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Heatmap: Cluster_19 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.35 0.73 0.02 -0.21 -0.05 -0.77 -0.43 -0.46 -0.26 0.25 -0.0 0.19
0.99 1.21 0.54 -0.17 -0.7 -1.09 -1.05 -0.41 -0.54 -0.38 -0.61 -0.12
0.9 0.51 0.06 0.49 -0.15 -0.92 -0.53 -0.33 -0.13 -0.33 -0.63 -0.02
0.32 1.22 0.34 0.73 -0.13 -0.8 -0.9 -0.21 -0.74 -0.96 -0.48 -0.37
0.51 0.69 0.04 -0.04 -0.2 -0.58 -0.4 -0.52 -0.1 -0.16 -0.2 0.34
1.35 1.55 0.19 -0.83 -0.89 -2.53 -1.51 -0.42 -0.79 -0.73 -0.29 -0.0
0.63 0.63 0.42 0.2 -0.7 -0.49 -0.03 -0.16 -0.37 -0.41 -0.35 -0.12
0.43 0.78 -0.47 0.46 0.0 -0.65 -0.62 -0.57 -0.5 -0.25 -0.25 0.57
0.35 0.58 -0.1 -0.16 -0.03 -0.45 -0.43 0.01 -0.43 -0.06 0.1 0.23
0.83 1.51 0.28 0.1 -0.96 -2.41 -1.59 -1.04 -0.52 -0.16 -0.35 0.26
0.46 0.74 0.07 -0.15 -0.1 -0.02 -0.32 -0.37 0.03 0.03 -0.47 -0.41
0.9 0.78 -0.07 0.17 0.09 -0.8 -0.33 -0.49 -0.34 -0.31 -0.6 -0.1
0.27 0.67 -0.05 0.28 0.11 -0.49 -0.23 -0.23 -0.24 -0.05 -0.48 -0.0
0.46 0.32 -0.14 -0.2 -0.01 -0.23 -0.21 -0.27 -0.07 0.03 0.12 0.01
2.03 1.79 -0.28 -0.49 -3.73 - -2.04 -2.61 -1.25 -0.15 -1.64 -0.32
0.89 0.74 -0.23 -0.0 -0.54 -0.73 -0.49 -0.03 0.19 -0.24 -0.5 -0.07
0.66 1.33 0.08 -0.06 0.08 -1.0 -1.62 -0.89 -0.86 -0.29 -0.17 0.27
0.94 1.1 0.19 -0.11 -0.19 -0.47 -0.73 -0.22 -0.59 -0.62 -0.64 -0.24
0.62 0.93 -0.26 0.26 0.09 -0.8 -1.02 -1.04 -0.31 0.19 0.02 -0.09
0.99 1.39 -0.22 -0.27 -0.2 -0.58 -0.91 -0.88 -0.21 -0.36 -0.76 -0.22
0.49 0.61 -0.04 0.12 0.06 -0.68 -0.54 -0.33 -0.44 -0.04 -0.07 0.26
1.61 1.3 -1.07 -2.3 -1.4 - - -2.28 -1.29 0.25 1.12 0.55
0.73 0.79 -0.42 0.29 -0.44 -0.94 -0.37 -0.35 -0.04 0.02 -0.28 0.02
0.7 0.94 -0.36 0.32 0.12 -0.73 -0.64 -0.3 -0.41 -0.29 -0.53 0.03
0.66 0.71 0.06 0.4 -0.27 -1.16 -0.34 0.12 -0.31 -0.69 -0.53 0.19
0.22 0.69 0.72 0.14 -0.53 -0.43 -0.11 -0.23 -0.07 -0.5 -0.36 -0.28
0.62 0.28 0.02 0.31 -0.12 -0.05 -0.12 -0.29 -0.2 -0.28 -0.2 -0.33
0.09 0.93 0.04 0.48 0.06 -0.8 -0.7 -1.3 -0.9 -0.23 0.04 0.63
0.69 1.01 -1.04 0.08 -0.26 -1.48 -1.12 -1.15 -0.52 0.04 0.14 0.93
0.88 1.34 -0.72 -0.27 -1.31 -1.89 -0.7 -0.58 -0.22 0.34 -0.24 0.33
1.45 0.86 -0.63 -0.5 -1.04 -1.66 -2.47 -0.11 0.11 -0.16 -0.23 0.46
0.43 0.43 -0.09 0.05 -0.24 -0.42 -0.21 -0.43 0.05 0.22 -0.31 0.16
0.79 1.36 0.53 -0.22 -0.43 -1.5 -0.63 -0.59 -0.48 -0.61 -0.61 -0.05
0.76 1.04 0.2 0.03 -0.85 -1.79 -0.89 -0.4 -0.42 -0.27 -0.06 0.5
0.78 0.76 -0.03 0.22 -0.09 -0.74 -0.62 -0.2 -0.15 -0.13 -0.35 -0.34
-0.01 0.97 -0.5 0.6 -0.25 -1.22 -1.64 -0.63 -0.5 0.36 0.24 0.5
0.61 0.55 0.0 -0.05 -0.06 -0.31 -0.24 -0.11 -0.32 -0.15 -0.27 -0.03
0.98 1.5 -0.99 -0.08 -2.13 -3.63 -2.49 -1.01 -0.05 0.15 0.12 0.69
0.84 1.77 -0.03 0.75 0.02 -0.39 -2.19 -1.64 -2.2 -1.14 -2.16 -0.09
0.9 1.07 -0.61 -0.03 -0.28 -0.6 -0.58 -0.64 -0.69 -0.2 -0.44 0.46
0.66 1.36 0.43 0.43 -0.61 -1.33 -0.71 -0.58 -0.46 -0.86 -0.87 0.0
0.77 0.85 -0.08 0.25 -0.32 -0.28 -0.38 -0.53 -0.19 0.07 -0.87 -0.33
1.49 1.62 0.28 0.42 -0.85 -2.72 -2.52 -0.76 -1.51 -1.43 -1.19 -0.1
1.1 0.82 -0.55 0.37 -0.56 -0.98 -1.25 -0.75 -0.32 0.0 -0.47 0.48
0.77 0.83 -0.3 -0.01 0.23 -0.27 -0.61 -0.3 -0.72 -0.48 -0.28 0.13
0.84 0.81 -0.58 0.53 -0.19 -1.06 -0.39 -0.42 0.19 -0.25 -0.65 -0.23
0.34 0.41 0.26 -0.28 -0.05 -0.04 -0.14 -0.01 -0.09 -0.03 -0.15 -0.45
0.29 0.53 -0.07 0.38 -0.22 -1.03 -0.63 -0.42 -0.13 0.03 0.12 0.39
0.77 0.96 -0.84 0.14 -0.01 -1.42 -0.82 -0.93 -0.67 -0.1 -0.11 0.8
1.12 0.67 -0.98 -0.9 -1.76 -1.81 -0.61 -0.27 0.54 0.26 0.03 0.54
0.74 0.73 -0.29 0.16 -0.67 -1.31 -0.2 -0.48 0.17 -0.11 0.03 0.08
0.45 1.22 -0.13 0.25 -0.37 -1.01 -0.8 -0.52 -0.37 -0.21 -0.15 0.16
0.58 0.62 -0.44 0.13 -0.32 -0.66 -0.45 -0.51 -0.31 0.02 0.26 0.31
0.73 1.09 -0.07 0.23 -0.27 -0.19 -0.6 -0.68 -0.82 -0.43 0.08 -0.44
0.38 1.45 -0.19 0.46 0.21 -0.24 -0.85 -0.58 -0.46 -0.87 -0.84 -0.6
0.82 1.11 -0.56 0.03 -0.04 -0.93 -0.5 -0.65 -0.33 -0.11 -0.22 -0.07
0.36 0.81 -0.22 0.36 -0.21 -1.02 -0.52 -0.75 -0.31 0.18 -0.21 0.44
0.43 1.02 -0.08 0.05 -0.4 -1.21 -1.29 -0.36 -0.64 0.37 0.14 0.29
0.31 0.93 0.02 -0.17 -0.02 -0.5 -0.68 -0.36 -0.54 -0.18 -0.05 0.39
0.74 0.47 -0.29 0.49 -0.02 -0.63 -0.24 -0.53 -0.22 -0.32 -0.36 0.14
0.72 0.48 0.01 0.0 -0.1 -0.45 -0.56 -0.33 0.02 -0.02 -0.47 0.13
1.06 0.98 0.17 0.1 -0.57 -0.35 -0.02 -0.56 -0.7 -0.39 -0.72 -0.64
0.46 0.52 -0.02 0.12 0.05 -0.3 -0.19 -0.15 -0.3 -0.23 -0.31 0.03
0.37 0.45 0.06 0.04 -0.13 -0.56 -0.27 -0.18 -0.11 0.12 -0.13 0.06
1.23 1.31 -0.98 0.46 -0.96 -2.76 -0.9 -1.76 -0.72 0.39 -0.22 0.04
0.62 0.92 -0.18 0.65 -0.32 -1.78 -1.54 -0.81 -0.42 -0.22 0.21 0.43
0.44 0.5 -0.12 0.06 -0.05 -0.44 -0.38 -0.06 -0.15 -0.23 -0.21 0.29
0.6 0.99 -0.06 0.27 0.41 -0.29 -0.64 -0.72 -0.4 -0.38 -0.55 -0.43
1.29 1.01 0.03 0.65 -0.0 -1.49 -0.69 -0.25 -0.57 -1.62 -1.17 -0.54
0.78 0.82 -0.94 -0.08 -0.47 -1.22 -0.61 -0.72 0.38 0.39 -0.52 0.41
0.19 0.25 0.43 -0.28 0.21 0.07 0.17 -0.13 -0.11 -0.27 -0.25 -0.59
1.14 0.87 0.23 -0.17 -0.44 -0.71 -0.66 -0.66 -0.44 -0.32 -0.23 -0.14
0.43 0.47 -0.42 -0.04 0.08 -0.09 0.12 -0.22 -0.35 -0.17 -0.29 0.16
0.91 0.85 -0.6 0.01 -0.95 -1.14 -0.37 -0.06 0.04 -0.11 -0.35 0.26
1.22 0.99 -0.49 0.79 -0.27 -2.72 -1.34 -0.28 -0.43 -0.5 -0.55 -0.14
0.54 1.05 -0.12 -0.2 -0.94 -1.29 -1.36 -0.3 -0.06 0.23 0.28 0.26
1.56 1.55 -0.64 -0.09 -1.75 -3.81 -2.28 -0.73 -0.56 -0.36 -0.56 0.28
0.94 0.68 -0.7 -0.06 -0.14 -0.77 -0.44 -0.56 -0.24 0.09 -0.13 0.22
0.66 1.17 -0.62 0.45 -0.86 -1.21 -2.92 -1.49 -0.21 0.28 0.13 0.59
0.41 1.09 -0.51 0.43 0.03 -1.84 -0.87 -0.85 0.14 0.16 -0.51 0.22
1.07 0.98 0.25 -0.87 -0.78 -0.69 -0.65 0.24 -0.22 -0.78 -0.43 -0.04
0.47 0.79 0.1 -0.32 -0.26 -0.36 -0.09 -0.16 -0.54 -0.15 0.23 -0.32
1.0 0.65 -0.33 0.23 -0.43 -1.09 -0.59 -0.31 -0.1 -0.05 -0.24 0.05
1.03 0.83 -0.08 0.08 -0.37 -1.07 -0.65 -0.32 -0.06 -0.29 -0.59 0.08
1.42 1.36 -0.45 0.85 -2.56 -5.33 -2.97 -1.02 -0.68 -1.8 -0.23 0.72
0.86 0.87 -0.7 0.35 0.01 -0.78 -0.56 -0.53 -0.27 -0.23 -0.61 0.24
0.65 0.82 -0.38 0.15 0.01 -0.68 -0.39 -0.18 -0.3 -0.51 -0.32 0.25
1.72 2.25 0.58 -1.35 -1.19 -1.93 -2.5 -1.17 -1.81 -2.83 -2.99 -2.41
0.64 1.46 0.25 0.39 0.03 0.37 -0.21 -1.29 -1.19 -0.84 -1.94 -1.56
1.26 1.13 -0.58 -1.81 -1.85 -1.39 -0.24 -0.48 0.12 0.09 -0.52 0.47
1.4 1.59 0.06 -1.97 -2.37 -2.07 -1.32 -0.19 -0.23 0.05 -0.54 -0.36
1.62 1.97 0.46 0.48 - - - -0.09 -0.65 - -0.58 -
0.3 0.46 -0.71 0.47 -0.06 -0.62 -0.66 -0.37 -0.0 -0.07 -0.01 0.52
0.8 1.01 -0.08 0.47 -0.11 -0.72 -1.3 -1.03 -0.63 -0.21 -0.28 0.2
2.28 2.84 - - - - - - - - - -
0.7 0.71 -0.62 0.55 -0.47 -2.34 -1.69 -0.8 -0.12 0.05 0.1 0.83
0.42 0.33 0.13 -0.0 -0.02 0.23 -0.03 0.04 -0.42 -0.06 -0.59 -0.37
1.22 1.38 0.26 0.99 0.15 -1.02 -1.23 -1.0 -1.26 -1.85 -2.07 -1.21
0.47 0.32 -0.25 -0.27 -0.17 -0.25 -0.35 -0.17 0.24 0.16 -0.1 0.09
0.82 1.14 -0.84 0.28 -0.21 -1.44 -1.04 -0.67 -0.21 -0.08 -0.21 0.31
0.85 1.11 -0.7 -0.11 0.0 -1.32 -1.07 -0.37 -0.52 -0.15 0.06 0.25
0.63 1.35 -0.83 -0.35 0.05 -1.51 -0.95 -0.21 -1.01 -0.28 0.26 0.33
0.93 1.1 0.01 0.77 0.12 -0.97 -1.35 -1.06 -0.77 -0.86 -0.6 -0.05
1.61 1.59 -0.22 -0.98 -2.12 -3.93 -3.98 -1.13 -0.7 -0.86 -0.27 0.81
1.07 1.1 -0.28 -0.49 -1.37 -0.7 -0.39 -0.4 -0.04 -0.21 -0.23 0.01
0.35 0.42 -0.05 0.04 -0.19 -0.31 -0.11 0.17 -0.18 -0.15 -0.03 -0.16
0.81 0.62 -0.23 -0.05 -0.14 -0.34 -0.53 -0.01 -0.01 0.02 -0.32 -0.52
1.36 1.69 0.8 -0.19 -2.31 - -4.17 -2.19 -1.47 -1.01 -0.41 0.6
0.65 0.79 -0.46 0.1 -0.15 -0.76 -0.3 -0.3 -0.44 -0.05 -0.08 0.18
0.74 1.12 0.7 0.12 -0.09 -0.87 -0.34 -0.7 -1.24 -1.13 -0.55 -0.02
0.66 1.28 -0.04 -0.5 0.0 -0.85 -0.39 -0.09 -0.66 -0.58 -0.48 0.06
0.8 1.48 -0.83 -1.19 -0.42 -0.58 -0.54 -0.15 -1.22 -0.68 0.17 0.37
1.02 0.83 -0.21 0.41 0.08 -0.83 -0.66 -0.31 -0.23 -0.46 -0.86 -0.31
1.09 1.11 -0.33 0.42 0.18 -0.77 -0.5 -0.38 -0.61 -0.99 -1.0 -0.51
0.57 0.54 -0.08 -0.14 -0.22 -0.51 -0.7 -0.46 -0.03 0.37 -0.05 0.08
1.13 2.31 -0.53 -0.26 -0.08 -1.92 - - -2.13 -2.21 -0.34 -0.17
1.45 0.61 -0.45 -3.46 -0.42 -1.25 -0.45 -0.76 0.11 0.29 -0.12 0.28
0.29 0.63 0.08 0.58 -0.27 -1.23 -0.7 -0.35 -0.39 0.02 0.04 0.3
0.43 0.95 -0.6 0.1 -0.88 -1.36 -0.53 -0.56 0.26 0.33 -0.01 0.3
0.54 0.87 -0.45 -0.02 -0.67 -1.68 0.01 -0.05 0.06 -0.15 0.07 0.1
1.79 1.91 -0.19 -0.39 -1.71 -3.14 -2.11 -0.79 -0.63 -1.63 -1.39 -0.79
0.81 0.96 -0.32 0.66 -0.22 -1.1 -0.61 -0.49 0.04 -0.43 -0.79 -0.19
0.75 0.84 -0.05 0.02 0.04 -1.25 -0.88 -0.55 -0.22 -0.13 -0.29 0.35
1.2 0.97 -0.57 -0.17 -1.65 -2.43 -0.56 -0.27 -0.09 0.2 -0.05 0.15
0.98 0.95 -0.02 0.16 -0.01 -0.92 -0.7 -0.73 -0.35 -0.17 -0.58 -0.13
1.01 0.72 -0.47 -0.03 -0.54 -1.78 -0.75 -0.42 -0.26 0.05 0.12 0.45
0.73 0.75 -0.1 0.76 -0.44 -2.12 -0.6 -0.13 -0.2 -0.17 -0.5 0.04
0.81 0.85 0.1 0.81 -0.39 -2.37 -1.26 -0.47 -0.27 -0.55 -0.16 0.15
0.77 0.88 0.36 -0.1 -1.0 -0.77 -0.56 -0.35 -0.29 -0.17 -0.13 0.09
0.46 0.48 -0.12 0.01 -0.05 -0.32 -0.16 0.12 -0.07 -0.16 -0.26 -0.18
2.96 2.08 - - - - - - - - - -
1.19 1.23 0.12 1.03 0.13 -1.4 -1.45 -1.16 -1.13 -1.51 -1.36 -0.38
0.43 0.43 0.15 0.09 -0.04 -0.51 -0.29 -0.3 -0.16 -0.07 -0.15 0.1
1.41 1.49 -1.1 -0.4 -1.58 -3.48 -1.3 -1.32 -0.96 -0.13 0.19 0.57
0.63 0.71 -0.54 0.17 0.22 -0.79 -0.63 -0.33 -0.27 -0.26 -0.05 0.25
1.15 1.43 -0.17 0.21 -0.34 -1.55 -1.32 -0.49 -0.23 -0.48 -0.84 -0.62
1.02 0.91 -0.7 0.35 -0.45 -1.14 -1.1 -0.49 -0.34 0.02 -0.21 0.25
0.77 0.79 -0.12 0.19 -0.28 -1.0 -0.48 -0.84 -0.05 -0.25 -0.13 0.26
1.13 0.84 0.22 0.75 -0.13 -1.07 -0.54 -0.59 -0.56 -0.95 -1.1 -0.37
0.59 1.06 -0.12 0.17 -0.65 -1.36 -0.61 -0.02 0.14 -0.54 -0.43 0.21
0.8 0.98 -0.12 0.58 -0.13 -1.43 -0.78 -0.74 -0.31 -0.24 -0.58 0.12
0.82 0.59 -0.05 0.12 -0.04 -0.72 -0.27 -0.18 -0.32 0.07 -0.4 -0.38
0.66 0.57 0.08 0.07 -0.01 -0.32 -0.34 -0.08 -0.28 -0.28 -0.41 -0.15
1.47 1.16 -0.15 1.05 -1.01 -3.04 -1.46 -0.77 -1.05 -2.86 -0.77 0.31
1.0 1.52 -0.37 -0.84 -1.48 -2.47 -1.23 -1.37 -0.48 0.04 0.07 0.72
0.64 0.47 -0.01 0.29 0.11 -0.44 -0.28 -0.33 -0.12 -0.2 -0.47 -0.15
0.13 1.88 -1.21 0.56 0.26 -1.36 -2.18 -1.27 -0.57 -0.19 -1.72 0.33
1.33 0.83 -0.12 0.66 -0.14 -1.61 -1.3 -1.3 -0.35 -0.21 -0.69 -0.17
0.67 1.08 -0.6 0.01 -0.19 -1.36 -0.71 -0.44 -0.38 -0.01 -0.09 0.39
0.67 0.92 0.08 0.27 0.05 -0.91 -0.17 -0.46 -0.78 -0.66 -0.45 0.15
2.26 2.6 - - - - - - - - - 0.19
1.01 1.04 -0.39 -0.43 -1.97 -2.13 -0.97 -0.04 -0.05 0.28 -0.0 0.36
2.25 2.12 - -4.33 - 1.51 - - - - - -
1.23 0.84 -0.73 -0.43 0.06 -0.61 -0.33 0.14 -0.55 -0.77 -0.24 -0.33
1.22 1.08 -1.02 -0.67 0.12 -0.72 -0.18 0.35 -0.92 -0.97 -0.29 -0.47

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.