Heatmap: Cluster_90 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.96 1.0 0.57 0.53 0.44 0.23 0.27 0.26 0.38 0.43 0.51 0.98
1.0 0.91 0.69 0.55 0.42 0.32 0.26 0.56 0.48 0.48 0.6 0.7
1.0 1.0 0.52 0.26 0.09 0.03 0.05 0.17 0.14 0.28 0.36 0.46
0.83 1.0 0.44 0.22 0.07 0.02 0.03 0.11 0.11 0.23 0.37 0.43
0.9 1.0 0.43 0.18 0.08 0.03 0.05 0.1 0.15 0.17 0.3 0.44
0.93 1.0 0.4 0.31 0.23 0.08 0.09 0.1 0.17 0.27 0.33 0.5
1.0 0.74 0.52 0.53 0.31 0.34 0.41 0.48 0.51 0.56 0.55 0.61
1.0 0.88 0.78 0.44 0.26 0.14 0.16 0.28 0.32 0.38 0.46 0.58
1.0 0.75 0.54 0.43 0.21 0.07 0.17 0.42 0.55 0.54 0.56 0.73
1.0 0.84 0.39 0.17 0.01 0.01 0.04 0.07 0.08 0.18 0.31 0.34
1.0 0.96 0.73 0.58 0.43 0.35 0.43 0.49 0.63 0.69 0.68 0.85
1.0 0.81 0.64 0.46 0.31 0.26 0.29 0.41 0.38 0.39 0.47 0.58
1.0 0.8 0.41 0.33 0.3 0.14 0.12 0.12 0.11 0.13 0.2 0.4
1.0 0.78 0.62 0.33 0.17 0.09 0.14 0.31 0.29 0.4 0.52 0.57
1.0 0.76 0.55 0.3 0.15 0.1 0.16 0.3 0.28 0.27 0.31 0.41
1.0 0.8 0.32 0.37 0.26 0.12 0.11 0.17 0.15 0.22 0.38 0.45
1.0 0.63 0.39 0.1 0.03 0.01 0.06 0.15 0.2 0.35 0.4 0.49
1.0 0.84 0.57 0.37 0.2 0.16 0.28 0.42 0.49 0.52 0.46 0.53
0.65 1.0 0.76 0.46 0.37 0.18 0.26 0.44 0.41 0.51 0.59 0.55
1.0 0.92 0.49 0.34 0.26 0.2 0.27 0.39 0.38 0.43 0.45 0.5
1.0 0.96 0.35 0.36 0.19 0.18 0.23 0.37 0.33 0.48 0.46 0.55
0.98 1.0 0.77 0.52 0.32 0.23 0.39 0.64 0.57 0.57 0.59 0.67
1.0 0.79 0.65 0.36 0.29 0.26 0.33 0.37 0.39 0.43 0.45 0.53
1.0 1.0 0.71 0.43 0.39 0.26 0.26 0.4 0.38 0.46 0.5 0.58
1.0 0.92 0.47 0.35 0.29 0.23 0.3 0.34 0.34 0.41 0.4 0.44
0.98 1.0 0.32 0.42 0.24 0.09 0.1 0.11 0.09 0.11 0.19 0.33
0.98 1.0 0.58 0.48 0.38 0.31 0.33 0.58 0.47 0.55 0.52 0.62
1.0 0.72 0.51 0.41 0.21 0.11 0.2 0.36 0.28 0.29 0.42 0.56
1.0 0.91 0.51 0.4 0.38 0.37 0.34 0.37 0.45 0.52 0.49 0.64
1.0 0.82 0.58 0.35 0.2 0.13 0.2 0.33 0.37 0.44 0.48 0.55
0.74 1.0 0.38 0.31 0.31 0.19 0.17 0.23 0.19 0.28 0.33 0.39
1.0 0.97 0.65 0.56 0.46 0.43 0.65 0.54 0.59 0.55 0.61 0.65
0.95 1.0 0.82 0.54 0.42 0.27 0.34 0.49 0.5 0.51 0.52 0.55
0.99 1.0 0.68 0.69 0.44 0.24 0.46 0.55 0.49 0.47 0.53 0.7
1.0 0.67 0.59 0.31 0.28 0.32 0.44 0.46 0.41 0.38 0.38 0.47
1.0 0.88 0.73 0.56 0.5 0.43 0.44 0.59 0.56 0.62 0.67 0.68
1.0 0.91 0.7 0.5 0.33 0.22 0.33 0.36 0.41 0.54 0.51 0.68
1.0 0.95 0.5 0.39 0.25 0.15 0.21 0.25 0.25 0.36 0.43 0.53
1.0 0.76 0.51 0.44 0.34 0.19 0.22 0.39 0.27 0.36 0.51 0.7
1.0 0.8 0.61 0.38 0.21 0.1 0.18 0.27 0.31 0.33 0.45 0.65
1.0 0.88 0.56 0.46 0.38 0.28 0.38 0.4 0.39 0.42 0.44 0.55
1.0 0.76 0.51 0.4 0.27 0.19 0.24 0.42 0.34 0.35 0.43 0.48
0.66 1.0 0.51 0.45 0.16 0.04 0.06 0.16 0.18 0.28 0.39 0.49
1.0 0.93 0.67 0.37 0.2 0.09 0.26 0.45 0.3 0.34 0.5 0.49
0.88 1.0 0.5 0.51 0.35 0.16 0.17 0.24 0.19 0.33 0.46 0.74
1.0 0.8 0.61 0.4 0.33 0.24 0.28 0.4 0.32 0.32 0.41 0.43
1.0 0.71 0.62 0.44 0.2 0.3 0.29 0.39 0.39 0.47 0.47 0.56
1.0 1.0 0.61 0.62 0.31 0.11 0.17 0.27 0.38 0.42 0.36 0.52
1.0 0.71 0.59 0.43 0.12 0.05 0.14 0.35 0.31 0.31 0.4 0.48
1.0 0.88 0.64 0.51 0.33 0.22 0.35 0.48 0.52 0.59 0.6 0.63
1.0 0.76 0.39 0.16 0.06 0.04 0.08 0.17 0.2 0.3 0.33 0.44
0.9 1.0 0.39 0.32 0.22 0.04 0.03 0.13 0.04 0.19 0.11 0.16
1.0 0.93 0.68 0.46 0.39 0.31 0.32 0.37 0.34 0.42 0.45 0.56
1.0 0.87 0.68 0.48 0.35 0.16 0.25 0.36 0.33 0.48 0.52 0.66
1.0 0.63 0.51 0.26 0.13 0.09 0.2 0.32 0.33 0.32 0.39 0.48
1.0 0.75 0.49 0.3 0.17 0.09 0.17 0.4 0.36 0.43 0.46 0.61
1.0 0.96 0.69 0.42 0.33 0.16 0.25 0.39 0.43 0.49 0.5 0.69
1.0 0.8 0.5 0.42 0.44 0.34 0.39 0.47 0.5 0.55 0.46 0.53
1.0 0.85 0.47 0.51 0.43 0.28 0.3 0.31 0.35 0.42 0.36 0.62
0.94 1.0 0.74 0.47 0.29 0.17 0.18 0.27 0.33 0.49 0.55 0.72
1.0 0.98 0.42 0.33 0.25 0.11 0.19 0.24 0.23 0.23 0.22 0.32
1.0 0.71 0.61 0.37 0.32 0.31 0.38 0.47 0.42 0.48 0.53 0.64
1.0 0.93 0.49 0.54 0.4 0.17 0.22 0.29 0.24 0.4 0.39 0.53
1.0 0.83 0.7 0.35 0.21 0.19 0.25 0.38 0.36 0.4 0.46 0.52
1.0 0.78 0.44 0.39 0.22 0.14 0.26 0.32 0.31 0.48 0.53 0.72
1.0 0.85 0.5 0.39 0.32 0.14 0.26 0.34 0.39 0.44 0.67 0.88
1.0 0.92 0.59 0.43 0.38 0.31 0.36 0.39 0.39 0.47 0.41 0.47
1.0 0.87 0.5 0.29 0.16 0.05 0.14 0.28 0.23 0.41 0.53 0.71
1.0 0.66 0.46 0.35 0.35 0.35 0.41 0.43 0.35 0.37 0.37 0.45
1.0 0.85 0.58 0.37 0.28 0.24 0.33 0.47 0.31 0.31 0.37 0.42
1.0 0.81 0.61 0.43 0.25 0.14 0.24 0.42 0.41 0.43 0.48 0.6
0.96 1.0 0.64 0.32 0.19 0.21 0.16 0.16 0.12 0.1 0.14 0.25
1.0 0.65 0.43 0.25 0.08 0.0 0.01 0.08 0.08 0.11 0.22 0.31
1.0 0.92 0.7 0.42 0.28 0.13 0.23 0.3 0.34 0.45 0.49 0.58
1.0 0.62 0.43 0.24 0.15 0.11 0.21 0.3 0.29 0.25 0.31 0.46
1.0 0.79 0.59 0.43 0.31 0.27 0.4 0.5 0.59 0.59 0.59 0.62
0.59 1.0 0.26 0.24 0.07 0.0 0.03 0.07 0.07 0.1 0.07 0.19
1.0 0.93 0.41 0.27 0.23 0.13 0.09 0.14 0.14 0.1 0.16 0.39
1.0 0.92 0.49 0.48 0.33 0.2 0.24 0.35 0.41 0.51 0.43 0.62
1.0 0.82 0.59 0.44 0.36 0.25 0.28 0.38 0.43 0.53 0.58 0.71
1.0 0.85 0.69 0.48 0.42 0.27 0.21 0.34 0.33 0.43 0.55 0.66
1.0 0.63 0.47 0.37 0.2 0.12 0.18 0.37 0.44 0.47 0.59 0.8
1.0 0.95 0.78 0.64 0.51 0.36 0.38 0.57 0.59 0.62 0.69 0.81
1.0 0.97 0.82 0.54 0.39 0.31 0.4 0.49 0.45 0.4 0.46 0.56
1.0 0.67 0.45 0.24 0.13 0.06 0.16 0.35 0.29 0.33 0.54 0.63
0.98 1.0 0.57 0.2 0.07 0.01 0.0 0.01 0.02 0.05 0.08 0.32
0.77 1.0 0.5 0.19 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.05 0.18
1.0 0.96 0.53 0.32 0.13 0.04 0.05 0.14 0.23 0.43 0.59 0.8

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)