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Heatmap: Cluster_34 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.17 -0.02 0.12 0.3 0.54 0.46 0.25 -0.02 -0.17 -0.14 -0.68 -0.28
0.09 0.32 0.27 0.23 0.28 -0.36 -0.23 -0.04 -0.01 -0.03 -0.44 -0.33
-0.7 0.29 0.79 0.63 0.56 0.34 -0.1 -0.01 -0.79 -0.65 -0.86 -1.11
-0.27 0.21 0.34 0.82 0.66 -0.13 -0.4 -0.07 -0.03 -0.42 -0.93 -0.93
-4.5 0.65 0.94 1.46 1.15 0.8 -0.19 -1.1 -2.07 -3.52 -4.63 -4.35
0.0 0.29 0.3 0.56 0.47 -0.1 -0.25 -0.07 0.02 -0.38 -0.85 -0.71
0.24 0.22 0.23 0.33 0.34 -0.13 -0.15 -0.03 0.01 -0.35 -0.6 -0.51
0.3 0.32 0.23 0.36 0.25 -0.29 -0.26 0.04 0.03 -0.33 -0.61 -0.47
-0.61 0.15 0.36 0.61 0.55 0.21 0.09 0.17 -0.16 -0.61 -0.8 -1.01
0.03 0.19 0.24 0.26 0.15 -0.23 -0.32 0.02 0.09 -0.05 -0.26 -0.29
-0.63 0.18 0.08 0.27 0.51 0.27 0.03 0.03 -0.09 -0.14 -0.44 -0.47
-0.13 -0.07 0.21 0.13 0.23 0.26 0.06 0.06 -0.1 -0.26 -0.22 -0.31
0.17 0.32 0.28 0.44 0.37 -0.27 -0.2 -0.09 -0.01 -0.38 -0.67 -0.44
-0.15 0.36 0.32 0.57 0.43 0.27 0.1 -0.36 -0.34 -0.59 -0.81 -0.61
-0.73 -0.15 0.13 0.46 0.55 0.33 0.27 0.05 0.08 -0.28 -0.74 -0.74
0.29 0.1 -0.08 0.2 -0.03 0.03 -0.07 -0.17 -0.32 -0.18 0.02 0.1
-0.65 0.16 0.48 1.16 0.82 0.15 0.1 -0.07 -0.39 -1.49 -1.68 -1.78
-0.44 0.0 0.29 0.38 0.41 0.41 0.01 -0.09 -0.35 -0.46 -0.35 -0.25
-1.12 0.5 0.96 0.66 0.52 0.33 -0.36 -0.33 -0.76 -0.61 -1.01 -0.76
0.1 0.42 0.57 0.59 0.5 0.09 -0.03 0.12 -0.1 -1.02 -1.63 -1.69
0.47 0.21 0.33 0.48 0.37 0.0 -0.46 -0.08 -0.52 -0.65 -0.19 -0.67
-1.89 -0.26 0.27 0.61 0.82 0.81 0.26 -0.3 -0.62 -0.63 -0.64 -0.54
-0.36 0.13 0.48 0.6 0.32 0.48 0.21 0.34 -0.26 -0.79 -1.63 -1.29
-0.11 0.21 0.02 0.82 0.43 -0.22 -0.16 0.01 -0.03 -0.36 -0.62 -0.68
-0.75 0.05 0.39 0.46 0.39 0.54 0.27 0.22 -0.15 -0.64 -0.95 -1.03
-0.28 0.34 0.34 0.85 0.63 -0.24 -0.28 -0.05 -0.23 -0.42 -1.01 -0.82
-0.13 0.35 0.11 0.8 0.59 -0.36 -0.23 -0.18 -0.06 -0.3 -0.89 -0.61
1.04 0.39 0.08 0.59 0.51 -1.19 -0.71 -0.02 -1.33 -0.76 -0.42 -0.18
0.13 0.72 0.28 0.59 -0.01 -0.47 -0.07 -0.03 -0.3 -0.36 -0.64 -0.59
-0.09 0.19 0.3 0.29 0.44 0.17 0.28 -0.01 -0.44 -0.54 -0.58 -0.53
-0.15 0.53 0.24 1.29 0.53 -0.18 -0.2 -0.67 -0.38 -0.98 -1.32 -0.91
0.2 0.34 0.43 0.45 0.34 -0.24 -0.39 -0.11 -0.0 -0.35 -0.7 -0.58
-1.1 0.84 1.03 0.75 0.42 -0.09 -0.72 -1.09 -1.15 -1.0 -0.36 -0.09
-0.08 0.45 0.11 0.67 0.22 -0.22 -0.01 -0.23 -0.19 -0.35 -0.62 -0.22
-1.93 0.27 0.69 0.75 0.76 0.41 -0.16 -0.37 -0.67 -0.82 -0.47 -0.7
-0.21 0.06 0.15 0.07 0.27 0.16 -0.07 -0.01 -0.35 -0.03 -0.03 -0.11
-0.42 0.18 0.4 0.42 0.48 0.38 -0.04 -0.21 -0.28 -0.57 -0.52 -0.45
0.1 0.1 0.06 0.2 0.23 -0.09 -0.1 -0.07 0.02 -0.14 -0.2 -0.2
-2.76 0.49 0.86 0.8 1.17 1.04 -2.43 -0.1 -0.67 -1.61 -2.4 -1.65
0.03 0.15 0.29 0.33 0.26 0.45 0.29 0.18 -0.29 -0.75 -0.87 -1.01
-4.09 0.41 0.91 1.25 1.14 0.46 -0.24 -0.54 -0.62 -1.66 -2.73 -3.12
-0.19 0.04 0.23 0.49 0.34 -0.18 -0.18 0.09 0.22 -0.07 -0.54 -0.68
0.07 0.12 0.14 0.36 0.35 0.35 0.19 0.14 -0.12 -0.61 -0.85 -0.88
-0.46 -0.1 0.11 -0.05 0.34 0.25 0.07 0.12 0.08 -0.01 -0.28 -0.29
0.01 0.43 0.47 0.52 0.28 -0.12 -0.16 -0.08 -0.07 -0.41 -0.9 -0.72
-0.37 0.13 0.19 0.63 0.71 0.28 0.17 0.06 -0.39 -0.81 -0.86 -0.89
-0.27 0.05 0.28 0.37 0.52 0.29 0.04 0.16 -0.14 -0.45 -0.77 -0.74
-0.25 0.23 0.1 0.68 0.67 0.03 0.1 0.05 -0.21 -0.66 -0.85 -0.89
0.24 0.32 0.3 0.35 0.3 -0.11 -0.25 -0.02 -0.01 -0.34 -0.65 -0.56
-0.83 -0.13 0.02 0.33 0.36 0.38 0.3 0.28 -0.04 -0.32 -0.39 -0.51
-0.0 0.12 0.2 0.13 0.22 0.11 0.13 0.12 -0.1 -0.23 -0.37 -0.53
-3.69 0.22 0.36 0.89 0.98 0.55 0.54 -0.29 -0.39 -0.65 -2.3 -1.71
-0.61 0.39 0.27 0.82 0.46 -0.14 0.06 -0.05 -0.21 -0.67 -0.95 -0.39
-0.28 0.38 0.11 0.4 0.37 0.18 -0.02 -0.2 -0.34 -0.39 -0.44 -0.15
0.25 0.33 0.12 0.29 0.19 -0.24 -0.02 -0.12 0.06 -0.27 -0.53 -0.37
0.29 0.32 0.25 0.38 0.15 -0.13 -0.18 -0.16 0.0 -0.33 -0.59 -0.37
-0.99 -0.05 0.3 0.34 0.51 0.79 0.48 0.08 -0.23 -0.63 -0.98 -1.22
0.28 0.34 0.1 0.06 0.26 0.16 0.43 0.11 -0.4 -0.49 -0.72 -0.78
-0.39 0.12 0.31 0.64 0.43 0.05 -0.01 -0.28 -0.11 -0.33 -0.56 -0.41
-0.15 0.21 0.23 0.4 0.33 0.1 -0.01 -0.0 0.05 -0.23 -0.68 -0.69
0.46 0.09 0.21 0.68 0.44 -0.45 -0.07 -0.44 -0.06 -0.75 -0.65 -0.27
-0.83 0.09 0.51 0.44 0.59 0.73 0.3 0.08 -0.46 -0.83 -1.04 -1.39
0.14 0.15 0.29 0.38 0.27 0.05 -0.08 -0.03 0.02 -0.36 -0.62 -0.6
-0.62 0.22 0.41 0.42 0.45 0.14 -0.14 -0.1 -0.17 -0.2 -0.44 -0.51
-0.04 0.14 0.17 0.39 0.22 -0.09 0.06 0.02 -0.14 -0.27 -0.31 -0.35
0.11 0.17 0.13 0.14 0.19 -0.02 -0.12 -0.04 0.06 -0.15 -0.34 -0.26
0.02 0.34 0.18 0.26 0.25 -0.39 -0.39 0.02 0.07 0.03 -0.29 -0.36
-1.89 0.23 0.56 0.63 0.88 0.46 0.22 -0.2 -0.25 -0.87 -1.31 -0.99
-1.18 0.12 0.06 0.46 0.58 0.28 0.17 0.14 0.02 -0.24 -0.58 -0.78
-1.21 0.09 0.31 0.89 0.76 0.04 -0.32 -0.17 -0.12 -0.47 -0.52 -0.61
-0.81 -0.14 0.09 0.38 0.53 0.5 0.29 0.19 -0.33 -0.55 -0.46 -0.46
-0.75 0.02 0.05 0.9 0.79 0.04 0.18 0.15 -0.49 -0.61 -0.81 -0.85
-0.3 0.04 0.12 0.4 0.36 0.2 0.15 0.01 -0.13 -0.27 -0.54 -0.36
-0.16 0.47 0.43 0.74 0.43 0.13 0.07 -0.11 -0.43 -0.73 -1.23 -0.94
-0.78 0.27 0.44 0.6 0.36 0.2 -0.1 -0.02 0.04 -0.28 -0.64 -1.03
0.12 -0.05 -0.13 0.19 0.32 -0.03 -0.35 0.0 -0.61 -0.3 0.37 0.15
0.06 0.19 0.28 0.46 0.15 -0.16 -0.17 -0.22 -0.25 -0.2 -0.18 -0.18
-2.41 -0.05 0.99 1.22 1.12 0.74 -0.17 -0.86 -1.13 -1.86 -2.05 -1.92
0.43 -0.5 0.0 0.84 0.68 -0.47 -0.52 -0.04 -0.41 -0.63 -0.39 0.01
-0.16 0.19 -0.36 0.78 0.52 0.43 0.2 -0.78 -0.26 -0.28 -0.87 -0.42
-0.23 0.07 0.25 0.5 0.41 0.13 -0.03 -0.34 -0.07 -0.27 -0.31 -0.47
0.33 0.35 0.28 0.36 0.41 0.3 0.3 0.24 -0.26 -0.95 -1.55 -1.72
-0.42 0.08 0.4 0.36 0.29 0.43 0.22 0.15 -0.1 -0.58 -0.62 -0.97
0.2 0.32 0.2 0.39 0.27 0.06 -0.09 -0.12 -0.26 -0.28 -0.52 -0.54
-1.52 -0.24 0.45 0.88 1.04 1.09 0.37 -0.03 -0.66 -1.9 -2.98 -3.18
0.29 0.61 0.63 0.49 0.39 -0.19 -0.03 -0.03 -0.34 -0.94 -1.38 -1.17
-0.07 0.36 0.5 0.54 0.6 0.25 -0.02 -0.15 -0.46 -0.72 -0.97 -1.16
0.42 0.47 0.38 0.72 0.6 0.01 0.07 0.3 -0.32 -1.68 -2.27 -2.27
0.46 -0.02 0.02 0.77 0.62 -0.19 -0.29 -0.41 -0.27 -0.61 -0.49 -0.44
0.31 0.39 0.27 0.55 0.73 -0.01 -0.23 -0.07 -0.45 -0.77 -1.11 -0.92
-0.06 0.02 0.01 0.36 0.28 -0.18 -0.03 0.04 -0.02 0.0 -0.2 -0.36
-1.54 -0.19 0.23 0.43 0.44 0.63 0.22 0.09 -0.32 -0.39 -0.29 -0.43
-0.39 0.14 0.17 0.32 0.41 0.14 -0.28 -0.12 -0.34 -0.11 -0.16 -0.06
-0.59 0.17 0.16 0.33 0.37 0.13 -0.04 0.03 0.05 -0.15 -0.37 -0.42
0.21 -0.19 0.13 0.49 0.14 -0.33 -0.2 -0.18 0.04 0.08 -0.02 -0.41
-0.54 -0.2 0.15 0.66 0.6 0.39 0.11 0.08 -0.25 -0.53 -0.63 -0.75
-1.42 -0.59 -0.28 0.84 1.24 0.75 -0.28 -0.66 -0.96 -0.12 -0.49 -0.53
-0.23 0.42 0.18 0.65 0.67 -0.08 -0.47 -0.02 -0.34 -0.34 -0.66 -0.62
0.21 0.1 0.24 0.69 0.22 0.29 0.05 -0.09 -1.06 -0.62 -0.94 -0.05
0.18 0.26 0.23 0.43 0.52 -0.12 -0.16 -0.32 -0.08 -0.38 -0.6 -0.46
0.12 0.47 0.23 0.96 0.82 -0.13 -0.35 -0.23 -0.29 -0.85 -1.79 -1.21
-0.09 0.01 0.18 0.36 0.39 0.25 -0.07 0.11 -0.27 -0.42 -0.36 -0.42
-0.28 0.23 -0.02 0.31 0.37 0.11 -0.05 -0.04 -0.43 -0.27 -0.06 -0.1
-0.23 0.37 0.57 0.51 0.27 -0.26 -0.36 -0.43 -0.22 -0.29 -0.37 -0.09
-0.05 0.14 0.28 0.98 0.86 0.13 0.06 -0.09 -0.38 -1.11 -1.85 -1.51
0.23 0.19 0.19 0.4 0.34 -0.05 -0.21 -0.08 -0.03 -0.33 -0.65 -0.38
-0.15 -0.04 0.07 0.32 0.27 0.04 -0.15 -0.08 -0.13 -0.16 -0.14 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.