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Heatmap: Cluster_32 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.57 0.01 -0.32 -1.72 -1.0 -0.69 -0.55 0.22 0.43 0.79 0.39 0.07
-0.25 -1.24 -1.31 -3.14 -3.39 -1.18 0.06 0.61 0.76 1.0 0.95 0.57
0.5 -0.2 -2.48 -2.28 -1.31 -0.31 -0.06 0.27 0.39 0.77 0.62 0.48
0.54 -0.65 -2.11 -2.16 -1.52 -0.14 0.16 0.24 0.58 0.71 0.65 0.26
0.45 -0.2 -0.64 -1.99 -1.67 -0.5 0.08 0.39 0.43 0.47 0.55 0.37
0.2 0.02 -0.22 -0.2 0.09 0.05 -0.37 -0.08 -0.08 0.05 0.08 0.33
0.32 -0.18 -0.46 -0.41 -0.2 -0.15 -0.13 0.21 0.13 0.16 0.23 0.21
-0.26 -1.06 -1.57 -2.76 -1.31 -0.2 0.19 0.15 0.48 0.79 0.73 0.92
-0.16 -0.38 -0.57 -0.55 -0.23 -0.36 -0.24 0.29 0.23 0.45 0.56 0.34
-0.88 -0.24 -0.73 -0.32 0.21 -0.31 -0.03 -0.09 -0.47 0.33 0.66 0.82
0.83 0.25 -0.91 -1.51 -0.76 -0.42 -0.45 -0.14 -0.11 0.36 0.43 0.69
0.09 -0.84 -1.41 -1.78 -0.92 -0.31 0.18 0.49 0.38 0.46 0.6 0.72
0.52 0.26 -0.34 -0.75 -1.09 -0.8 -0.5 -0.03 0.11 0.34 0.55 0.53
0.02 -0.11 -0.52 -0.85 -0.35 -0.25 -0.01 0.12 0.44 0.43 0.17 0.37
0.52 -0.04 -0.4 -1.05 -0.5 -0.35 -0.22 0.14 0.07 0.28 0.38 0.41
-0.32 -0.14 -0.26 -1.29 -0.42 -0.22 0.13 0.41 0.39 0.51 0.41 -0.07
-0.13 -0.54 -1.11 -1.72 -0.8 -0.34 0.03 0.67 0.19 0.37 0.86 0.48
-2.54 -0.97 -1.35 -2.43 -1.29 -0.28 0.6 0.6 1.05 1.07 0.45 -0.09
-0.86 -1.3 -2.41 -3.41 -1.93 -0.21 0.15 0.71 0.95 1.32 0.19 0.41
-2.05 -0.68 - - -3.51 -1.36 -0.42 0.43 0.02 0.91 1.64 1.35
0.69 -0.57 -1.52 -2.68 -2.78 -2.39 -0.87 0.51 0.34 0.98 1.03 0.71
0.69 -0.02 -1.15 -2.21 -1.74 -0.57 -0.27 -0.12 0.21 0.5 0.7 0.85
0.36 0.04 -0.7 -1.21 -0.65 -0.35 -0.27 -0.02 0.2 0.57 0.5 0.44
-0.44 -1.14 -1.81 -1.95 -1.37 -0.58 0.04 0.54 0.63 0.82 0.81 0.73
0.25 -0.74 -1.33 -3.1 -3.18 -1.36 0.06 0.43 0.74 0.89 0.73 0.7
-0.02 0.25 -0.79 -1.41 -1.14 -0.83 -0.15 0.29 0.43 0.47 0.63 0.54
-0.47 -1.55 -3.95 -4.25 -2.05 -0.12 0.33 0.6 0.64 1.09 0.88 0.45
0.05 -0.15 -0.58 -0.91 -0.52 -0.05 0.21 0.34 0.09 0.34 0.33 0.24
0.66 -0.64 -1.23 -0.72 -1.27 -0.96 -0.02 0.46 0.61 0.52 0.31 0.32
-0.07 0.05 -0.15 -0.03 -0.11 -0.51 -0.26 0.04 0.12 0.27 0.19 0.28
-0.03 -0.37 -0.52 -0.93 -0.56 0.16 0.23 0.25 0.39 0.39 0.17 0.17
-0.37 -0.67 -0.69 -1.38 -1.17 -0.28 0.33 0.38 0.44 0.61 0.58 0.47
-0.17 -0.97 -1.26 -2.93 -2.69 -0.97 0.2 0.45 0.64 1.03 0.71 0.71
0.31 1.03 -1.36 -0.76 -0.17 -1.11 0.07 0.03 -0.42 -0.57 -0.81 1.22
0.43 0.6 -0.57 -0.69 0.15 -0.22 -0.35 -0.11 -0.56 0.09 0.31 0.23
0.2 0.42 -0.37 -0.89 -0.87 -0.5 -0.34 -0.19 0.29 0.58 0.17 0.52
-0.61 0.11 -0.1 -0.03 -0.37 -0.33 -0.02 0.04 0.26 0.42 0.19 0.13
-0.07 -0.72 -1.07 -2.08 -2.13 -1.16 -0.16 0.55 0.72 0.78 0.77 0.71
-0.27 -1.1 -1.92 -2.48 -0.75 -0.15 0.02 0.3 0.41 0.74 0.88 0.74
0.19 -0.03 -0.5 -0.92 -0.33 0.04 0.0 0.08 0.19 0.4 -0.04 0.42
0.22 -0.07 -0.35 -0.66 -0.62 -0.43 -0.21 0.21 0.28 0.5 0.38 0.17
0.57 0.17 -0.91 -4.54 -2.89 -1.27 -0.54 0.2 0.35 0.9 0.97 0.4
-0.75 -0.8 -1.85 -2.27 -1.1 -0.11 0.47 0.02 0.41 1.03 0.65 0.68
-0.04 -0.22 -0.66 -0.68 -0.39 -0.1 0.09 0.19 0.29 0.36 0.28 0.38
-0.37 -0.39 -0.13 -0.44 -0.08 0.19 0.28 0.04 0.33 0.2 0.09 0.01
0.02 -0.26 -0.92 -1.47 -0.48 -0.07 0.06 0.4 0.38 0.6 0.42 0.11
-0.43 -0.1 -0.49 -0.78 -0.48 -0.51 -0.2 -0.72 0.44 0.54 0.65 0.81
-0.32 0.11 -0.07 -0.01 -0.06 -0.47 -0.3 0.05 0.06 0.26 0.15 0.36
0.48 -0.06 -1.71 -2.05 -1.41 -0.77 0.2 0.22 0.78 0.79 0.42 0.06
0.44 0.01 -0.98 -1.43 -1.84 -1.39 0.08 0.57 0.58 0.78 0.32 0.12
0.49 0.21 -0.2 -0.84 -0.7 -0.63 -0.29 0.19 0.04 0.41 0.41 0.15
0.89 -0.13 -0.99 -2.42 -2.0 -0.77 -0.12 0.06 0.45 0.57 0.47 0.58
-0.19 -1.03 -1.08 -1.8 -0.94 -0.25 0.14 0.47 0.56 0.73 0.61 0.44
0.51 -0.16 -1.31 -2.04 -1.12 -0.45 -0.06 0.29 0.47 0.67 0.44 0.41
-0.08 -0.5 -0.75 -2.08 -1.86 -1.54 -0.38 0.32 0.77 0.86 0.72 0.77
0.86 0.1 -1.4 -1.72 -1.34 -1.07 -0.47 -0.2 -0.04 0.66 0.86 0.68
-0.3 -0.83 -1.95 -3.64 -2.24 -0.79 0.06 0.7 0.62 1.02 0.94 0.43
-0.15 -0.78 -1.25 -1.71 -0.6 0.2 0.21 0.43 0.48 0.6 0.48 0.21
0.02 -0.3 -0.52 -0.79 -0.33 -0.12 0.01 0.33 0.23 0.42 0.23 0.31
0.26 0.05 -0.62 -0.23 0.01 -0.2 0.25 -0.28 -0.34 0.19 0.11 0.45
0.47 -0.2 -0.57 -2.18 -1.61 -0.68 -0.09 0.38 0.41 0.6 0.55 0.43
0.43 -0.48 -0.87 -0.56 -0.96 -1.2 -0.38 0.49 0.52 0.53 0.46 0.42
-0.19 0.08 -0.36 -0.15 -0.15 -0.5 -0.35 -0.17 0.25 0.47 0.16 0.5
-0.05 -0.35 -0.7 -0.31 -0.64 -0.25 0.02 0.26 -0.07 0.41 0.33 0.67
-0.24 -0.22 -0.76 -2.02 -1.27 -0.47 -0.06 0.21 0.52 0.96 0.43 0.58
0.57 0.08 -0.7 -1.0 -1.16 -1.06 -0.51 0.43 0.27 0.4 0.61 0.4
0.05 -0.45 -0.42 -0.33 -0.41 -0.3 -0.08 0.07 0.19 0.33 0.42 0.48
0.29 -0.09 -1.01 -0.89 -0.43 -0.1 0.16 0.24 0.45 0.52 0.07 -0.04
-0.38 0.07 -0.59 -0.26 -0.22 -0.97 -0.1 -0.18 -0.09 0.36 0.5 0.89
-0.24 -1.24 -1.44 -2.46 -1.02 -0.05 0.46 0.36 0.68 0.77 0.5 0.42
-1.27 -1.31 -3.09 -2.63 -3.1 -1.25 0.59 0.19 0.5 0.67 1.24 1.23
-0.59 -1.19 -2.11 -3.09 -3.42 -1.65 -0.01 0.49 0.62 0.96 1.24 0.93
0.92 0.17 -1.07 -1.75 -1.13 -0.52 -0.2 0.15 -0.09 0.34 0.53 0.51
-0.45 -0.6 -1.11 -1.13 -0.58 -0.02 0.39 0.18 0.55 0.59 0.39 0.39
-1.11 -0.09 -0.36 -0.21 -0.7 -0.36 0.45 -0.04 0.4 0.62 0.12 0.34
-0.19 -0.39 -0.73 -1.15 -0.68 -0.52 -0.05 0.35 0.47 0.78 0.51 0.28
-0.26 0.14 -0.16 -0.45 -0.62 -0.49 0.06 0.16 0.37 0.53 0.19 0.05
0.82 0.34 -0.81 -1.15 -0.63 -0.38 -0.42 -0.09 -0.16 0.32 0.51 0.35
1.01 0.47 -1.98 -2.21 -1.93 -1.63 -0.72 -0.35 0.02 0.79 0.83 0.72
0.59 -0.04 -0.75 -1.21 -1.34 -0.52 -0.25 0.34 0.28 0.41 0.53 0.38
0.8 0.12 -2.63 -2.48 -1.24 -0.68 -0.67 -0.44 0.19 0.89 0.81 0.73
-0.16 -0.34 -0.49 -1.33 -1.38 -0.98 -0.74 0.26 0.18 0.6 1.08 0.81
0.06 0.06 -0.35 -0.47 -0.28 -0.19 -0.09 0.0 0.23 0.36 0.08 0.33
-0.06 -0.76 -1.12 -1.45 -1.21 -0.5 -0.25 0.13 0.39 0.87 0.8 0.75
0.15 -0.48 -1.3 -1.4 -0.28 0.11 0.19 0.04 0.45 0.5 0.36 0.33
-0.03 -0.28 -0.61 -0.65 -0.65 -0.17 0.19 0.24 0.35 0.45 0.3 0.24
-0.44 -0.54 -0.5 -0.62 -0.04 0.24 0.38 0.09 0.4 0.12 0.12 0.27
0.66 0.33 -1.39 -1.5 -1.1 -0.59 -0.05 -0.15 0.33 0.6 0.31 0.5
-0.7 -0.93 -1.0 -0.81 -0.89 -0.03 0.09 -0.08 0.26 0.98 0.56 0.69
0.52 -0.73 -2.42 -5.07 -4.24 -1.54 -0.08 0.4 0.78 1.18 0.73 0.52
-0.16 -0.37 -1.14 -1.65 -0.92 -0.59 0.02 0.2 0.56 0.88 0.45 0.6
0.56 0.37 -0.95 -2.85 -2.78 -2.01 -0.62 0.58 0.05 0.58 0.95 0.66
0.65 -0.4 -1.23 -1.22 -1.13 -0.88 -0.19 0.47 0.36 0.48 0.58 0.47
0.24 0.15 -0.67 -1.22 -1.11 -0.63 -0.1 0.31 0.53 0.77 0.09 0.22
0.36 -0.08 -0.29 -0.36 -0.22 -0.23 -0.24 0.11 0.04 0.12 0.29 0.26
0.21 -0.28 -0.67 -1.06 -0.49 -0.44 0.07 0.25 0.37 0.64 0.31 0.17
-0.27 -0.65 -0.67 -0.82 -0.83 -0.55 -0.05 0.04 0.36 0.68 0.47 0.87
-0.36 -0.06 -0.7 -1.34 -0.57 -0.29 0.24 -0.32 0.54 0.75 0.43 0.36
0.0 0.48 -0.93 -1.14 0.03 -0.44 0.2 -0.24 -0.17 0.14 0.24 0.76
0.19 -0.13 -0.46 -0.05 -0.16 0.23 -1.28 -0.41 -0.83 0.23 0.82 0.6
-0.47 -0.09 -0.64 -0.71 -0.41 -0.18 0.28 0.49 0.42 0.4 0.33 -0.12
0.03 -0.1 -0.35 -0.51 -0.15 0.13 0.0 -0.05 0.08 0.17 0.23 0.3
-0.47 -0.05 -0.15 0.27 -0.25 -1.11 -0.29 -0.41 0.08 0.3 0.44 0.75
0.35 0.54 -1.14 -1.14 0.15 -0.53 -0.19 -0.18 -0.19 0.1 0.47 0.55
-0.29 -0.5 -0.69 -0.82 -0.27 0.07 -0.01 0.0 0.32 0.72 0.29 0.37
-0.43 0.19 -0.66 -0.64 -0.48 -0.11 0.22 0.14 0.34 0.25 0.25 0.37
0.1 -0.8 -0.99 -1.33 -0.25 0.13 0.33 0.18 0.47 0.45 0.33 0.17
0.01 -0.06 -0.26 -0.33 -0.39 -0.32 -0.09 0.09 0.17 0.38 0.17 0.36
-0.35 -0.49 -1.78 -1.85 -0.96 -0.15 0.21 0.38 0.59 1.01 0.57 0.09
-0.32 -1.38 -1.59 -2.4 -1.74 -0.53 0.03 0.37 0.7 1.0 0.77 0.73
-0.17 -0.9 -1.72 -2.62 -1.62 -0.58 -0.28 0.42 0.7 0.92 0.74 0.81
-0.86 -0.45 -1.39 -1.48 -0.46 -0.19 -0.13 0.2 0.34 0.77 0.64 0.85
-2.58 -1.74 -1.79 -0.78 -0.27 -0.34 0.73 0.19 0.78 0.87 0.58 0.26
0.02 -0.43 -0.71 -0.82 -0.21 -0.14 -0.06 0.44 0.28 0.49 0.4 0.06
0.25 0.01 -1.08 -0.92 -2.28 -1.92 -0.27 0.48 0.64 1.15 0.33 0.09
-0.3 -0.51 -0.58 -0.63 -0.12 -0.1 -0.12 0.25 0.29 0.64 0.36 0.19
-0.0 -0.43 -1.25 -1.74 -1.46 -0.81 -0.07 0.32 0.47 0.88 0.65 0.69
-1.79 -2.04 -1.25 -2.15 -2.09 -0.83 0.61 0.43 0.65 0.99 0.92 0.76
0.48 -0.17 -0.9 -2.03 -1.97 -0.9 0.04 0.52 0.38 0.49 0.54 0.6
0.14 -0.38 -0.52 -1.41 -1.09 -0.4 0.07 0.44 0.47 0.55 0.41 0.31
-0.53 0.4 -1.34 -0.03 0.23 -1.23 -0.21 -0.46 -0.22 0.5 0.21 0.99
-0.39 -1.02 -1.79 -3.3 -2.99 -0.99 -0.11 0.19 0.71 1.1 1.08 0.81
0.24 0.11 -0.38 -0.34 -0.36 -0.16 -0.11 -0.09 0.04 0.05 0.2 0.51
0.63 1.0 -3.08 -1.32 0.49 -1.12 -1.52 -0.11 -2.3 -0.51 0.36 1.38
0.6 0.51 -1.49 -1.49 -0.68 0.54 -0.31 -0.87 -0.39 0.19 0.54 0.65
-0.12 -0.71 -0.83 -1.77 -0.96 -0.18 -0.1 0.61 0.39 0.61 0.73 0.35
-0.24 -0.68 -1.26 -1.74 -0.76 -0.38 0.1 0.34 0.38 0.84 0.7 0.49
0.94 0.29 -0.42 -1.49 -1.09 -0.47 -0.28 0.34 0.07 0.07 0.35 0.13
0.23 -0.29 -0.74 -1.42 -0.66 -0.17 0.01 0.19 0.35 0.58 0.34 0.43
0.58 -0.05 -0.44 -0.9 -0.89 -0.48 -0.08 0.26 0.27 0.29 0.36 0.21
-0.24 -0.37 -0.44 -0.93 -0.47 -0.08 0.19 0.35 0.42 0.57 0.18 0.12
0.19 -0.0 -0.47 -1.08 -1.07 -0.53 -0.11 0.05 0.38 0.62 0.44 0.43
-0.22 0.07 -1.16 -1.67 -1.09 -0.33 0.17 -0.11 0.34 0.88 0.37 0.69
0.43 -0.25 -1.43 -1.66 -1.04 -1.0 -0.07 0.44 0.58 0.63 0.66 0.28
-0.12 -0.38 -1.01 -2.06 -1.65 -1.28 -0.37 0.24 0.51 0.91 1.04 0.61
0.6 -0.72 -1.67 -3.93 -3.1 -1.26 -0.07 0.66 0.48 0.82 0.78 0.64
0.88 -0.1 -1.6 -2.75 -3.27 -1.96 -0.1 -0.4 0.34 0.69 0.68 1.15
0.81 0.35 -0.3 -1.35 -1.13 -0.72 -0.26 0.4 0.02 0.23 0.4 0.06
0.09 -0.45 -1.45 -3.36 -2.21 -0.47 0.13 0.33 0.73 0.77 0.6 0.66
-0.27 -1.07 -1.95 -3.01 -1.45 -0.24 0.07 0.67 0.41 0.74 1.03 0.49
0.64 0.11 -0.96 -1.21 -0.88 -0.83 -0.43 -0.27 0.1 0.45 0.56 0.87
0.35 -0.24 -2.06 -1.27 -0.39 -0.14 0.62 0.3 -0.18 -0.17 0.61 0.57
0.02 0.07 -1.26 -0.83 -0.41 0.1 0.38 -0.03 -0.27 0.26 0.49 0.5
0.33 -0.58 -0.84 -1.15 -1.2 -0.65 0.15 0.18 0.49 0.44 0.52 0.63
-0.08 -0.28 -0.86 -0.8 -0.1 -0.83 -0.12 0.1 0.02 0.38 0.55 0.87
-0.02 -0.23 -1.34 -1.68 -0.86 0.19 0.32 0.16 0.36 0.56 0.4 0.41
- -0.49 -1.04 -1.49 -0.72 -0.39 0.5 -0.68 0.74 1.18 0.49 0.76
-0.06 -0.95 -1.61 -2.9 -1.26 -0.23 0.5 0.65 0.8 0.69 0.61 -0.08
0.18 -1.17 -2.04 -1.92 -1.1 -0.03 0.51 0.66 0.48 0.73 0.5 -0.0
0.06 -0.17 -1.26 -1.75 -1.63 -0.73 -0.03 0.48 0.6 0.89 0.52 0.31
-0.73 -0.58 -1.42 -0.8 -0.12 0.19 0.38 -0.01 0.29 0.78 0.26 0.36
0.36 0.12 -0.61 -0.98 -0.93 -0.67 -0.38 -0.33 0.15 0.55 0.62 0.72
-0.72 -0.69 -0.55 -0.51 -0.64 -0.28 0.08 -0.12 0.56 0.66 0.36 0.68
-0.16 -0.25 -0.73 -0.66 -0.01 0.17 0.02 0.09 0.24 0.42 0.23 0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.