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Heatmap: Cluster_3 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.5 0.56 0.37 0.16 0.21 0.13 -0.19 0.05 -0.54 -0.68 -0.63 -0.76
0.3 0.33 0.63 1.0 0.49 -0.41 -0.55 -0.34 -1.22 -1.02 -0.65 -0.38
1.18 0.4 0.01 1.07 0.19 -0.89 -0.7 -0.56 -1.35 -0.82 -0.69 -0.41
0.18 0.27 0.33 0.3 0.51 0.21 -0.32 -0.89 -0.77 -0.51 -0.23 0.14
0.09 0.59 0.51 0.13 0.37 0.27 0.27 0.32 -0.53 -1.01 -1.36 -1.36
-0.25 0.35 0.23 0.18 0.35 0.2 0.1 0.14 -0.48 -0.27 -0.65 -0.33
-0.74 -0.1 -0.57 -0.11 1.37 1.15 -0.08 -0.19 -0.79 -0.87 -0.76 -0.92
-0.14 0.12 -0.01 0.02 0.24 0.19 0.35 0.19 0.05 -0.28 -0.42 -0.63
0.08 0.35 0.56 0.26 0.36 0.43 0.2 0.03 -0.33 -0.75 -1.29 -1.36
0.15 0.08 -0.07 0.09 0.22 0.11 -0.09 -0.17 0.0 -0.05 -0.4 0.02
-0.0 0.1 0.13 0.18 0.14 0.13 -0.11 0.12 -0.18 -0.32 -0.2 -0.09
-0.36 -0.03 0.18 0.09 0.08 0.13 0.21 0.28 -0.02 -0.2 -0.26 -0.27
0.21 0.15 0.17 0.07 0.17 0.14 -0.06 -0.01 -0.13 -0.25 -0.3 -0.32
0.18 0.31 0.33 0.13 0.24 0.14 -0.1 -0.04 -0.17 -0.35 -0.56 -0.44
-0.53 0.06 0.26 -0.08 -0.08 0.39 0.37 0.41 -0.07 -0.34 -0.51 -0.31
-0.19 0.16 0.12 0.17 0.58 0.44 -0.15 -0.39 -0.42 -0.15 -0.28 -0.3
0.02 0.29 0.2 0.24 0.11 -0.07 0.04 0.01 -0.24 -0.38 -0.21 -0.17
0.11 0.17 0.22 0.26 0.22 0.2 -0.1 0.11 -0.13 -0.25 -0.43 -0.7
0.11 0.29 0.09 0.23 0.22 0.09 -0.17 -0.15 -0.21 -0.15 -0.13 -0.38
0.32 0.25 0.04 0.22 0.14 0.14 -0.02 -0.05 -0.09 -0.57 -0.36 -0.28
1.12 0.56 0.32 1.27 0.84 -0.43 -1.04 -1.11 -2.42 -1.7 -1.59 -1.35
0.05 0.16 0.32 0.21 -0.07 -0.28 -0.14 0.15 -0.16 -0.26 -0.03 -0.09
0.64 0.53 0.84 0.89 0.31 -0.13 -0.3 -0.66 -1.29 -1.61 -1.13 -0.85
0.2 0.28 0.25 0.57 0.14 -0.02 -0.13 -0.38 -0.16 -0.41 -0.54 -0.2
1.14 0.36 0.17 1.02 0.25 -1.18 -0.79 -0.77 -1.09 -0.67 -0.59 -0.31
0.84 0.28 0.06 -0.07 -0.04 0.19 0.12 0.21 -0.08 -0.69 -0.76 -1.0
-0.46 0.07 -0.35 0.11 1.23 0.96 -0.17 -0.47 -0.62 -0.51 -0.99 -0.73
0.44 0.51 0.43 0.1 0.04 0.09 0.18 0.1 -0.46 -0.89 -0.79 -0.62
0.12 0.37 0.43 0.5 0.65 0.12 -0.73 -0.84 -0.9 -0.6 -0.27 0.03
- 1.07 -0.08 -1.06 1.25 1.1 -0.01 0.09 -1.19 -1.12 - -0.0
0.79 0.58 -0.0 0.15 0.22 -0.26 0.38 -0.41 -0.58 -0.38 -0.61 -0.96
0.92 -0.8 -0.29 -0.0 -1.47 -0.33 0.78 0.51 0.48 0.39 -1.32 -1.67
- 0.82 - - 1.02 1.83 - - - - - 2.22
0.06 0.3 0.43 0.61 0.81 0.32 -0.66 -0.89 -1.07 -0.92 -0.46 -0.09
0.22 0.22 0.43 0.43 0.39 0.22 -0.36 -0.81 -0.77 -0.59 -0.22 0.06
-0.45 0.27 -0.11 -0.25 0.13 0.12 0.33 -0.29 -0.03 -0.07 -0.05 0.2
-0.2 0.03 0.25 -0.18 0.11 0.19 0.01 -0.1 0.03 0.02 -0.07 -0.16
1.38 0.66 -0.12 0.35 0.02 0.03 0.22 0.77 -1.27 -3.35 -3.31 -3.13
0.35 0.24 0.27 -0.06 0.01 0.16 -0.11 -0.02 -0.12 -0.22 -0.34 -0.35
0.93 -0.56 -0.68 0.25 0.61 0.47 0.09 -0.35 -0.28 -0.54 -0.87 -0.36
-0.29 0.23 0.12 0.01 0.18 0.13 0.08 -0.26 -0.05 -0.06 -0.15 -0.04
0.09 0.17 0.17 0.17 0.07 0.06 -0.13 0.03 -0.15 -0.17 -0.17 -0.23
-0.76 0.15 0.06 0.13 0.14 0.61 0.04 -0.05 0.03 -0.29 -0.26 -0.23
0.19 0.43 0.44 0.18 0.13 0.02 0.11 0.23 -0.5 -0.72 -0.47 -0.66
0.3 0.22 0.12 -0.13 -0.19 0.44 0.27 -0.01 -0.29 -0.27 -0.4 -0.38
0.24 -0.04 -0.05 -0.18 0.04 0.3 0.25 -0.1 -0.09 -0.15 -0.24 -0.1
-0.09 0.26 0.63 0.17 0.09 -0.02 0.23 0.27 -0.26 -0.73 -0.69 -0.51
-0.25 0.38 0.54 0.54 0.41 0.24 -0.05 -0.21 -0.9 -0.65 -0.6 -0.35
0.0 0.45 0.31 0.22 0.1 -0.0 0.05 0.03 -0.1 -0.43 -0.41 -0.55
-0.29 0.63 0.6 0.47 -0.03 -0.53 -0.17 0.21 -0.08 -0.51 -0.56 -0.54
0.27 0.35 0.38 0.39 0.4 0.12 -0.53 -0.84 -0.73 -0.53 -0.22 0.13
0.34 0.54 0.22 0.17 0.31 0.09 -0.26 0.13 -0.33 -0.42 -0.69 -0.74
0.22 0.43 0.4 0.36 0.41 0.15 -0.36 -0.64 -0.55 -0.53 -0.46 -0.12
0.16 0.21 0.24 0.16 0.5 0.4 -0.07 -0.13 -0.56 -0.54 -0.52 -0.35
-0.3 0.51 0.67 0.41 0.37 0.38 -0.17 0.17 -0.64 -1.45 -0.86 -0.57
0.05 0.5 0.43 0.38 0.41 0.4 0.02 0.31 -0.6 -1.19 -1.09 -1.19
-0.1 0.14 0.06 -0.43 0.1 0.19 0.17 0.06 -0.14 -0.07 -0.09 0.01
-0.01 0.14 0.31 0.22 0.33 0.5 -0.06 -0.15 -0.26 -0.53 -0.6 -0.34
0.03 -1.1 -0.43 -0.34 0.45 0.35 0.27 0.86 -0.43 -0.6 -1.13 0.55
0.23 0.28 0.33 0.2 0.2 -0.2 -0.29 -0.13 -0.14 -0.22 -0.34 -0.16
-0.76 0.26 0.39 -0.13 0.04 0.24 0.35 0.33 -0.33 -0.27 -0.27 -0.35
0.12 0.32 0.05 -0.09 0.17 0.23 0.19 -0.37 0.36 -0.16 -0.51 -0.69
0.24 0.32 0.21 0.09 0.34 0.43 0.3 0.15 -0.22 -0.67 -0.97 -1.32
0.52 1.07 0.51 1.33 0.95 -0.94 -1.14 -1.31 -1.84 -1.35 -1.84 -1.94
0.21 0.31 0.42 0.35 0.43 0.15 -0.44 -0.93 -0.77 -0.53 -0.2 0.16
-0.08 0.39 0.73 1.49 -0.0 -0.81 -0.54 -1.85 -1.25 -1.15 -0.25 0.05
-0.08 0.16 0.37 0.4 0.7 0.2 -0.6 -0.74 -0.77 -0.48 -0.14 0.11
0.88 0.96 0.21 0.36 0.72 -0.17 -0.38 -1.11 -0.59 -0.79 -1.62 -1.2
1.09 0.13 0.28 0.34 0.28 -0.0 -0.04 -0.06 -1.41 -0.91 -0.77 -0.62
1.0 0.38 0.27 0.71 0.4 -0.38 -0.47 -0.79 -1.34 -1.19 -0.49 -0.1
1.37 0.53 0.59 0.82 0.34 -0.42 -0.72 -0.81 -2.22 -1.47 -1.24 -1.0
0.14 0.17 0.11 0.01 -0.21 0.05 0.17 -0.0 0.12 -0.16 -0.37 -0.14
1.43 0.53 0.74 0.96 0.17 -0.7 -0.87 -0.92 -2.32 -1.63 -1.25 -1.02
0.1 0.32 0.35 0.14 0.05 0.19 0.02 0.11 -0.3 -0.48 -0.37 -0.45
0.21 0.23 0.3 0.26 0.47 0.17 -0.38 -0.73 -0.64 -0.46 -0.21 0.17
0.01 0.0 0.08 -0.38 -0.04 -0.01 0.14 -0.02 0.21 0.14 -0.16 -0.05
0.08 0.29 0.09 0.34 0.3 0.16 -0.12 -0.25 -0.12 -0.23 -0.6 -0.24
-0.67 0.19 0.36 -0.02 0.05 0.33 -0.19 -0.18 -0.18 0.01 0.0 0.04
1.03 0.29 0.09 0.57 0.1 -0.62 -0.93 -0.5 -0.88 -0.44 -0.09 0.04
0.11 0.18 0.17 0.39 0.34 0.13 -0.14 -0.13 -0.3 -0.26 -0.47 -0.3
0.28 -0.04 0.05 0.21 0.22 -0.23 0.01 -0.02 -0.04 -0.19 -0.2 -0.18
0.06 0.16 0.2 0.07 0.06 0.05 -0.01 -0.04 0.09 -0.15 -0.31 -0.26
-0.35 0.23 0.17 0.23 0.31 0.16 -0.08 -0.21 -0.08 -0.05 -0.4 -0.16
0.02 0.41 0.03 -0.08 0.51 0.26 -0.01 -0.44 -0.21 -0.18 -0.51 -0.15
0.22 0.53 0.27 0.19 0.36 0.07 -0.15 0.03 -0.23 -0.56 -0.67 -0.67
-0.78 -0.16 -0.05 -0.23 1.31 1.22 -0.26 -0.57 -0.45 -0.99 -0.7 -0.89
0.55 0.37 0.21 -0.14 0.13 0.32 0.04 -0.07 -0.21 -0.46 -0.77 -0.57
0.24 0.44 0.35 0.07 0.12 0.15 -0.06 0.06 -0.26 -0.47 -0.45 -0.6
1.06 0.03 0.28 0.14 -0.28 0.26 -0.01 0.11 -0.21 -0.64 -1.14 -0.95
-0.7 0.04 -0.65 0.44 1.53 1.22 -0.26 -1.17 -1.43 -1.32 -1.3 -0.52
0.27 0.48 0.42 0.28 0.47 -0.06 -0.84 -0.73 -0.67 -0.4 -0.19 0.12
- -0.61 - - 0.59 1.09 0.75 0.9 0.7 -0.32 - 0.78
0.02 0.0 -0.1 0.09 0.35 0.21 -0.0 -0.08 -0.17 -0.16 -0.21 -0.06
0.16 0.16 0.21 0.15 0.14 0.3 0.16 0.18 -0.06 -0.46 -0.63 -0.8
-0.01 -0.09 0.03 0.03 0.17 0.23 0.46 0.19 -0.0 -0.32 -0.57 -0.41
-0.29 0.06 -0.62 0.22 1.31 0.82 0.01 -0.36 -0.67 -0.67 -1.16 -0.74
- - - - 1.77 1.74 -0.21 0.71 - - -0.4 1.0
0.63 0.5 0.44 0.45 0.64 0.22 -0.42 -0.18 -0.81 -1.17 -1.21 -0.95
0.42 -0.03 0.13 0.04 0.09 0.33 0.29 0.25 -0.36 -0.69 -0.78 -0.26
-2.47 0.56 0.08 -1.29 -0.15 0.83 0.67 -0.57 -0.32 0.34 -0.46 0.2
0.24 0.39 0.26 0.22 0.14 0.12 -0.16 0.05 -0.18 -0.37 -0.42 -0.67
-0.47 -0.3 -0.01 -0.03 0.39 0.39 0.03 0.22 -0.2 -0.65 0.03 0.21
0.65 0.3 0.23 0.42 0.69 0.18 -0.66 -0.51 -0.89 -0.66 -0.54 -0.4
-0.1 0.2 0.2 -0.29 0.25 0.51 0.02 -0.22 -0.22 -0.06 -0.46 -0.13
0.03 0.34 0.38 0.04 0.17 0.2 -0.09 0.25 -0.27 -0.38 -0.49 -0.56
-0.53 0.06 -0.35 -0.02 1.36 1.12 -0.19 -0.35 -1.04 -0.87 -0.91 -0.92
0.37 0.25 0.04 -0.01 0.21 0.3 -0.13 -0.25 -0.49 -0.08 -0.44 -0.08
0.78 0.31 0.38 0.61 0.58 -0.25 -0.63 -0.46 -0.77 -1.08 -0.43 -0.48
-0.34 0.48 0.77 1.04 0.39 -0.46 -0.57 -0.35 -0.71 -1.03 -0.62 -0.35
-0.22 0.62 -0.71 -0.48 -1.6 0.62 0.34 -0.08 -0.68 -0.15 -0.55 0.99
-0.37 -0.01 -0.56 0.01 1.41 0.99 0.01 -0.47 -1.0 -0.83 -0.97 -0.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.