55 -0.16 0.34 -0.23
-0.64 -0.21 -0.21 0.37 0.52 -0.14
0.45 -0.01 -0.42 -0.09 0.37 -0.6
0.29 -0.17 -0.84 0.15 0.47 -0.26
0.34 0.28 -0.22 -0.6 0.24 -0.29
-0.55 0.43 -0.22 0.43 0.5 -1.49
-0.02 -0.03 0.1 -0.08 0.24 -0.26
-0.22 0.05 -0.01 -0.11 0.32 -0.1
0.03 -0.07 -0.14 -0.01 0.4 -0.32
-0.11 0.28 -0.1 0.2 0.05 -0.44
-0.04 -0.68 -0.72 0.39 0.91 -0.73
0.07 -0.08 -0.1 -0.16 0.26 -0.03
0.07 -0.41 -0.44 -0.1 0.61 -0.0
-1.08 0.52 0.03 -0.17 -0.28 0.45
-0.66 0.13 -0.6 0.31 0.41 0.06
0.04 -0.08 -0.18 -0.03 0.28 -0.07
0.49 0.58 -0.25 -1.0 -0.24 -0.13
0.62 -0.3 -0.88 0.09 0.13 -0.07
-0.03 -0.07 -0.08 0.16 0.17 -0.19
0.31 0.06 -0.54 -0.17 0.25 -0.07
0.09 -0.2 0.48 0.53 -0.38 -1.14
0.14 -0.32 -0.7 0.08 0.64 -0.22
0.21 -0.05 -0.39 -0.44 0.55 -0.13
0.26 0.33 -0.78 -0.44 0.52 -0.34
0.8 -0.4 -0.5 -0.29 -0.03 -0.0
0.75 0.68 -0.85 -1.2 0.36 -1.19
0.27 - -0.01 1.71 - -0.9
0.65 -0.33 -0.49 0.46 -0.28 -0.45
0.32 0.32 -0.63 -0.36 0.64 -0.95
0.09 -0.08 -0.83 0.06 0.59 -0.18
0.96 0.39 -2.11 -0.81 0.44 -0.8
-0.74 0.06 0.14 0.2 0.41 -0.37
0.95 1.27 - -1.03 0.22 -
0.07 0.16 -0.45 0.22 0.09 -0.19
0.62 -0.31 -3.33 -0.16 0.67 0.11
0.22 -0.56 -0.61 0.04 0.48 0.1
-0.01 -1.27 -1.57 0.78 0.69 -0.11
-0.07 -0.14 -0.24 0.11 0.46 -0.25
0.82 -0.02 -0.07 0.48 -0.16 -
0.5 -0.11 -1.15 -0.0 0.71 -0.77
-0.19 0.53 0.2 -0.2 0.16 -0.89
0.13 0.2 -0.38 0.03 0.15 -0.22
0.15 0.24 -0.36 -0.38 0.55 -0.52
-0.12 -0.28 -0.18 0.5 0.28 -0.43
0.03 0.99 -1.26 0.98 -2.13 -1.42
-0.54 0.28 -0.14 0.71 0.27 -1.51
0.09 -0.23 -0.45 -0.05 0.5 -0.04
-0.47 -0.14 0.17 0.22 0.45 -0.49
-0.28 0.14 0.33 -0.29 0.07 -0.08
0.1 0.22 -0.08 -0.21 0.05 -0.13
-0.09 0.08 0.09 0.39 0.05 -0.76
0.38 0.55 0.64 0.05 -0.63 -
1.14 - - 1.93 - -
0.48 -0.32 -0.42 0.34 0.4 -1.09
0.03 -0.14 0.06 0.09 0.04 -0.1
-0.82 0.26 0.29 0.21 0.16 -0.43
1.15 -1.5 -0.8 -0.0 0.29 -0.68
0.72 0.26 -0.94 -0.29 0.19 -0.58
0.56 0.72 -2.07 -0.1 0.35 -1.2
0.14 0.49 0.12 -0.0 -0.03 -1.22
1.04 0.54 - 0.42 - 0.2
0.15 0.02 0.0 -0.16 0.17 -0.22
0.13 0.09 -0.6 -0.17 0.55 -0.28
-0.92 -0.4 0.32 -0.64 0.64 0.34
-0.22 0.03 0.09 -0.02 0.35 -0.32
0.38 -0.47 - 0.31 0.15 0.7
1.73 0.45 - - 0.39 -
0.09 0.23 -0.1 -0.43 0.55 -0.68
0.55 -0.84 -0.84 -0.48 1.15 -1.04
0.6 -0.21 -0.51 -0.23 0.27 -0.23
-0.05 0.13 0.11 -0.34 0.28 -0.21
0.38 -0.18 -0.62 -0.08 0.19 0.1
-0.44 0.39 -0.06 -0.37 0.35 -0.09
0.33 -0.06 -0.66 -0.06 0.38 -0.16
0.96 0.02 -1.54 -0.07 0.49 -1.54
0.17 0.2 -0.24 -0.13 0.12 -0.19
-0.96 -0.62 -0.11 -1.56 0.99 0.66
-0.21 -0.37 -0.24 0.16 0.37 0.14
1.7 -0.45 - -0.2 0.2 -
0.35 -0.69 -2.43 0.41 0.42 0.31
0.91 -0.28 -1.07 0.29 -0.12 -0.54
-0.05 -0.29 0.01 0.13 0.11 0.05
-0.09 -0.04 -0.12 -0.17 0.3 0.06
-0.18 0.18 0.15 -0.02 0.19 -0.42
0.07 -0.09 -0.36 -0.25 0.56 -0.13
0.15 -0.27 0.85 -0.73 -0.08 -0.48
-0.27 -0.07 0.15 -0.09 0.42 -0.27
0.54 0.03 -0.46 -0.51 0.55 -0.65
0.22 0.05 -1.44 -0.75 1.11 -0.57
0.2 0.24 -0.41 -0.19 0.31 -0.32
1.12 0.56 0.68 - -0.41 -
0.68 -2.19 -3.07 1.23 0.08 -0.6
0.32 0.26 -0.25 -0.63 0.64 -0.96
-0.28 -0.06 -0.04 0.31 0.41 -0.57
-0.03 -0.68 -0.75 0.2 0.8 -0.13
-0.45 -0.59 -0.35 0.38 0.37 0.3
0.91 -0.48 - 0.35 0.51 -0.52
-1.51 0.86 0.58 -0.02 0.0 -1.53
-1.36 0.87 0.54 -0.12 0.03 -1.35
-0.12 -0.81 -0.15 -0.32 0.83 0.03
-0.95 -0.21 -0.22 0.19 0.65 0.06
-0.07 -0.11 0.07 0.13 0.06 -0.1
0.67 0.39 -1.77 -0.16 0.28 -0.52
0.46 -0.61 -0.8 0.58 -0.64 0.34
1.16 -0.69 -0.47 0.16 0.07 -1.97
0.34 -0.7 -1.24 0.23 0.38 0.28
0.24 -0.86 -1.0 -0.1 0.84 0.07
0.99 0.08 -0.7 0.73 -1.18 -2.02
0.25 0.04 -0.41 0.26 0.17 -0.5
0.17 -0.38 -0.61 -0.34 0.96 -0.49
-0.0 0.12 -0.04 -0.09 -0.11 0.11
0.47 -0.66 -1.63 0.71 0.36 -0.42
0.86 0.14 0.17 0.0 -0.46 -2.16
0.15 -0.11 -0.22 0.12 0.09 -0.06
0.14 -0.15 -0.46 -0.11 0.4 0.03
-0.42 -0.49 0.14 0.37 0.05 0.15
0.71 -0.08 -0.34 -0.62 -0.46 0.33
0.27 -1.47 -2.85 0.3 0.97 0.14
-0.05 0.46 -1.82 -0.15 0.87 -0.61
0.24 0.15 -1.48 0.13 0.34 -0.02
0.43 -0.14 -1.46 0.27 0.64 -0.69
-0.07 -0.12 0.22 0.2 0.19 -0.58
-0.5 -0.18 0.09 0.24 0.37 -0.2
0.13 0.12 -0.25 -0.16 0.19 -0.1
0.39 0.43 -0.89 -0.53 0.43 -0.4
0.23 -0.02 -1.05 -0.11 0.83 -0.62
1.53 1.03 -1.25 - -0.61 -
-0.06 -0.61 -1.03 0.47 0.37 0.27
0.34 -0.15 -0.99 0.05 0.78 -0.8
-0.15 0.12 -0.31 -0.4 0.55 -0.03
0.13 -0.4 -0.57 0.14 0.39 0.09
0.79 -1.59 0.08 0.36 -0.25 -0.39
0.1 -1.36 -1.02 0.39 0.38 0.52
-0.03 -0.09 -0.24 -0.03 0.43 -0.14
-0.08 -0.1 -0.11 0.23 0.33 -0.38
0.05 -0.06 -0.32 0.02 0.47 -0.32
-0.05 0.09 -0.5 0.29 0.61 -0.97
-0.33 -0.04 -0.78 0.29 0.88 -0.8
-0.16 -0.09 0.02 0.07 0.07 0.08
0.12 0.07 0.06 -0.51 0.32 -0.19
-2.15 -0.13 0.47 0.05 0.57 -0.05
-0.04 -0.42 -0.49 0.11 0.73 -0.26
0.07 0.18 -1.12 -0.15 0.78 -0.45
0.49 1.01 -2.62 0.26 0.28 -
-0.1 -0.0 -0.18 0.04 0.37 -0.22
0.01 -0.66 -0.16 0.26 0.19 0.17
1.1 0.21 -2.19 1.09 - -1.5
0.01 -0.06 -0.35 -0.1 0.46 -0.09
0.88 -0.66 - -0.29 1.43 -
0.1 -0.04 -0.43 -0.18 0.38 0.04
-0.26 -0.02 0.02 0.17 0.26 -0.24
0.27 0.04 -0.42 -0.04 0.16 -0.11
-0.35 -0.1 -0.01 0.25 0.46 -0.46
0.22 -0.38 -0.11 0.38 0.14 -0.43
0.12 -0.44 -0.49 0.36 0.32 -0.09
0.96 0.32 - 0.2 0.72 -
1.93 0.39 -0.2 - - -
-0.25 1.44 -0.75 -1.25 0.51 -
-0.28 -0.51 -0.09 0.24 0.38 0.06
-0.5 -0.61 -0.56 0.54 0.6 -0.01
0.42 0.15 -1.1 -0.06 0.51 -0.5
-0.85 0.22 0.04 -0.44 0.31 0.36
-0.17 -0.39 -0.51 0.29 0.46 0.07
0.01 -0.03 -0.33 -0.15 0.31 0.1
0.25 -0.18 -0.79 0.13 0.52 -0.29
-0.08 0.12 0.02 -0.34 0.86 -1.52
0.32 -0.22 -1.15 -0.09 0.64 -0.08
0.63 -0.03 -1.6 0.15 0.56 -0.86
-0.23 -0.08 -0.14 0.22 0.48 -0.46
0.06 -0.23 -0.25 -0.08 0.38 0.03
0.24 -0.28 -0.51 -0.16 0.6 -0.18
-0.2 0.13 -0.03 0.07 0.32 -0.4
0.13 -0.23 0.04 0.44 -0.0 -0.58
0.35 -0.55 -0.53 0.4 0.26 -0.26
1.25 1.85 - - - -
0.19 -0.3 0.34 - -0.45 1.03
0.02 -0.15 -0.1 0.18 0.33 -0.38
0.13 0.2 -1.67 0.03 0.47 0.05
0.0 0.23 - 0.61 1.2 -
-1.48 0.69 -1.15 0.89 -0.93 0.26
0.04 -0.21 -0.1 -0.03 0.39 -0.18
0.88 0.02 -1.34 -0.34 0.48 -0.84
0.1 0.01 -0.16 -0.13 0.48 -0.48
0.03 -0.06 -0.32 -0.34 0.55 -0.06
0.11 -0.31 -0.7 -0.09 0.61 0.03
-0.03 -0.12 -0.31 -0.2 0.54 -0.04
0.63 0.65 -0.61 0.47 -0.72 -2.1
0.17 0.14 -0.38 0.07 0.23 -0.37
-0.03 -0.03 -0.23 0.09 0.4 -0.32
-0.25 -0.11 -0.13 -0.04 0.52 -0.15
-0.16 0.18 -0.45 -0.3 0.45 0.08
-0.02 -0.05 -0.32 -0.05 0.45 -0.14
0.71 -0.07 -0.77 0.32 0.56 -3.28
-1.25 0.1 0.15 -0.22 0.51 0.15
0.12 0.52 -0.9 0.1 -1.0 0.45
-0.26 -0.02 -0.08 0.04 0.33 -0.08
0.88 1.71 - - -0.16 -
-0.74 0.52 - -0.7 1.47 -0.78
1.9 -3.03 -1.1 - -0.3 -0.19
-0.08 -0.12 -0.35 0.01 0.5 -0.11
-0.19 -0.71 0.14 0.3 0.18 0.06
0.14 -0.31 -0.62 -0.11 0.6 -0.02
0.42 -0.13 -0.76 -0.07 0.54 -0.42
-0.25 -0.16 -0.14 -0.0 0.45 -0.0
0.31 -0.41 -1.04 -0.18 0.67 0.07
0.58 0.09 -0.57 -0.33 -0.05 0.0
-0.07 -1.16 -0.59 0.34 0.66 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.