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Heatmap: Cluster_3 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.96 1.0 0.88 0.76 0.79 0.75 0.6 0.71 0.47 0.42 0.44 0.4
0.62 0.63 0.78 1.0 0.7 0.38 0.34 0.4 0.21 0.25 0.32 0.38
1.0 0.58 0.44 0.93 0.5 0.24 0.27 0.3 0.17 0.25 0.28 0.33
0.8 0.84 0.88 0.86 1.0 0.81 0.56 0.38 0.41 0.49 0.6 0.77
0.7 1.0 0.94 0.72 0.85 0.8 0.8 0.83 0.46 0.33 0.26 0.26
0.66 1.0 0.92 0.89 1.0 0.9 0.84 0.86 0.56 0.65 0.5 0.62
0.23 0.36 0.26 0.36 1.0 0.86 0.37 0.34 0.22 0.21 0.23 0.2
0.71 0.85 0.78 0.8 0.93 0.9 1.0 0.9 0.81 0.65 0.59 0.51
0.72 0.86 1.0 0.81 0.87 0.91 0.78 0.69 0.54 0.4 0.28 0.26
0.96 0.91 0.82 0.92 1.0 0.93 0.81 0.77 0.86 0.83 0.65 0.87
0.88 0.94 0.96 1.0 0.97 0.96 0.81 0.95 0.78 0.7 0.77 0.83
0.64 0.81 0.94 0.88 0.87 0.9 0.96 1.0 0.82 0.72 0.69 0.68
1.0 0.96 0.98 0.91 0.97 0.95 0.83 0.86 0.79 0.73 0.7 0.69
0.9 0.99 1.0 0.87 0.94 0.88 0.74 0.78 0.71 0.63 0.54 0.59
0.52 0.78 0.9 0.71 0.72 0.99 0.97 1.0 0.72 0.6 0.53 0.61
0.59 0.75 0.73 0.75 1.0 0.91 0.6 0.51 0.5 0.6 0.55 0.54
0.83 1.0 0.94 0.97 0.88 0.78 0.84 0.82 0.69 0.63 0.7 0.73
0.9 0.94 0.97 1.0 0.98 0.96 0.78 0.91 0.76 0.7 0.62 0.51
0.88 1.0 0.87 0.96 0.96 0.87 0.73 0.74 0.71 0.74 0.75 0.63
1.0 0.95 0.82 0.93 0.88 0.88 0.79 0.77 0.75 0.54 0.62 0.66
0.9 0.61 0.52 1.0 0.74 0.31 0.2 0.19 0.08 0.13 0.14 0.16
0.83 0.9 1.0 0.93 0.76 0.66 0.73 0.89 0.72 0.67 0.79 0.75
0.84 0.78 0.97 1.0 0.67 0.49 0.44 0.34 0.22 0.18 0.25 0.3
0.77 0.82 0.8 1.0 0.74 0.66 0.62 0.52 0.61 0.51 0.46 0.59
1.0 0.58 0.51 0.92 0.54 0.2 0.26 0.27 0.21 0.28 0.3 0.37
1.0 0.68 0.58 0.53 0.54 0.64 0.61 0.65 0.53 0.35 0.33 0.28
0.31 0.45 0.33 0.46 1.0 0.83 0.38 0.31 0.28 0.3 0.21 0.26
0.95 1.0 0.94 0.75 0.72 0.75 0.8 0.75 0.51 0.38 0.4 0.46
0.69 0.82 0.86 0.9 1.0 0.69 0.38 0.35 0.34 0.42 0.53 0.65
0.0 0.88 0.4 0.2 1.0 0.9 0.42 0.45 0.18 0.19 0.0 0.42
1.0 0.86 0.58 0.64 0.67 0.48 0.75 0.43 0.39 0.44 0.38 0.3
1.0 0.3 0.43 0.53 0.19 0.42 0.91 0.75 0.74 0.69 0.21 0.17
0.0 0.38 0.0 0.0 0.44 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.59 0.7 0.77 0.87 1.0 0.71 0.36 0.31 0.27 0.3 0.41 0.54
0.86 0.86 1.0 1.0 0.97 0.86 0.58 0.42 0.44 0.49 0.64 0.77
0.58 0.96 0.74 0.67 0.87 0.86 1.0 0.65 0.78 0.76 0.77 0.92
0.73 0.85 1.0 0.74 0.9 0.95 0.84 0.78 0.86 0.85 0.8 0.75
1.0 0.61 0.35 0.49 0.39 0.39 0.45 0.66 0.16 0.04 0.04 0.04
1.0 0.92 0.94 0.75 0.79 0.88 0.73 0.77 0.73 0.67 0.62 0.62
1.0 0.36 0.33 0.62 0.8 0.73 0.56 0.41 0.43 0.36 0.29 0.41
0.7 1.0 0.93 0.86 0.97 0.93 0.9 0.72 0.82 0.82 0.77 0.83
0.95 1.0 1.0 1.0 0.94 0.92 0.81 0.9 0.8 0.79 0.79 0.76
0.39 0.73 0.68 0.72 0.72 1.0 0.67 0.63 0.67 0.53 0.55 0.56
0.84 0.99 1.0 0.83 0.81 0.75 0.8 0.87 0.52 0.45 0.53 0.47
0.9 0.86 0.8 0.67 0.64 1.0 0.89 0.73 0.6 0.61 0.56 0.57
0.96 0.79 0.78 0.72 0.84 1.0 0.97 0.76 0.76 0.73 0.69 0.76
0.6 0.77 1.0 0.72 0.68 0.63 0.76 0.78 0.54 0.39 0.4 0.45
0.58 0.89 1.0 1.0 0.91 0.81 0.66 0.6 0.37 0.44 0.45 0.54
0.74 1.0 0.91 0.85 0.79 0.73 0.76 0.75 0.68 0.54 0.55 0.5
0.53 1.0 0.98 0.9 0.64 0.45 0.58 0.75 0.61 0.46 0.44 0.45
0.92 0.97 0.99 1.0 1.0 0.82 0.53 0.42 0.46 0.53 0.65 0.83
0.87 1.0 0.8 0.78 0.86 0.73 0.57 0.75 0.55 0.52 0.43 0.41
0.86 1.0 0.98 0.96 0.99 0.82 0.58 0.47 0.51 0.51 0.54 0.68
0.79 0.82 0.84 0.79 1.0 0.94 0.67 0.65 0.48 0.49 0.49 0.56
0.51 0.89 1.0 0.83 0.81 0.82 0.56 0.71 0.4 0.23 0.34 0.42
0.73 1.0 0.95 0.92 0.94 0.93 0.71 0.88 0.47 0.31 0.33 0.31
0.82 0.97 0.92 0.65 0.94 1.0 0.99 0.92 0.8 0.84 0.83 0.89
0.7 0.78 0.88 0.82 0.89 1.0 0.68 0.64 0.59 0.49 0.47 0.56
0.57 0.26 0.41 0.44 0.75 0.7 0.67 1.0 0.41 0.36 0.25 0.81
0.93 0.96 1.0 0.91 0.91 0.69 0.65 0.73 0.72 0.68 0.63 0.71
0.45 0.91 1.0 0.7 0.78 0.9 0.97 0.95 0.61 0.63 0.63 0.6
0.85 0.97 0.81 0.73 0.88 0.91 0.89 0.61 1.0 0.7 0.55 0.48
0.87 0.92 0.85 0.79 0.94 1.0 0.91 0.82 0.63 0.47 0.38 0.3
0.57 0.83 0.57 1.0 0.77 0.21 0.18 0.16 0.11 0.16 0.11 0.1
0.86 0.92 0.99 0.94 1.0 0.82 0.55 0.39 0.43 0.51 0.64 0.83
0.34 0.47 0.59 1.0 0.36 0.2 0.25 0.1 0.15 0.16 0.3 0.37
0.58 0.69 0.79 0.81 1.0 0.71 0.4 0.37 0.36 0.44 0.56 0.66
0.95 1.0 0.59 0.66 0.84 0.46 0.39 0.24 0.34 0.3 0.17 0.22
1.0 0.51 0.57 0.59 0.57 0.47 0.45 0.45 0.18 0.25 0.27 0.3
1.0 0.65 0.6 0.82 0.66 0.39 0.36 0.29 0.2 0.22 0.36 0.47
1.0 0.56 0.58 0.68 0.49 0.29 0.24 0.22 0.08 0.14 0.16 0.19
0.98 1.0 0.96 0.89 0.77 0.92 1.0 0.88 0.97 0.79 0.68 0.8
1.0 0.54 0.62 0.72 0.42 0.23 0.2 0.2 0.07 0.12 0.16 0.18
0.84 0.98 1.0 0.87 0.82 0.9 0.8 0.85 0.64 0.56 0.61 0.58
0.84 0.85 0.89 0.87 1.0 0.81 0.56 0.44 0.46 0.53 0.63 0.81
0.87 0.86 0.91 0.66 0.84 0.85 0.95 0.85 1.0 0.95 0.77 0.83
0.83 0.96 0.84 1.0 0.97 0.88 0.72 0.66 0.73 0.67 0.52 0.67
0.49 0.89 1.0 0.76 0.8 0.98 0.68 0.68 0.69 0.78 0.78 0.8
1.0 0.6 0.52 0.73 0.52 0.32 0.26 0.35 0.27 0.36 0.46 0.5
0.83 0.86 0.86 1.0 0.97 0.83 0.69 0.7 0.62 0.64 0.55 0.62
1.0 0.8 0.85 0.96 0.96 0.7 0.83 0.81 0.8 0.72 0.72 0.73
0.91 0.97 1.0 0.91 0.9 0.9 0.86 0.85 0.92 0.78 0.7 0.72
0.63 0.94 0.9 0.94 1.0 0.9 0.76 0.7 0.76 0.78 0.61 0.72
0.71 0.94 0.72 0.67 1.0 0.84 0.7 0.52 0.61 0.62 0.49 0.63
0.81 1.0 0.83 0.79 0.89 0.73 0.63 0.71 0.59 0.47 0.44 0.44
0.24 0.36 0.39 0.34 1.0 0.94 0.34 0.27 0.3 0.2 0.25 0.22
1.0 0.88 0.79 0.62 0.75 0.85 0.7 0.65 0.59 0.5 0.4 0.46
0.87 1.0 0.94 0.77 0.8 0.82 0.71 0.77 0.61 0.53 0.54 0.49
1.0 0.49 0.58 0.53 0.39 0.57 0.48 0.52 0.41 0.31 0.22 0.25
0.21 0.36 0.22 0.47 1.0 0.81 0.29 0.15 0.13 0.14 0.14 0.24
0.86 1.0 0.96 0.87 0.99 0.69 0.4 0.43 0.45 0.54 0.63 0.78
0.0 0.31 0.0 0.0 0.71 1.0 0.79 0.88 0.76 0.38 0.0 0.81
0.8 0.79 0.73 0.84 1.0 0.9 0.78 0.74 0.7 0.7 0.68 0.75
0.91 0.9 0.94 0.9 0.89 1.0 0.91 0.92 0.78 0.59 0.52 0.47
0.72 0.68 0.74 0.74 0.82 0.85 1.0 0.83 0.73 0.58 0.49 0.55
0.33 0.42 0.26 0.47 1.0 0.71 0.41 0.31 0.25 0.25 0.18 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 0.25 0.48 0.0 0.0 0.22 0.59
0.99 0.91 0.87 0.87 1.0 0.75 0.48 0.56 0.37 0.29 0.28 0.33
1.0 0.73 0.82 0.77 0.79 0.93 0.91 0.89 0.58 0.46 0.43 0.62
0.1 0.83 0.59 0.23 0.51 1.0 0.9 0.38 0.45 0.71 0.41 0.64
0.91 1.0 0.91 0.89 0.84 0.83 0.68 0.79 0.67 0.59 0.57 0.48
0.55 0.62 0.76 0.75 1.0 1.0 0.78 0.88 0.66 0.48 0.78 0.88
0.97 0.77 0.73 0.83 1.0 0.7 0.39 0.44 0.33 0.39 0.43 0.47
0.66 0.81 0.81 0.58 0.83 1.0 0.71 0.6 0.6 0.67 0.51 0.64
0.79 0.97 1.0 0.79 0.87 0.88 0.72 0.92 0.64 0.59 0.55 0.52
0.27 0.41 0.31 0.38 1.0 0.85 0.34 0.31 0.19 0.21 0.21 0.21
1.0 0.92 0.8 0.77 0.89 0.95 0.71 0.65 0.55 0.73 0.57 0.73
1.0 0.72 0.76 0.89 0.87 0.49 0.38 0.42 0.34 0.28 0.43 0.42
0.38 0.68 0.83 1.0 0.64 0.35 0.33 0.38 0.3 0.24 0.32 0.38
0.43 0.78 0.31 0.36 0.17 0.78 0.64 0.48 0.31 0.45 0.34 1.0
0.29 0.37 0.26 0.38 1.0 0.75 0.38 0.27 0.19 0.21 0.19 0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)